BMKCloud Log in
条形bänner-03

Tooted

Illumina ja BGI

Illumina sekveneerimistehnoloogia, mis põhineb Sequencing by Synthesis (SBS) meetodil, on ülemaailmselt omaks võetud NGS-i innovatsioon, mis vastutab enam kui 90% maailma sekveneerimisandmete genereerimise eest.SBS-i põhimõte hõlmab iga dNTP lisamisel fluorestsentsmärgistatud pöörduvate terminaatorite pildistamist ja seejärel lõhustamist, et võimaldada järgmise aluse lisamist.Kui igas sekveneerimistsüklis on kõik neli pöörduvat terminaatoriga seotud dNTP-d, minimeerib loomulik konkurents inkorporeerimise kõrvalekaldeid.See mitmekülgne tehnoloogia toetab nii ühe lugemisega kui ka paarisotsaga raamatukogusid, mis pakuvad erinevaid genoomirakendusi.Illumina sekveneerimise suure läbilaskevõime ja täpsus asetavad selle genoomikauuringute nurgakiviks, andes teadlastele võimaluse genoomide keerukusest võrreldamatu detaili ja tõhususega lahti harutada.

BGI välja töötatud DNBSEQ on veel üks uuenduslik NGS-tehnoloogia, mis on suutnud järjestuse kulusid veelgi vähendada ja läbilaskevõimet suurendada.DNBSEQ raamatukogude ettevalmistamine hõlmab DNA fragmenteerimist, ssDNA valmistamist ja veereva ringi amplifikatsiooni, et saada DNA nanopallid (DNB).Seejärel laaditakse need tahkele pinnale ja sekveneeritakse kombinatoorse sondi-ankru sünteesi (cPAS) abil.

Meie eelvalmistatud raamatukogude sekveneerimisteenus hõlbustab klientidel erinevatest allikatest (muu hulgas mRNA, kogu genoom, amplikon) oma sekveneerimisraamatukogude ettevalmistamist.Seejärel saab need teegid saata meie sekveneerimiskeskustesse kvaliteedikontrolliks ja Illumina või BGI platvormidel järjestamiseks.


Teenuse üksikasjad

Demo tulemus

Funktsioonid

Platvormid:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten ja BGI-DNB-T7

Järjestusrežiimid:PE50, PE100, PE150, PE250

Teekide kvaliteedikontroll enne sekveneerimist

Andmete edastamise ja kvaliteedikontrolli järjestamine:QC aruande ja töötlemata andmete edastamine fastq-vormingus pärast demultipleksimist ja Q30 lugemiste filtreerimist.

 

Teenuse eelised

Järjestusteenuste mitmekülgsus:klient võib valida järjestuse raja, voolahtri või andmehulga järgi.

Platvormide mitmekülgsus:DNB teeke saab üle kanda Illumina platvormidele

Laialdased kogemused Illumina sekveneerimisplatvormil:tuhandete suletud projektidega erinevate liikidega. 

Järjestuse kvaliteedikontrolli aruande kohaletoimetamine:kvaliteedimõõdikute, andmete täpsuse ja järjestusprojekti üldise jõudlusega.

Küpse järjestusprotsess:lühikese pöördeajaga.

Range kvaliteedikontroll: rakendame rangeid kvaliteedikontrolli nõudeid, et tagada püsivalt kvaliteetsete tulemuste saavutamine.

Näidisnõuded*

Osaline sõiduradade järjestus

Andmemaht (X)

Kontsentratsioon (qPCR/nM)

Helitugevus

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Üks sõidurada (Illumina)

Platvorm

Kontsentratsioon (qPCR/nM)

Helitugevus

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Lisaks kontsentratsioonile ja üldkogusele on vajalik ka sobiv piigi muster.

 

Kui teie proovid ei vasta lähtematerjali nõuetele, võtke meiega ühendust.

Teeninduse töövoog

proovi ettevalmistamine

Raamatukogu kvaliteedikontroll

Järjestus

Järjestus

Andmete analüüs

Andmete kvaliteedi kontroll

QC näidis

Projekti tarnimine


  • Eelmine:
  • Järgmine:

  • Raamatukogu kvaliteedikontrolli aruanne

    Aruanne raamatukogu kvaliteedi kohta esitatakse enne järjestamist, raamatukogu hulga ja killustatuse hindamist.

     

    Järjestuse kvaliteedikontrolli aruanne

     

    Tabel 1. Järjestusandmete statistika.

    Näidis ID

    BMKID

    Toores lugemine

    Toorandmed (bp)

    Puhtad lugemised (%)

    Q20 (%)

    K30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96,48

    99.14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4 415 360 100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Joonis 1. Kvaliteedi jaotus igas proovis

    A9

    Joonis 2. Põhisisu jaotus

    A10

    Joonis 3. Loetud sisu jaotus sekveneerimisandmetes

    A11

     

    saada hinnapakkumist

    Kirjutage oma sõnum siia ja saatke see meile

    Saada meile oma sõnum: