Secuenciación del genoma completo por bisulfito (WGBS)
Esta técnica, basada en el tratamiento del ADN con bisulfito para inducir la conversión de citosinas no metiladas en uracilo (C a U), mientras deja las citosinas metiladas sin cambios, se erige como la metodología estándar de oro para la exploración en profundidad de la metilación del ADN, específicamente la quinta posición de la citosina (5-mC), un regulador fundamental de la expresión genética y la actividad celular.
Esta técnica ofrece una resolución de base única, lo que permite a los investigadores investigar exhaustivamente el metiloma y descubrir patrones de metilación anormales en las muestras. Mediante WGBS, los científicos pueden obtener información sin precedentes sobre los paisajes de metilación de todo el genoma, lo que proporciona una comprensión detallada de los mecanismos epigenéticos que subyacen a diversos procesos biológicos y enfermedades.
Características del servicio
● Secuenciación en Illumina NovaSeq.
● Requiere un genoma de referencia.
● Se agrega ADN Lambda para monitorear la eficiencia de conversión de bisulfito.
Ventajas del servicio
●Estándar de oro para la investigación sobre la metilación del ADN:Esta tecnología madura tiene alta precisión y buena reproducibilidad.
●Amplia cobertura y resolución de base única:La detección de sitios de metilación se realiza a nivel de todo el genoma.
●Plataforma completa:Ofrecemos un servicio integral desde el procesamiento de muestras, la construcción de bibliotecas y la secuenciación hasta el análisis bioinformático.
●Amplia experienciaContamos con una amplia gama de proyectos realizados en una amplia gama de especies. BMKGENE aporta más de una década de experiencia, un equipo de análisis altamente capacitado, contenido completo y un excelente servicio posventa.
●Posibilidad de unirse al análisis transcriptómico:Permite el análisis integrado de WGBS con otros datos ómicos como RNA-seq.
Especificaciones de muestra
| Biblioteca | Estrategia de secuenciación | Salida de datos recomendada | Control de calidad |
| Tratado con bisulfito | Illumina PE150 | 30x de profundidad | Q30 ≥ 85% Conversión de bisulfito > 99% |
Requisitos de muestra
| Concentración (ng/µL) | Cantidad total (µg) | Requisitos adicionales | |
| ADN genómico | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Degradación o contaminación limitada |
Flujo de trabajo del servicio
Entrega de muestra
Extracción de ADN
Construcción de bibliotecas
Secuenciación
Análisis de datos
Entrega de datos
El servicio incluye el siguiente análisis:
● Control de calidad de la secuenciación bruta;
● Mapeo al genoma de referencia;
● Detección de bases metiladas de 5mC;
● Análisis de la distribución y anotación de la metilación;
● Análisis de regiones diferencialmente metiladas (DMR);
● Anotación funcional de genes asociados a DMR.
Detección de metilación de 5mC: tipos de sitios metilados
Mapa de metilación. Distribución de la metilación de 5mC en todo el genoma.
Anotación de regiones altamente metiladas
Regiones metiladas diferencialmente: genes asociados
Regiones metiladas diferencialmente: anotación de genes asociados (Ontología genética)
Explore los avances de investigación facilitados por los servicios de secuenciación de bisulfito del genoma completo de BMKGene a través de una colección seleccionada de publicaciones.
Fan, Y. et al. (2020) 'Análisis de los perfiles de metilación del ADN durante el desarrollo del músculo esquelético de las ovejas utilizando secuenciación de bisulfito del genoma completo',Genómica de BMC, 21 (1), págs. 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Nuevas perturbaciones de la metilación del ácido desoxirribonucleico en trabajadores expuestos al cloruro de vinilo',Toxicología y Salud Industrial, 38 (7), págs. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Relaciones entre la metilación del genoma, los niveles de ARN no codificantes, ARNm y metabolitos en la maduración del fruto del tomate',El diario de las plantas, 103(3), págs. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
