ZORIONAK EZ DITUZTEN SEKENTZIOA-ILLUMINA
Zerbitzuaren abantailak
●MRNA eta LNCRNAren azterketa bateratua: MRNA transkripzioen kuantifikazioa LNCRNAren azterketarekin eta helburuen azterketarekin konbinatuz, posible da erantzun zelularraren azpian dagoen arauzko mekanismoaren ikuspegi orokorra.
●Espezializazio zabala: Gure taldeak esperientzia ugari dakartza proiektu guztiei, 23.000 lagin baino gehiago izapidetzea BMK spanning lagin mota askotara eta LNCRNA proiektuetan.
●Kalitate kontrol zorrotza: Core kontrol puntuak ezartzen ditugu fase guztietan, lagin eta liburutegiaren prestaketatik sekuentziazio eta bioinformatikara. Jarraipen zorrotz honek kalitate handiko emaitzak ematea bermatzen du.
●Salmenta osteko laguntza: Gure konpromisoa proiektuen osaketaz harago hedatzen da 3 hilabeteko salmenta-epearen epearekin. Denbora horretan, proiektuen jarraipena, arazoak konpontzeko eta Q & q eta saio eskaintzen ditugu emaitzekin lotutako edozein zalantza argitzeko.
Laginaren eskakizunak eta entrega
| Liburutegi | Nasa | Gomendatutako datuak | Datuen qc |
| rrna agortutako liburutegia | Illumina pe150 | 10-16 GB | % 30,85% |
Nukleotidoak:
| Conc. (NG / μL) | Zenbatekoa (μg) | Garbitasun | Segurtasun |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | Od260 / 280 = 1,7-2.5 Od260 / 230 = 0,5-2.5 Gelan agertzen den proteina edo DNA kutsadura mugatua edo ez. | Rin≥6.0; 5.0≥28s / 18s≥1.0; altuera mugatua edo ez |
● Landareak:
Erro, zurtoina edo petala: 450 mg
Hostoa edo hazia: 300 mg
Fruta: 1,2 g
● Animalia:
Bihotza edo hesteak: 450 mg
Biscera edo garuna: 240 mg
Muskulua: 600 mg
Hezurrak, ilea edo azala: 1,5g
● Artropodoak:
Intsektuak: 9g
Crustacea: 450 mg
● Odol osoa:2 hodi
● Zelulak: 106 zelulak
● Serum eta plasma: 6 ml
Gomendatutako laginaren entrega
Edukiontzia: 2 ml Centrifuge Tube (Tin Papera ez da gomendagarria)
Laginaren etiketatzea: taldea + erreplikatu adibidez A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Bidalketa:
1. Lehorra izotza: laginak poltsetan paketatu behar dira eta izotz lehorrean lurperatu behar dira.
2. Hodi rnastable: RNA laginak RNA egonkortzeko hodian lehortu daitezke (adibidez, rnastable®) eta giro-tenperaturan bidalita.
Zerbitzuaren lan-fluxua
Esperimentuaren diseinua
Laginaren entrega
RNA erauzketa
Liburutegiko eraikuntza
Sekuentziazio
Datuen azterketa
Salmenta osteko zerbitzuak
Bioinformatika
Gene espresio diferentziala (DEG) analisia
LNCRNAren adierazpen kuantifikazioa - Klusterizazioa
Lncrna xede geneak aberastea
MRNA eta LNCNNA posizioaren analisia - zirrikitua (erdiko zirkulua MRNA eta barruko Cicrlce LNCRNA da)
Arakatu BMKGeneren LNCRNA-ren berezko zerbitzuek argitalpen bilduma komisio baten bidez errazten dituzten aurrerapenak.
Ji, H. et al. (2020) 'Identifikazioa, iragarpen funtzionala eta LNCRNA Giltza estresarekin lotutako Lncrnasen egiaztapena arratoien gibelean, 2020 10: 1, 10 (1), 1-14. DOI: 10.1038 / S41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analisi transkriptomiko integratzaileak Cyhv-3 erresistentziako karparen ohiko karparen tentsiorako immunitate mekanismoa agerian uzten du, immunologian, 12, or. 687151. DOI: 10.3389 / FIMU.2021.687151 / BIBTEX.
Wang, xj et al. (2022) 'Omikari multi-integrazioan oinarritutako RNA erregulazio sare endogenoak oinarritzat hartuta, zelulen biriketako minbizi txikietan lehiatzeko. 904865. DOI: 10.3389 / FONC.2022.904865 / BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) "Gene Coxpression Network-en disekzio genetikoa Populus-en (Landare Bioteknologiako Journal, 18 (4), 1015-1026. DOI: 10.1111 / PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) "Gene espresio delikoaren eta zelula immunologikoen seinaleztapen metabolikoen erregulazio sare globala, hilobien gaixotasunaren eta Hashimotoren tiroiditisaren mikroenvirizioan, mugak immunologian, 13, or. 879824. DOI: 10.3389 / FIMU.202.879824 / BIBTEX.
