BMKCloud Log in
条形banner-03

Produktuak

Illumina eta BGI

Illumina sekuentziazio-teknologia, Sequencing by Synthesis (SBS) oinarrituta, mundu mailan onartutako NGS berrikuntza bat da, munduko sekuentziazio datuen % 90 baino gehiago sortzeaz arduratzen dena.SBSren printzipioak fluoreszentez etiketatutako amaiera itzulgarriak irudikatzea dakar dNTP bakoitza gehitzen den heinean, eta, ondoren, mozten dira hurrengo oinarria sartzeko.Sekuentziazio-ziklo bakoitzean amaitzaile-lotutako lau dNTP itzulgarriak daudenez, lehia naturalak inkorporazio-alborapena murrizten du.Teknologia polifazetiko honek irakurketa bakarreko liburutegiak eta binakako liburutegiak onartzen ditu, aplikazio genomiko ugaritarako.Illumina sekuentziazioaren errendimendu handiko gaitasunak eta zehaztasunak genomikan ikerketan oinarri gisa kokatzen du, zientzialariei ahalmena ematen die genomaren konplexutasunak xehetasun eta eraginkortasun paregabez argitzeko.

BGIk garatutako DNBSEQ NGS teknologia berritzaile bat da, sekuentziazio-kostuak gehiago murriztea eta errendimendua handitzea lortu duena.DNBSEQ liburutegiak prestatzeak DNA zatikatzea, ssDNA prestatzea eta zirkulu biribilgarriaren anplifikazioa dakar DNA nanobolak (DNB) lortzeko.Ondoren, gainazal solido batean kargatzen dira eta, ondoren, Probe-Anchor Synthesis (cPAS) konbinazio bidez sekuentziatzen dira.

Aurrez egindako liburutegien sekuentziazio-zerbitzuak bezeroei errazten die beren sekuentziazio liburutegiak prestatzen hainbat iturritatik (mRNA, genoma osoa, anplikoia, besteak beste).Gerora, liburutegi hauek gure sekuentziazio zentroetara bidal daitezke kalitatea kontrolatzeko eta sekuentziatzeko Illumina edo BGI plataformetan.


Zerbitzuaren xehetasunak

Demo Emaitza

Ezaugarriak

Plataformak:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten eta BGI-DNB-T7

Sekuentziazio moduak:PE50, PE100, PE150, PE250

Liburutegien kalitate-kontrola sekuentziatu aurretik

Datuen entrega eta QC sekuentziazioa:QC txostena eta datu gordinak fastq formatuan entregatu Q30 irakurketak desmultiplexatu eta iragazi ondoren.

 

Zerbitzu Abantailak

Sekuentziazio zerbitzuen aldakortasuna:bezeroak erreiaren, fluxu-zelularen edo datu kopuruaren arabera sekuentziatzea aukera dezake.

Plataformen aldakortasuna:DNB liburutegiak Illumina plataformetara transferitu daitezke

Esperientzia zabala Illumina sekuentziazio plataforman:hainbat espezierekin itxitako milaka proiekturekin. 

Sekuentziazioaren QC txostena bidaltzea:kalitate-neurriekin, datuen zehaztasunarekin eta sekuentziazio proiektuaren errendimendu orokorrarekin.

Sekuentziazio-prozesu heldua:buelta-epe laburrarekin.

Kalitate Kontrol zorrotza: QC eskakizun zorrotzak ezartzen ditugu kalitate handiko emaitzak koherentziaz entregatzeko.

Lagin-baldintzak*

Errei Partziala Sekuentziazioa

Datu kopurua (X)

Kontzentrazioa (qPCR/nM)

Bolumena

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Errei bakarra (Illumina)

Plataforma

Kontzentrazioa (qPCR/nM)

Bolumena

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Kontzentrazioaz eta kopuru osoaz gain, gailur eredu egokia ere beharrezkoa da.

 

Mesedez, jarri gurekin harremanetan zure laginek hasierako materialen baldintzak betetzen ez baditu.

Zerbitzuaren lan-fluxua

laginak prestatzea

Liburutegiaren kalitate-kontrola

Sekuentziazioa

Sekuentziazioa

Datuen azterketa

Datuen kalitatearen kontrola

Lagina QC

Proiektuaren entrega


  • Aurrekoa:
  • Hurrengoa:

  • Liburutegiko QC txostena

    Liburutegiaren kalitateari buruzko txostena ematen da sekuentziatu, liburutegiaren zenbatekoa ebaluatu eta zatikatu aurretik.

     

    Sekuentziazioaren QC txostena

     

    1. taula. Sekuentziazio-datuen estatistikak.

    Lagina ID

    BMKID

    Irakurketa gordinak

    Datu gordinak (bp)

    Irakurketa garbiak (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94,85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    1. Irudia. Kalitatearen banaketa lagin bakoitzeko irakurketetan zehar

    A9

    2. Irudia. Oinarrizko edukien banaketa

    A10

    3. irudia. Irakurritako edukien banaketa sekuentziazio datuetan

    A11

     

    jaso aurrekontua

    Idatzi zure mezua hemen eta bidali iezaguzu

    Bidali zure mezua: