تحلیل ارتباط در سطح ژنوم
گردش کار
مزایای خدمات
●تخصص گسترده و سوابق انتشاراتیبا تجربه انباشته در GWAS، BMKGene صدها پروژه گونه در تحقیقات GWAS جمعیت را به اتمام رسانده، به محققان در انتشار بیش از ۱۰۰ مقاله کمک کرده و ضریب تأثیر تجمعی آن به ۵۰۰ رسیده است.
● تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیکگردش کار شامل تجزیه و تحلیل ارتباط SNP-صفت است که مجموعهای از ژنهای کاندید و حاشیهنویسی عملکردی مربوط به آنها را ارائه میدهد.
●تیم بیوانفورماتیک بسیار ماهر و چرخه تحلیل کوتاهتیم BMKGene با تجربه فراوان در تجزیه و تحلیل ژنومیک پیشرفته، تجزیه و تحلیلهای جامعی را در زمان کوتاه ارائه میدهد.
●پشتیبانی پس از فروش:تعهد ما فراتر از تکمیل پروژه است و شامل یک دوره خدمات پس از فروش ۳ ماهه میشود. در این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک در رفع مشکلات و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سوال مربوط به نتایج ارائه میدهیم.
مشخصات و الزامات خدمات
| نوع توالییابی | مقیاس جمعیتی توصیه شده | استراتژی تعیین توالی | الزامات نوکلئوتیدی |
| توالییابی کل ژنوم | ۲۰۰ نمونه | ۱۰ برابر | غلظت: ≥ ۱ نانوگرم در میکرولیتر مقدار کل ≥ 30 نانوگرم تخریب یا آلودگی محدود یا بدون تخریب یا آلودگی |
| قطعه تکثیر شده با جایگاه ژنی خاص (SLAF) | عمق برچسب: 10 برابر تعداد برچسبها: کمتر از ۴۰۰ مگابایت: WGS توصیه میشود <1 گیگابایت: 100 هزار برچسب ۱ گیگابایت > 2 گیگابایت: 300 هزار برچسب حداکثر ۵۰۰ هزار برچسب | غلظت ≥ ۵ نانوگرم در میکرولیتر مقدار کل ≥ ۸۰ نانوگرم نانودراپ OD260/280=1.6-2.5 ژل آگارز: بدون تخریب یا آلودگی یا با تخریب یا آلودگی محدود
|
انتخاب مواد
گونهها، زیرگونهها، گونههای بومی/بانکهای ژن/خانوادههای مختلط/منابع وحشی مختلف
گونهها، زیرگونهها و نژادهای محلی مختلف
خانواده ناتنی/خانواده تنی/منابع وحشی
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
توالییابی
تحلیل دادهها
خدمات پس از فروش
شامل تحلیلهای زیر است:
- تحلیل ارتباط در سطح ژنوم: مدلهای LM، LMM، EMMAX، FASTLMM
- حاشیهنویسی عملکردی ژنهای کاندید
تحلیل ارتباط SNP-صفت - نمودار منهتن
تحلیل ارتباط SNP-صفت - نمودار QQ
پیشرفتهای حاصل از خدمات de GWAS شرکت BMKGene را از طریق مجموعهای منتخب از نشریات بررسی کنید:
ال. وی، ال. و همکاران (۲۰۲۳) «بینش در مورد اساس ژنتیکی تحمل آمونیاک در صدف تیغمانند Sinonovacula constricta با استفاده از مطالعه ارتباط در سطح ژنوم»،آبزیپروری، ۵۶۹، صفحه ۷۳۹۳۵۱. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
لی، ایکس. و همکاران (2022) «تجزیه و تحلیلهای چند اُمیکس از 398 نمونه ارزن دمروباهی، نواحی ژنومی مرتبط با اهلیسازی، صفات متابولیتی و اثرات ضدالتهابی را آشکار میکند»،گیاه مولکولی، 15(8)، صص 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
لی، جی. و همکاران (۲۰۲۲) «نقشهبرداری ارتباطی در سطح ژنوم فنوتیپهای جو بدون پوست در محیط خشکسالی»،مرزهای علوم گیاهی، ۱۳، ص. ۹۲۴۸۹۲. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
ژائو، ایکس. و همکاران (2021) «GmST1 که یک سولفوترانسفراز را کد میکند، مقاومت در برابر سویههای G2 و G3 ویروس موزاییک سویا را ایجاد میکند»،گیاه، سلول و محیط زیست، 44 (8)، ص 2777-2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
