BMKCloud Log in
条形banner-03

Produktuak

DNA/RNA sekuentziazioa - Nanopore sekuentziatzailea

ONT sekuentziazioa denbora errealeko seinale elektrikoaren sekuentziazio teknologia molekula bakarrekoa da, nanoporoetan oinarrituta, plataforma bakoitzaren sekuentziazio printzipioa berdina da.Hari bikoitzeko DNA/RNA biofilmean txertatutako proteina nanoporotsuarekin lotuko da eta proteina motorraren gidaritzapean desegiten da, biofilmaren bi aldeetako tentsio-diferentziaren eraginez, DNA/RNA kateak nanoporoen kanaleko proteina jakin batean zehar igarotzen dira. tasa.DNA/RNA katearen oinarri ezberdinen propietate kimikoen desberdintasunak direla eta, base edo DNA molekula bakar bat nanoporoen kanaletik pasatzen denean, seinale elektriko ezberdinen aldaketa eragingo du.Seinale horiei detektatuz eta haiei dagozkion oinarri-motak kalkula daitezke, eta sekuentziaren denbora errealeko detekzioa osa daiteke.


Zerbitzuaren xehetasunak

Demo Emaitza

Zerbitzuaren xehetasunak Ezaugarriak

Plataforma

Liburutegiaren Tamaina

Datuen etekin teorikoa (zelula bakoitzeko)

Oinarri bakarreko zehaztasuna

Aplikazioak

Nanoporoa

8Kb, 10kb, 20kb, Ultraluzea, cDNA-PCR

70-90Gb/zelula

%85-92

SV deitzea, De novo, sekuentziazio luzea, Iso-Seq, Geneen oharpena, DNA metilazioa detektatzea

Zerbitzu Abantailak

● 5 urte baino gehiagoko esperientzia PacBio sekuentziazio plataforman hainbat espezierekin itxitako milaka proiekturekin.
● BMKGENE Oxford Nanopore-ren bazkide ofiziala da, plataforma bikoitzeko RNA/DNA ziurtagiria duena.
● Sekuentziatzaileen eredu nagusiak daude ekipamendu osoarekin eta sekuentziazio-erritmo nahikoarekin.
● Nanopore plataforman oinarrituta, Denovo animalia eta landareen 10 ikerketa baino gehiago argitaratu dira nazioartean ospe handiko aldizkarietan.

Lagin-baldintzak


Lagin mota

Zenbatekoa

Kontzentrazioa (Qubit ®)

Bolumena

Garbitasuna

Beste batzuk

DNA genomikoa

Datu-eskakizunaren arabera

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

260 nm-ko gailur garbia, kutsadurarik gabe

Kontzentrazioa Qubit eta Qubit/Nanopore ≤ 2 bidez neurtu behar da

RNA osoa

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; kutsadurarik gabe

RIN balioa ≥7,5

 

Zerbitzuaren lan-fluxua

laginak prestatzea

Laginak prestatzea

Liburutegiaren Prestaketa

Liburutegiaren eraikuntza

Sekuentziazioa

Sekuentziazioa

Datuen azterketa

Datuen azterketa

Lagina QC

Proiektuaren entrega


  • Aurrekoa:
  • Hurrengoa:

  • DNA Laginaren Datuen Kalitatearen Ebaluazioa

    1. taula. Datu garbiei buruzko estatistikak.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    garbiSeqNum

    cleanSumBase

    garbiN50Len

    garbiN90Len

    cleanMeanLen

    garbiMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    RNA Laginaren Datuen Kalitatearen Ebaluazioa

    1. taula. Datu garbiei buruzko estatistikak.

    Fitxategi izena

    Bezeroaren ID

    Irakurri Zenbakia

    BaseNum

    N50

    Batez besteko Luzera

    MaxLength

    Batez besteko Q puntuazioa

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    12.G

    1. Irudia. Irakurri luzera banaketa

    A3

    2. irudia. Datu garbien kalitate puntuaren banaketa

    A4

    3. irudia. Datu garbien luzera eta kalitate puntuazioaren banaketa

    A5

    jaso aurrekontua

    Idatzi zure mezua hemen eta bidali iezaguzu

    Bidali zure mezua: