-
Sekuentziazio metagenomikoa (NGS)
Metagenoma organismo misto baten material genetiko osoaren bildumari deitzen zaio, hala nola ingurumen-metagenoma, giza metagenoma, etab. Mikroorganismo landu daitezkeen eta landu ezin direnen genomak ditu.Sekuentziazio metagenomikoa ingurumen-laginetatik ateratako material genomiko mistoak aztertzeko erabiltzen den tresna molekularra da, eta informazio zehatza ematen du espezieen aniztasuna eta ugaritasuna, populazioaren egitura, erlazio filogenetikoa, gene funtzionalak eta ingurumen-faktoreekin korrelazio sarea.
Plataforma:Illumina NovaSeq6000
-
Sekuentziazio metagenomikoa-Nanoporoa
Metagenomika inguruneko laginetatik ateratako material genomiko mistoak aztertzeko erabiltzen den tresna molekularra da, non espezieen aniztasuna eta ugaritasunari, populazio-egiturari, erlazio filogenetikoari, gene funtzionalak eta ingurumen-faktoreekiko korrelazio-sarea, etab. informazio zehatza ematen duena. azterketa metagenomikoetara.Irakurketa luzean duen errendimendu bikainak korrontean beherako analisi metagenomikoa hobetu zuen, batez ere metagenomaren muntaia.Irakurketa-luzeraren abantailak aprobetxatuz, Nanopore-n oinarritutako azterketa metagenomikoak muntaketa jarraituagoa lortzeko gai da eskopeta metagenomikarekin alderatuta.Nanoporetan oinarritutako metagenomikak mikrobiometatik bakterioen genoma osoak eta itxiak arrakastaz sortu zituela argitaratu da (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Plataforma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S eta 18S rRNAren azpiunitatea oso kontserbatuak eta hiperaldagarriak diren eskualdeak dituena hatz-marka molekular ezin hobea da organismo prokarioto eta eukariotoak identifikatzeko.Sekuentziazioa aprobetxatuz, anplikoi hauek kontserbatutako zatietan oinarrituta bideratu daitezke eta eskualde hiperaldagaiak guztiz karakterizatu daitezke mikrobioen identifikaziorako, mikrobioen dibertsitatearen azterketa, taxonomia, filogenia, etab. ) PacBio plataformaren sekuentziazioak irakurketa luzeak oso zehatzak lortzeko aukera ematen du, luzera osoko anplikoiak (1,5 Kb inguru) estal ditzaketenak.Eremu genetikoaren ikuspegi zabalak bakterioen edo onddoen komunitateko espezieen oharpenen bereizmena asko hobetu zuen.
Plataforma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS anplikoien sekuentziazioak mikrobio-komunitate batean filogenesia, taxonomia eta espezieen ugaritasuna agerian uztea du helburu, atal oso konversatuak eta hiperaldagaiak dituzten etxeko markatzaile genetikoen PCR produktuak ikertuz.Woeses et al-ek (1977) hatz-marka molekular perfektu hauek sartzeak isolamendurik gabeko mikrobiomaren profila ahalbidetzen du.16S (bakterioak), 18S (onddoak) eta Barne transkribatutako espazioa (ITS, onddoak) sekuentziatzeak espezie ugariak zein espezie arraroak eta identifikatu gabekoak identifikatzeko aukera ematen du.Teknologia hau oso erabilia eta tresna nagusi bihurtu da mikrobioen konposizio diferentziala identifikatzeko hainbat ingurunetan, hala nola giza ahoan, hesteak, gorotzak, etab.
Plataforma:Illumina NovaSeq6000
-
Bakterioen eta Onddoen Genoma Osoaren Sekuentziazioa
Bakterio eta onddoen genoma osoa birsekuentziatzea tresna kritikoa da bakterio eta onddo ezagunen genomak osatzeko, baita genoma anitz konparatzeko edo organismo berrien genomak mapatzeko ere.Garrantzi handia du bakterioen eta onddoen genoma osoak sekuentziatzea erreferentziazko genoma zehatzak sortzeko, mikrobioen identifikazioa eta beste genoma azterketa konparatiboak egiteko.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Onddoen Genoma
Biomarker Technologies-ek genomaren inkesta, genoma fina eta onddoen genoma osoa eskaintzen ditu ikerketa-helburu zehatzaren arabera.Genomaren sekuentziazioa, muntaketa eta oharpen funtzionala lor daitezke Hurrengo belaunaldiko sekuentziazioa + Hirugarren belaunaldiko sekuentziazioa konbinatuz maila altuko genomaren muntaketa lortzeko.Hi-C teknologia ere erabil daiteke kromosoma mailan genomaren muntaketa errazteko.
Plataforma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakterioen Genoma osoa
Biomarker Technologies-ek zero hutsunea duten bakterioen genoma osoa eraikitzeko sekuentziazio zerbitzua eskaintzen du.Bakterioen genoma osoa eraikitzeko lan-fluxu nagusiak hirugarren belaunaldiko sekuentziazioa, muntaia, oharpen funtzionala eta analisi bioinformatiko aurreratuak barne hartzen ditu ikerketa-helburu zehatzak betetzen dituena.Bakterioen genomaren profil zabalago batek beren prozesu biologikoen azpian dauden oinarrizko mekanismoak ezagutzera ahalbidetzen du, eta horrek erreferentzia baliotsua ere eman dezake goi-espezie eukariotoetan ikerketa genomikoetarako.
Plataforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
