GWAS

Genoomiülese assotsiatsiooniuuringu (GWAS) eesmärk on tuvastada lookusi, mis on seotud spetsiifiliste tunnuste või fenotüüpidega, millel on sageli majanduslik või inimtervise tähtsus. BMKCloud GWAS-i torujuhtmed vajavad tuvastatud genoomsete variantide ja fenotüüpiliste variatsioonide loendit. Pärast fenotüüpide ja genotüüpide kvaliteedikontrolli rakendatakse assotsiatsioonianalüüsi tegemiseks erinevaid statistilisi mudeleid. Torujuhtme hõlmab ka populatsiooni struktuuri analüüsi, seostuse tasakaalustamatuse analüüsi ja suguluse hindamist.