TsircRNA järjestus-illumina
Omadused
● RRNA kahanemine, millele järgneb suunaraamatukogu ettevalmistamine, võimaldades ahelaspetsiifilisi järjestamisandmeid.
● Bioinformaatiline töövoog võimaldab tsircRNA ennustamist ja ekspressiooni kvantifitseerimist
Teenuse eelised
●Põhjalikumad RNA raamatukogud:Me kasutame rRNA kahanemist, selle asemel, et lineaarset RNA kahanemist oma lõpseelses preparaadis, tagades, et sekveneerimise andmed hõlmavad mitte ainult tsircRNA, vaid ka mRNA ja LncRNA, võimaldades nende andmekogumite ühist analüüsi
●Konkurentsivõimelise endogeense RNA (CERNA) võrkude valikuline analüüs: Pakkudes sügavamaid ülevaate raku regulatiivsetest mehhanismidest
●Ulatuslik teadmine: Kuna BMKGENE -s, mitmekesiste proovide ja LNCRNA projektide hõlmav üle 20 000 proovi töötlemise kogemus, toob meie meeskond igasse projekti hulga kogemusi.
●Range kvaliteedikontroll. See hoolikas seire tagab pidevalt kvaliteetsete tulemuste kohaletoimetamise.
● müügijärgne tugi: Meie pühendumus ulatub kaugemale projekti lõpuleviimisest 3-kuulise müügijärgse teenindusperioodiga. Selle aja jooksul pakume projekti järelmeetmeid, tõrkeotsingu abi ja küsimuste ja vastuste seansse tulemustega seotud päringute lahendamiseks.
Proovi nõuded ja kohaletoimetamine
| Raamatukogu | Platvorm | Soovitatavad andmed | Data QC |
| rRNA ammendatud suunaraamatukogu | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30 ≥85% |
Proovide nõuded:
Nukleotiidid:
| Konts (ng/μl) | Kogus (μg) | Puhtus | Terviklikkus |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Geelil näidatud piiratud või puudub valk või DNA saastumine. | Rin≥6,0; 5,0 ≥28S/18S≥1,0; Piiratud või puudub algtaseme kõrgus |
● Taimed:
Juur, vars või kroonlehe: 450 mg
Leht või seeme: 300 mg
Puu: 1,2 g
● Loom:
Süda või sool: 450 mg
Siseelundite või aju: 240 mg
Lihas: 600 mg
Luud, juuksed või nahk: 1,5 g
● lülijalgsed:
Putukad: 9G
Crustacea: 450 mg
● Terve veri:2 toru
● Rakud: 106 rakud
● Seerum ja plasma: 6 ml
Soovitatav proovi kohaletoimetamine
Konteiner: 2 ml tsentrifuugitoru (tinafooliumi ei soovitata)
Proovide märgistamine: rühm+kopeerige nt A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Saadetis:
1. Kuiv-jää: proovid tuleb pakkida kottidesse ja matta kuiva jää.
2. RNABABLE torud: RNA -proove saab kuivatada RNA stabiliseerimistorus (nt RNAstanble®) ja viia toatemperatuuril.
Teeninduse töövool
Katse kavandamine
Proovi kohaletoimetamine
RNA ekstraheerimine
Raamatukogu ehitamine
Sekveneerimine
Andmeanalüüs
Müügijärgsed teenused
Bioinformaatika
CircrNA ennustus: kromosomaalne jaotus
Diferentseeritult ekspresseeritud tsircRNA -d - vulkaanide graafik
Diferentseeritult ekspresseeritud tsircRNA -d - hierarhiline rühmitamine
CircRNA peremeesgeenide funktsionaalne rikastamine
Tutvuge BMKGENE 'CircRNA järjestamisteenuste abil kureeritud väljaannete kogumise kaudu.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 reguleerib tsircRNA moodustumist ja mikroRNA vahendatud geeni vaigistamist hepatotsellulaarses kartsinoomis', onkogeen 2021 40:25, 40 (25), lk 4338–4351. doi: 10.1038/S41388-021-01867-6.
Xia, K. jt. (2023) 'x oo-reageeriv transkriptoom näitab ümmarguse RNA133 rolli haiguste resistentsuses, reguleerides Osarabi ekspressiooni riisis', fütopatoloogiauuringud, 5 (1), lk 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/joonised/6.
Y, H. jt. (2023) „CPSF3 moduleerib hepatotsellulaarse kartsinoomi ümmarguste ja lineaarsete transkriptide tasakaalu”. doi: 10.21203/Rs.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. jt. (2023) „CircRNA -de põhjalik hindamine tsirrootilise kardiomüopaatia korral enne ja pärast maksa siirdamist”, rahvusvaheline immunofarmakoloogia, 114, lk. 109495. Doi: 10.1016/J.intImp.2022.109495.
