Kogu genoomi bisulfiidi sekveneerimine
Teenuse eelised
● Täielik platvorm: pakkuge ühtset suurepärast teenust alates proovide töötlemisest, raamatukogu ehitamisest, järjestamisest kuni bioinformaatika analüüsini.
● Kõrge täpsus: küps metüülimise muundamise töötlemise tehnoloogia suudab täpselt analüüsida ühe C-aluse metüülimise olekut.
● Lai katvus: metüülimiskohtade tuvastamine kogu genoomi tasandil.
● Hea korratavus: stabiilne töötlemine, sobib mitme proovi võrdlevaks analüüsiks.
Näidiste spetsifikatsioonid
|
Platvorm
|
Loe pikkus
|
Järjestusstrateegia
|
| Illumina | PE 150 | 30X, kolm bioloogilist replikatsiooni, kvaliteetse võrdlusgenoomiga |
Näidisnõuded
|
Proovi tüüp
|
Kogus (μg)
|
Konts.(ng/μl)
|
Maht (μl)
|
Puhtus
|
| gDNA | ≥ 2 | ≥ 20
| ≥ 20
| Piiratud lagunemine ja saastumine
|
Teeninduse töövoog
Näidiste kohaletoimetamine
DNA ekstraheerimine
Raamatukogu ehitus
Järjestus
Andmete analüüs
Andmete edastamine
Bioinformaatika
1.Genoomi hõlmav DNA metüülimise jaotus
2. Annotatsioon kõrgelt metüleeritud CGI piirkonna kohta
