Tooted

DNA/RNA sekveneerimine – nanopooride sekveneerija

DNA/RNA sekveneerimine – nanopooride sekvenaatoriga esiletoodud pilt

ONT sekveneerimine on ühe molekuli reaalajas elektrisignaalide sekveneerimise tehnoloogia, mis põhineb nanopooridel, iga platvormi järjestuspõhimõte on sama.Kaheahelaline DNA/RNA seondub biokile sisseehitatud nanopoorse valguga, mis kerib end lahti motoorse valgu juhtimisel, biokile mõlemalt küljelt tuleva pingeerinevuse toimel läbivad DNA/RNA ahelad nanopooride kanali valku teatud kindlal hetkel. määra.DNA/RNA ahela erinevate aluste keemiliste omaduste erinevuse tõttu põhjustab ühe aluse või DNA molekuli nanopooride kanali läbimine erinevate elektriliste signaalide muutumise.Neid signaale tuvastades ja neile vastates saab arvutada vastavad baastüübid ning lõpule viia jada reaalajas tuvastamise.

Võta meiega ühendust

Teenuse üksikasjad

Demo tulemus

Teenuse üksikasjad Funktsioonid

Platvorm	Raamatukogu suurus	Teoreetiline andmemaht (raku kohta)	Ühe aluse täpsus	Rakendused
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, ülipikk, cDNA-PCR	70-90 Gb / mobiil	85-92%	SV kutsumine, de novo, täispikk sekveneerimine, Iso-Seq, geeniannotatsioon, DNA metüülimise tuvastamine

Teenuse eelised

● Üle 5-aastane kogemus PacBio sekveneerimisplatvormil tuhandete suletud projektidega erinevate liikidega.
● BMKGENE on Oxford Nanopore'i ametlik partner, millel on kahe platvormi RNA/DNA sertifikaat.
● On olemas täieliku varustuse ja piisava järjestuse läbilaskevõimega sekvenaatorite tavamudelid.
● Nanopore'i platvormi põhjal on rahvusvaheliselt tunnustatud ajakirjades avaldatud üle 10 Denovo loomade ja taimede uurimistöö.

Näidisnõuded

Proovi tüüp

Summa

Kontsentratsioon (Qubit ®)

Helitugevus

Puhtus

teised

Genoomne DNA

Olenevalt andmenõudest

≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Selge tipp 260 nm juures, saaste puudub

Kontsentratsiooni tuleb mõõta Qubit ja Qubit/Nanopore ≤ 2 abil

Kogu RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；saaste puudub

RIN väärtus ≥7,5

Teeninduse töövoog

Proovi ettevalmistamine

Raamatukogu ehitus

Järjestus

Andmete analüüs

Projekti tarnimine

Eelmine: DNA/RNA sekveneerimine – Illumina järjestusseade

Järgmine: Spetsiifilise lookusega võimendatud fragmentide järjestus (SLAF-Seq)

DNA proovi andmete kvaliteedi hindamine

Tabel 1. Puhaste andmete statistika.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	puhasN50Len	puhasN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143 181	9