Kromatinaren Immunoprezipitazio Sekuentziazioa (ChIP-seq)
Zerbitzuaren abantailak
●Bioinformatika Analisi Aurreratua eta Anotazio Integrala:Hainbat datu-base erabiltzen ditugu proteina-DNA lotura-eskualdeekin lotutako geneak funtzionalki anotatzeko, elkarrekintzaren oinarrian dauden prozesu zelular eta molekularrei buruzko informazioa emanez.
●Salmenta osteko laguntza:Gure konpromisoa proiektua amaitu baino haratago doa, 3 hilabeteko salmenta osteko zerbitzu-aldi batekin. Denbora horretan, proiektuaren jarraipena, arazoak konpontzeko laguntza eta emaitzekin lotutako edozein zalantza argitzeko galdera-erantzun saioak eskaintzen ditugu.
●Esperientzia zabala:ChIP-Seq proiektu ugari arrakastaz burutzeko ibilbide luzearekin, gure enpresak hamarkada bat baino gehiagoko esperientzia dakar mahai gainera. Gure analisi-talde oso trebeak, edukien eta salmenta osteko laguntza osoarekin batera, zure proiektuen arrakasta bermatzen du.
● Kalitate Kontrol ZorrotzaOinarrizko kontrol puntuak ezartzen ditugu etapa guztietan, laginen eta liburutegien prestaketatik hasi eta sekuentziaziora eta bioinformatikaraino. Jarraipen zorrotz honek emaitza kalitate handikoak etengabe lortzen direla bermatzen du.
Zerbitzuaren zehaztapenak
| Liburutegia | Sekuentziazio Estrategia | Gomendatutako datu-irteera | Kalitate kontrola |
| Immunoprezipitazioaren ondoren purifikatutako DNA | Illumina PE150 | 10 GB | Q30≥85% |
Laginaren eskakizunak
Kopuru osoa: ≥10 ng
Zati-tamainaren banaketa: 100-750 bps
Zerbitzuaren lan-fluxua
Laginaren entrega
Liburutegiaren eraikuntza
Sekuentziazioa
Datuen analisia
Salmenta osteko zerbitzuak
Honako analisi hauek barne hartzen ditu:
● Datu gordinaren kalitatearen kontrola
● Erreferentziazko genomarekiko mapatzean oinarritutako gailur-deiak
● Gailurrarekin lotutako geneen anotazioa
● Motiboen analisia: transkripzio faktoreen lotura guneen (TFBS) identifikazioa
● Gailur diferentzialen analisia eta oharpena
Transkripzio Hasiera Guneen (TSS) ondoko aberastasunaren ebaluazioa
CHIP gailurren banaketa genoma osoan
Eskualde gorenen sailkapena
Gailurrarekin lotutako geneen aberaste funtzionala (KEGG)
