Produktuak

DNBSEQ aurrez egindako liburutegiak

MGIk garatutako DNBSEQ NGS teknologia berritzailea da, sekuentziazio-kostuak are gehiago murriztea eta ekoizpena handitzea lortu duena. DNBSEQ liburutegien prestaketak DNAren zatikatzea, ssDNAren prestaketa eta zirkulu bidezko anplifikazioa dakar DNA nanobolak (DNB) lortzeko. Ondoren, hauek gainazal solido batean kargatzen dira eta ondoren Zunda-Aingura Sintesi konbinatorioaren (cPAS) bidez sekuentziatzen dira. DNBSEQ teknologiak anplifikazio-errore-tasa baxua izatearen abantailak konbinatzen ditu nanobolekin dentsitate handiko errore-ereduak erabiltzearekin, eta horrek ekoizpen eta zehaztasun handiagoa duen sekuentziazioa lortzen du.

Gure aurrez egindako liburutegien sekuentziazio zerbitzuak bezeroei Illumina sekuentziazio liburutegiak prestatzeko aukera ematen die hainbat iturritatik (mRNA, genoma osoa, amplikoia, 10x liburutegiak, besteak beste), eta gure laborategietan MGI liburutegi bihurtzen dira DNBSEQ-T7-n sekuentziatzeko, datu kopuru handiak kostu txikiagoetan ahalbidetuz.

Jarri gurekin harremanetan

Zerbitzuaren xehetasunak

Demoaren emaitza

Ezaugarriak

●Plataforma:MGI-DNBSEQ-T7

●Sekuentziazio moduak:PE150

●Illumina liburutegien transferentziaMGI:datu-bolumen handien sekuentziazioa kostu txikian ahalbidetzea.

●Liburutegien kalitate-kontrola sekuentziazioa egin aurretik.

●Sekuentziazio datuen QC eta entrega:QC txostenaren eta datu gordinaren entrega fastq formatuan, Q30 irakurketak demultiplexatu eta iragazi ondoren.

Abantailak

●Sekuentziazio zerbitzuen moldakortasuna:bezeroak sekuentziazioa erreiaren edo datu kantitatearen arabera aukera dezake.

●Datu-irteera handia:1500 Gb/erreia

●Sekuentziazio QC txostenaren entrega:kalitate-metrikekin, datuen zehaztasunarekin eta sekuentziazio-proiektuaren errendimendu orokorrarekin.

●Sekuentziazio helduaren prozesua:itzulera-denbora laburrarekin.

●Kalitate Kontrol ZorrotzaKalitate handiko emaitzak etengabe lortzen direla bermatzeko, Kalitate Kontrol zorrotzak ezartzen ditugu.

Laginaren eskakizunak

	Datu kopurua (X)	Kontzentrazioa (qPCR/nM)	Bolumena
Errei partziala	X ≤ 10 Gb	≥ 1nM	≥ 25 μl
	10 Gb < X ≤ 50 Gb	≥ 2 nM	≥ 25 μl
	50 Gb < X ≤ 100 Gb	≥ 3 nM	≥ 25 μl
	X > 100 Gb	≥ 4 nM
Errei bakarra	Errei bakoitzeko	≥ 1,5 nM / Liburutegi multzoa	≥ 25 μl / Liburutegi multzoa

Kontzentrazioaz eta kantitate osoaz gain, gailur-eredu egoki bat ere behar da.

Oharra: Dibertsitate baxuko liburutegien erreien sekuentziazioak PhiX spike-in behar du baseen dei sendoa bermatzeko.

Aurrez multzokatutako liburutegiak lagin gisa bidaltzea gomendatzen dugu. BMKGENE-k liburutegien multzokatzea behar baduzu, mesedez, kontsultatu errei partzialen sekuentziaziorako liburutegien eskakizunak.

Liburutegiaren tamaina (Gailurraren mapa)

Gailur nagusia 300-450 bp-ren artean egon beharko litzateke.

Liburutegiek gailur nagusi bakarra, egokitzaileen kutsadurarik eta primer dimerorik ez izan behar dute.

Zerbitzuaren lan-fluxua

Aurrekoa: Hi-C oinarritutako kromatinaren interakzioa

Hurrengoa: BMKMANU S3000_Transkriptoma Espaziala

Liburutegiko Kalitate Txostena

Sekuentziazioa egin aurretik, liburutegiaren kalitateari buruzko txostena ematen da, liburutegiaren kopurua eta zatikatzea ebaluatuz.

Sekuentziazioaren QC txostena

1. taula. Sekuentziazio datuei buruzko estatistikak.

Laginaren IDa	BMKID	Irakurketa gordinak	Datu gordinak (bp)	Irakurketa garbiak (%)	20. hiruhilekoa (%)	Q30 (%)	GC (%)
C_01	BMK_01	22.870.120	6.861.036.000	96,48	99.14	94,85	36,67
C_02	BMK_02	14.717.867	4.415.360.100	96,00	98,95	93,89	37,08