-
PacBio-Transcriptome تمام طول (غیر مرجع)
پلت فرم Amplicon (16S/18S/ITS) با سالها تجربه در تجزیه و تحلیل پروژه تنوع میکروبی توسعه یافته است که شامل تجزیه و تحلیل اساسی استاندارد و تجزیه و تحلیل شخصی است: تجزیه و تحلیل اساسی محتوای تجزیه و تحلیل جریان اصلی تحقیقات میکروبی فعلی را پوشش می دهد، محتوای تجزیه و تحلیل غنی و جامع است. و نتایج تجزیه و تحلیل در قالب گزارش پروژه ارائه می شود.محتوای تحلیل شخصی متنوع است.نمونه ها را می توان انتخاب کرد و پارامترها را می توان به طور انعطاف پذیر با توجه به گزارش تجزیه و تحلیل اولیه و هدف تحقیق تنظیم کرد تا نیازهای شخصی را تحقق بخشد.سیستم عامل ویندوز، ساده و سریع.
-
PacBio-Transcriptome تمام طول (غیر مرجع)
با در نظر گرفتن داده های توالی ایزوفرم Pacific Biosciences (PacBio) به عنوان ورودی، این برنامه قادر به شناسایی توالی رونوشت تمام طول (بدون مونتاژ) است.با نگاشت توالی های تمام قد در برابر ژنوم مرجع، رونوشت ها را می توان توسط ژن های شناخته شده، رونوشت ها، مناطق کد کننده و غیره بهینه سازی کرد. در این حالت، شناسایی دقیق تر ساختارهای mRNA، مانند اسپلایسینگ جایگزین و غیره، قابل دستیابی است.تجزیه و تحلیل مشترک با داده های توالی رونویسی NGS، حاشیه نویسی جامع تر و کمی سازی دقیق تر در بیان را در سطح رونوشت امکان پذیر می کند، که تا حد زیادی به بیان دیفرانسیل پایین دستی و تجزیه و تحلیل عملکردی می رسد.
-
جعبه ابزار
BMKCloud یک پلت فرم بیوانفورماتیک پیشرو است که راه حل یک مرحله ای برای برنامه های ژنومی ارائه می دهد که به طور گسترده مورد اعتماد محققان در عرصه های مختلف از جمله پزشکی، کشاورزی، زیست محیطی و غیره است. ، منابع محاسباتی، پایگاه داده عمومی، دوره های آنلاین بیوانفورماتیک، و غیره. BMKCloud دارای ابزارهای پرکاربرد بیوانفورماتیکی از جمله حاشیه نویسی ژن، ابزارهای ژنتیکی تکاملی، ncRNA، کنترل کیفیت داده ها، مونتاژ، تراز، استخراج داده، جهش، آمار، مولد شکل، توالی است. تجزیه و تحلیل و غیره
-
RNA کوچک
RNA های کوچک نوعی RNA کوتاه غیر کد کننده با طول متوسط 18-30 nt هستند که شامل miRNA، siRNA و piRNA می شود.گزارش شده است که این RNA های کوچک به طور گسترده در فرآیندهای بیولوژیکی مختلف مانند تخریب mRNA، مهار ترجمه، تشکیل هتروکروماتین و غیره دخیل هستند. پلت فرم تحلیل توالی متشکل از تجزیه و تحلیل استاندارد و داده کاوی پیشرفته است.بر اساس داده های RNA-seq، تجزیه و تحلیل استاندارد می تواند به شناسایی و پیش بینی miRNA، پیش بینی ژن هدف miRNA، حاشیه نویسی و تجزیه و تحلیل بیان دست یابد.تجزیه و تحلیل پیشرفته جستجو و استخراج miRNA سفارشی، تولید نمودار Venn، miRNA و ساخت شبکه ژن هدف را امکان پذیر می کند.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS یک پلت فرم تجزیه و تحلیل توالی مجدد ژنوم است که بر اساس تجربه غنی در فناوری های نشانگر زیستی توسعه یافته است.این پلتفرم آسان برای استفاده، امکان ارسال سریع یک گردش کار تجزیه و تحلیل یکپارچه را با تنظیم چند پارامتر اساسی فراهم می کند، که برای داده های توالی DNA تولید شده از پلتفرم Illumina و پلت فرم توالی BGI مناسب است.این پلتفرم بر روی سرور محاسباتی با کارایی بالا مستقر شده است که تجزیه و تحلیل داده بسیار کارآمد را در زمان بسیار محدود امکان پذیر می کند.داده کاوی شخصی شده بر اساس تجزیه و تحلیل استاندارد، از جمله جستجوی ژن جهش یافته، طراحی پرایمر PCR و غیره در دسترس است.
-
mRNA (مرجع)
ترانسکریپتوم ارتباط بین اطلاعات ژنتیکی ژنومی و پروتئوم عملکرد بیولوژیکی است.تنظیم سطح رونویسی مهمترین و گسترده ترین روش تنظیم موجودات است.توالی یابی ترانسکریپتوم می تواند رونوشت را در هر نقطه از زمان یا تحت هر شرایطی با وضوح دقیق به یک نوکلئوتید توالی یابی کند. این می تواند به صورت پویا سطح رونویسی ژن را منعکس کند، همزمان رونوشت های نادر و عادی را شناسایی و کمی کند و اطلاعات ساختاری را ارائه دهد. نمونه رونوشت های خاص
در حال حاضر، فناوری توالی‌یابی رونوشت به طور گسترده در زراعت، پزشکی و سایر زمینه‌های تحقیقاتی، از جمله تنظیم توسعه حیوانات و گیاهان، سازگاری با محیط، تعامل ایمنی، محلی‌سازی ژن، تکامل ژنتیکی گونه‌ها و تشخیص بیماری‌های تومور و ژنتیکی استفاده شده است.
-
متاژنومیکس (NGS)
این پلت فرم تجزیه و تحلیل برای تجزیه و تحلیل داده های متاژنومیک تفنگ ساچمه ای بر اساس سال ها تجربه طراحی شده است.این شامل گردش کار یکپارچه شامل انواع مختلفی از تجزیه و تحلیل‌های متاژنومیک است که معمولاً مورد نیاز است، از جمله پردازش داده‌ها، مطالعات سطح گونه، مطالعات سطح عملکرد ژن، ترکیب متاژنوم، و غیره. ، تنظیم پارامتر، تولید شکل شخصی و غیره
-
LncRNA
RNA های طولانی غیر کدکننده (lncRNA) نوعی رونوشت با طول بیشتر از 200 nt هستند که قادر به کدگذاری پروتئین ها نیستند.شواهد انباشته نشان می دهد که اکثر lncRNA ها به احتمال زیاد عملکردی دارند.فن‌آوری‌های توالی‌یابی با توان بالا و ابزارهای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک، ما را قادر می‌سازد تا توالی‌های lncRNA و اطلاعات موقعیت‌یابی را به طور مؤثرتری آشکار کنیم و ما را به کشف lncRNAهایی با عملکردهای تنظیمی حیاتی سوق می‌دهد.BMKCloud مفتخر است که پلت فرم تجزیه و تحلیل توالی lncRNA را برای دستیابی به تجزیه و تحلیل سریع، قابل اعتماد و انعطاف پذیر lncRNA به مشتریان خود ارائه می دهد.
-
GWAS
هدف مطالعه انجمن گسترده ژنوم (GWAS) شناسایی واریانت های ژنتیکی (ژنوتیپ) مرتبط با صفات خاص (فنوتیپ) است.مطالعات GWA نشانگرهای ژنتیکی را بر روی کل ژنوم تعداد زیادی از افراد بررسی می کند و با تجزیه و تحلیل آماری در سطح جمعیت، ارتباط ژنوتیپ- فنوتیپ را پیش بینی می کند.توالی یابی مجدد کل ژنوم به طور بالقوه می تواند همه گونه های ژنتیکی را کشف کند.همراه با داده‌های فنوتیپی، GWAS می‌تواند برای شناسایی SNPهای مرتبط با فنوتیپ، QTLها و ژن‌های کاندید پردازش شود، که به شدت از اصلاح نژاد حیوانات/گیاهان مدرن پشتیبانی می‌کند.SLAF یک استراتژی توالی ژنوم ساده شده است که نشانگرهای توزیع شده در سراسر ژنوم SNP را کشف می کند.این SNP ها، به عنوان نشانگرهای ژنتیکی مولکولی، می توانند برای مطالعات ارتباطی با صفات هدفمند پردازش شوند.این یک استراتژی مقرون به صرفه در شناسایی صفات پیچیده تغییرات ژنتیکی است.
-
رونویسی تمام قد نانوحفره
ایزوفرم های جایگزین پیچیده و متغیر در موجودات، مکانیسم های ژنتیکی مهمی برای تنظیم بیان ژن و تنوع پروتئین هستند.شناسایی دقیق ساختارهای رونوشت مبنایی برای مطالعه عمیق الگوهای تنظیم بیان ژن است.پلت فرم توالی یابی نانوحفره با موفقیت مطالعه رونوشت را به سطح ایزوفرم رسانده است.این پلت فرم تجزیه و تحلیل برای تجزیه و تحلیل داده های RNA-Seq تولید شده بر روی پلت فرم Nanopore بر اساس ژنوم مرجع طراحی شده است که به تجزیه و تحلیل های کمی و کیفی در سطح ژن و رونوشت دست می یابد.
