mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA sekuentziazioak zeluletako mRNA transkripzio guztien profilak egitea ahalbidetzen du baldintza espezifikoetan, eta hainbat ikerketa-arlotan oso erabilia den teknologia da. BMKCloud De novo mRNA-seq kanalizazioa poli-A aberastutako sekuentziazio-liburutegiak aztertzeko diseinatuta dago, erreferentziazko genomarik eskuragarri ez dagoenean. Kanalizazio-kanalizazioa kalitate-kontrolarekin hasten da, eta ondoren...berrikitranskripzioen muntaketa eta unigene multzoaren hautaketa. Unigene egituraren analisiak kodetze sekuentzia (CDS) eta sekuentzia errepikapen sinpleak (SSR) aurreikusten ditu. Ondoren, adierazpen diferentzialaren analisiak probatutako baldintzen artean adierazpen diferentziala duten geneak (DEG) aurkitzen ditu, eta ondoren, anotazio funtzionala eta DEGen aberastea egiten dira informazio biologikoa ateratzeko.