-
BSA
Bulked Segregant Analysis plataforma urrats bakarreko analisi estandarrez eta analisi aurreratuaz osatuta dago, parametroen ezarpen pertsonalizatuarekin.BSA fenotipoarekin lotutako markatzaile genetikoak azkar identifikatzeko erabiltzen den teknika da.BSAren lan-fluxu nagusiak honako hauek ditu: 1. Fenotipo oso kontrajarriak dituzten gizabanako bi talde hautatzea;2. Banako guztien DNA, RNA edo SLAF-seq (Biomarker-ek garatua) elkartzea, DNAren bi zati osatzeko;3. Erreferentziazko genomaren aurkako sekuentzia diferentzialak identifikatzea edo tartean, 4. Lotutako eskualde hautagaiak aurreikustea ED eta SNP-indize algoritmoaren bidez;5. Eskualde hautagaietako geneen analisi funtzionala eta aberastea, etab. Markatzaile genetikoen baheketa eta primer diseinua barne dauden datuetan meatzaritza aurreratuagoa ere eskuragarri dago.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) plataforma mikrobioen aniztasunaren proiektuaren analisian urteetako esperientziarekin garatzen da, oinarrizko analisi estandarizatua eta analisi pertsonalizatua dituena: oinarrizko analisiak egungo mikrobioen ikerketaren analisi nagusiaren edukia hartzen du, analisiaren edukia aberatsa eta integrala da, eta analisien emaitzak proiektuen txosten moduan aurkezten dira;Analisi pertsonalizatuaren edukia anitza da.Laginak hauta daitezke eta parametroak malgutasunez ezarri daitezke oinarrizko analisi-txostenaren eta ikerketa-helburuaren arabera, eskakizun pertsonalizatuak betetzeko.Windows sistema eragilea, sinplea eta azkarra.
-
Genetika ebolutiboa
Genetika ebolutiboa aldakuntza genetikoetan oinarritutako material ebolutiboari buruzko interpretazio integrala emateko diseinatutako sekuentziazio-zerbitzu bat da, SNP, InDels, SV eta CNV barne.Populazioen eboluzio-aldaketak eta ezaugarri genetikoak deskribatzeko beharrezkoak diren oinarrizko analisi guztiak eskaintzen ditu, hala nola, populazioaren egitura, aniztasun genetikoa, filogenia-erlazioak, etab. Gene-fluxuari buruzko azterketak ere baditu, populazio-tamaina eraginkorra eta dibergentzia-denbora zenbatesteko ahalmena ematen dutenak.
-
Genomika Konparatua
Genomika konparatiboak, literalki, espezie ezberdinen genoma sekuentzia eta egitura osoak alderatzea esan nahi du.Diziplina honek espezieen bilakaera, gene-funtzioa, gene-erregulazio-mekanismoa genoma mailan ezagutaraztea du helburu, espezie ezberdinetan kontserbatu edo bereizten diren sekuentzia-egiturak eta elementuak identifikatuz.Genomika konparatiboko ohiko azterketak geneen familian, garapen ebolutiboan, genoma osoaren bikoizketan, presio selektiboan, etab.
-
Genetika ebolutiboa
Biztanleria eta analisi genetiko ebolutiboaren plataforma urteetan BMK I+G taldean pilatutako esperientzia masiboan oinarrituta dago.Batez ere bioinformatikan adituak ez diren ikertzaileentzako erabilerraza den tresna da.Plataforma honek oinarrizko genetika ebolutiboari lotutako oinarrizko analisia ahalbidetzen du, besteak beste, zuhaitz filogenetikoa eraikitzea, lotura-desoreka aztertzea, aniztasun genetikoa ebaluatzea, ekorketa selektiboa, ahaidetasun azterketa, PCA, populazioaren egituraren azterketa, etab.
-
Hi-C oinarritutako Genoma Asanblada
Hi-C kromosomaren konfigurazioa harrapatzeko diseinatutako metodo bat da, hurbiltasunean oinarritutako interakzioak eta errendimendu handiko sekuentziazioa konbinatuz.Elkarrekintza horien intentsitatea kromosometako distantzia fisikoarekin negatiboki erlazionatuta dagoela uste da.Hori dela eta, Hi-C-ko datuek genoma zirriborro batean bildutako sekuentzien multzokatzea, ordenatzea eta orientatzea eta horiek kromosoma kopuru jakin batean ainguratzea bideratu dezakete.Teknologia honek kromosoma-mailako genoma muntaia ahalbidetzen du populazioetan oinarritutako mapa genetikorik ezean.Genoma bakoitzak Hi-C bat behar du.
Plataforma: Illumina NovaSeq Plataforma / DNBSEQ
-
Landare/Animal De Novo Genomaren Sekuentziazioa
De Novosekuentziazioa espezie baten genoma osoa eraikitzeari deritzo sekuentziazio teknologiak erabiliz, adibidez, PacBio, Nanopore, NGS, etab., erreferentziazko genomarik ezean.Hirugarren belaunaldiko sekuentziazio teknologien irakurketaren luzeraren hobekuntza nabarmenak aukera berriak ekarri ditu genoma konplexuak mihiztatzeko, hala nola, heterozigositate handia dutenak, eskualde errepikakorren proportzio altua dutenak, poliploideak, etab. Irakurketaren luzera hamarnaka kilobase mailan dagoenez, sekuentziazio irakurketa hauek ahalbidetzen dute. Elementu errepikakorrak, GC eduki anormalak dituzten eskualdeak eta oso konplexuak diren beste eskualde batzuk ebaztea.
Plataforma: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/Illumina NovaSeq Plataforma
-
Giza Exoma Osoaren Sekuentziazioa
Exoma osoko sekuentziazioa (WES) gaixotasunak eragiten dituzten mutazioak identifikatzeko sekuentziazio estrategia errentagarritzat jotzen da.Exoek genoma osoaren % 1,7 gutxi gorabehera hartzen duten arren, proteina osoaren funtzioen profila adierazten du zuzenean.Giza genoman, gaixotasunei lotutako mutazioen % 85 baino gehiago proteina kodetzaileen eskualdean gertatzen dela jakinarazi da.
BMKGENEk giza exoma osoa sekuentziatzeko zerbitzu integralak eta malguak eskaintzen ditu exoiak harrapatzeko estrategia ezberdinekin ikerketa-helburu ezberdinak betetzeko eskuragarri.
Plataforma: Illumina NovaSeq Plataforma
-
Loku espezifikoko zatien sekuentziazioa (SLAF-Seq)
Errendimendu handiko genotipizazioa, batez ere eskala handiko populazioan, oinarrizko urratsa da elkarte genetikoen ikerketetan, gene funtzionalak ezagutzeko, eboluzio-analisirako, etab. oinarri genetikoak eskaintzen dituena. ) lagin bakoitzeko sekuentziazio kostua minimizatzeko aurkezten da, markatzaile genetikoen aurkikuntzan zentzuzko eraginkortasuna mantentzen duen bitartean.Hau, normalean, muga-zatiak erauziz lortzen da tamaina-tarte jakin batean, zeina irudikapen murriztuaren liburutegia (RRL) deitzen dena.Loku espezifikoko fragmentuen sekuentziazioa (SLAF-Seq) SNP genotipatzeko erreferentziazko genoma batekin edo gabe garatutako estrategia bat da.
Plataforma: Illumina NovaSeq Plataforma -
Illumina eta BGI
Illumina sekuentziazio-teknologia, Sequencing by Synthesis (SBS) oinarrituta, mundu mailan onartutako NGS berrikuntza bat da, munduko sekuentziazio datuen % 90 baino gehiago sortzeaz arduratzen dena.SBSren printzipioak fluoreszentez etiketatutako amaiera itzulgarriak irudikatzea dakar dNTP bakoitza gehitzen den heinean, eta, ondoren, mozten dira hurrengo oinarria sartzeko.Sekuentziazio-ziklo bakoitzean amaitzaile-lotutako lau dNTP itzulgarriak daudenez, lehia naturalak inkorporazio-alborapena murrizten du.Teknologia polifazetiko honek irakurketa bakarreko liburutegiak eta binakako liburutegiak onartzen ditu, aplikazio genomiko ugaritarako.Illumina sekuentziazioaren errendimendu handiko gaitasunak eta zehaztasunak genomikan ikerketan oinarri gisa kokatzen du, zientzialariei ahalmena ematen die genomaren konplexutasunak xehetasun eta eraginkortasun paregabez argitzeko.
BGIk garatutako DNBSEQ NGS teknologia berritzaile bat da, sekuentziazio-kostuak gehiago murriztea eta errendimendua handitzea lortu duena.DNBSEQ liburutegiak prestatzeak DNA zatikatzea, ssDNA prestatzea eta zirkulu biribilgarriaren anplifikazioa dakar DNA nanobolak (DNB) lortzeko.Ondoren, gainazal solido batean kargatzen dira eta, ondoren, Probe-Anchor Synthesis (cPAS) konbinazio bidez sekuentziatzen dira.
Aurrez egindako liburutegien sekuentziazio-zerbitzuak bezeroei errazten die beren sekuentziazio liburutegiak prestatzen hainbat iturritatik (mRNA, genoma osoa, anplikoia, besteak beste).Gerora, liburutegi hauek gure sekuentziazio zentroetara bidal daitezke kalitatea kontrolatzeko eta sekuentziatzeko Illumina edo BGI plataformetan.
