WGS (Nanopore)

Nanopore-rekin genoma osoaren birsekuentziazioa metodo ezaguna da aldaera genomikoak identifikatzeko, batez ere aldaera estrukturalak (SV), zeinak irakurketa luzeko sekuentziazioaren bidez irakurketa laburreko sekuentziazioaren bidez baino zehatzago deitzen diren. BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) kanalizazioa Nanopore-rekin WGS proiektuetako datuak aztertzeko diseinatuta dago, kalitate handiko eta ondo anotatutako erreferentziazko genoma bat erabiliz. Analisia irakurketa-mozketarekin eta kalitate-kontrolarekin hasten da, ondoren erreferentziazko genomarekiko lerrokatzea, SV deitzea eta SV-rekin lotutako geneen anotazio funtzionala erabiliz datu-base anitz erabiliz.