Eboluzio Genetika

Eboluzio-genesiaren ikerketak populazioen eboluzio-ibilbidea ulertzea dute helburu, sekuentzia genomikoetan dagoen polimorfismo-informazioa erabiliz. BMKCloud Evolutionary Genetics pipeline-a populazio handietako WGS edo Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) datuak aztertzeko diseinatuta dago. Datu gordinen kalitate-kontrola egin ondoren, irakurketak erreferentziazko genomarekin lerrokatzen dira eta aldaerak deitzen dira. Pipeline-ak zuhaitz filogenetikoaren eraikuntza, osagai nagusien analisia (PCA), populazio-egituraren analisia, lotura-desoreka (LD), eskaneatze-analisi selektiboa eta hautagai-geneen analisia barne hartzen ditu.