توالییابی غیرکدکننده طولانی-ایلومینا
مزایای خدمات
●تجزیه و تحلیل مشترک mRNA و lncRNAبا ترکیب کمیسازی رونوشتهای mRNA با مطالعه lncRNA و اهداف آنها، میتوان به یک مرور کلی عمیق از مکانیسم تنظیمی زیربنایی پاسخ سلولی دست یافت.
●تخصص گستردهما بیش از ۲۳۰،۰۰۰ نمونه را پردازش کردهایم که نمونهها و اهداف پروژههای متنوعی را در بر میگیرد. ما گنجینهای از تخصص را برای هر پروژه به ارمغان میآوریم.
●تجزیه و تحلیل مشترک mRNA و lncRNAما کمیسازی رونوشتهای mRNA را با مطالعه lncRNA و اهداف آنها ترکیب میکنیم و این امکان را فراهم میکنیم که یک مرور کلی عمیق از مکانیسم تنظیمی زیربنایی پاسخ سلولی داشته باشیم.
●کنترل کیفیت دقیقما نقاط کنترل اصلی را در تمام مراحل، از آمادهسازی نمونه گرفته تا تهیه کتابخانه، تعیین توالی و بیوانفورماتیک، پیادهسازی میکنیم. نظارت دقیق ما، ارائه نتایج با کیفیت بالا و مداوم را تضمین میکند.
●حاشیهنویسی جامعما از چندین پایگاه داده برای حاشیهنویسی عملکردی ژنهای بیانشدهی افتراقی (DEGs) و انجام تجزیه و تحلیلهای غنیسازی مربوطه استفاده میکنیم. این رویکرد جامع، بینشهایی را در مورد فرآیندهای سلولی و مولکولی زیربنایی پاسخ رونویسی ارائه میدهد و تضمین میکند که شما تمام اطلاعات ممکن در مورد دادههای آزمایش خود را دریافت میکنید.
●پشتیبانی پس از فروشما درک میکنیم که حضور در محل چقدر مهم است، به همین دلیل تعهد ما فراتر از تکمیل پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش ۳ ماهه است. در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک به رفع مشکلات و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سوال مربوط به نتایج ارائه میدهیم.
الزامات نمونه و تحویل
| کتابخانه | پلتفرم | دادههای توصیهشده | کنترل کیفیت دادهها |
| کتابخانه جهتدار تهیشده از rRNA | ایلومینا PE150 | ۱۰-۱۶ گیگابایت | Q30≥85٪ |
نوکلئوتیدها:
| غلظت (نانوگرم در میکرولیتر) | مقدار (میکروگرم) | خلوص | صداقت |
| ۸۰ پوند یا بیشتر | ≥ ۰.۸ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئینی یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | RIN≥6.0؛ ۵.۰≥۲۸S/۱۸S≥۱.۰؛ ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع پایه |
● گیاهان:
ریشه، ساقه یا گلبرگ: ۴۵۰ میلیگرم
برگ یا دانه: ۳۰۰ میلیگرم
میوه: ۱.۲ گرم
● حیوان:
قلب یا روده: ۴۵۰ میلیگرم
احشاء یا مغز: ۲۴۰ میلیگرم
عضله: ۶۰۰ میلیگرم
استخوان، مو یا پوست: ۱.۵ گرم
● بندپایان:
حشرات: ۹ گرم
سختپوستان: ۴۵۰ میلیگرم
● خون کامل:۲ لوله
● سلولها: 106 سلولها
● سرم و پلاسما: ۶ میلیلیتر
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف: لوله سانتریفیوژ ۲ میلیلیتری (استفاده از فویل آلومینیومی توصیه نمیشود)
برچسبگذاری نمونه: گروه + تکرار مثلاً A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
حمل و نقل:
۱. یخ خشک: نمونهها باید در کیسه بستهبندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
۲. لولههای RNA-پایدار: نمونههای RNA را میتوان در لوله تثبیت RNA (مثلاً RNA-پایدار®) خشک کرد و در دمای اتاق ارسال نمود.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
توالییابی
تحلیل دادهها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
- دادههای خام
- کنترل کیفیت دادهها
- همترازی ژنوم
- ساختار ژن (پیرایش جایگزین، بهینهسازی ساختار ژن و پیشبینی ژن جدید)
- کمیسازی بیان ژن
- تحلیل بیان افتراقی
- حاشیهنویسی و غنیسازی DEG + ژنهای هدف lncRNA با بیان افتراقی
- شناسایی رونوشت
- شناسایی lncRNA (حفاظت lncRNA و lncRNA شناخته شده)
- پیشبینی ژنهای هدف lncRNA
- کمیسازی بیان lncRNA
- تجزیه و تحلیل مشترک با دادههای mRNA
تجزیه و تحلیل بیان ژن افتراقی (DEGs)
کمیسازی بیان lncRNA - خوشهبندی
غنیسازی ژنهای هدف lncRNA
تحلیل موقعیت مشترک mRNA و lncRNA - نمودار سیرکوس (دایره میانی mRNA و دایره داخلی lncRNA است)
پیشرفتهای حاصل از خدمات تعیین توالی lncRNA شرکت BMKGene را از طریق مجموعهای منتخب از نشریات بررسی کنید.
جی، اچ. و همکاران (۲۰۲۰) «شناسایی، پیشبینی عملکردی و تأیید lncRNA کلیدی lncRNAهای مرتبط با استرس سرما در کبد موشها»،گزارشهای علمی2020 10:1، 10(1)، صفحات 1-14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
جیا، ز. و همکاران (۲۰۲۱) «آنالیز یکپارچه رونوشتشناسی، مکانیسم ایمنی یک سویه کپور معمولی مقاوم به CyHV-3 را آشکار میکند»،مرزهای ایمونولوژی، 12، ص. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
وانگ، ایکسجی و همکاران (۲۰۲۲) «اولویتبندی مبتنی بر ادغام چند اُمیکس شبکههای تنظیم RNA درونزا رقیب در سرطان ریه سلول کوچک: ویژگیهای مولکولی و کاندیداهای دارویی»،مرزهای انکولوژی، 12، ص. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
شیائو، ال. و همکاران (۲۰۲۰) «تشریح ژنتیکی شبکه همبیان ژنی دخیل در فتوسنتز در صنوبر»مجله بیوتکنولوژی گیاهی، 18(4)، صفحات 1015-1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
ژنگ، اچ. و همکاران (۲۰۲۲) «یک شبکه تنظیمی جهانی برای بیان ژن نامنظم و سیگنالینگ متابولیک غیرطبیعی در سلولهای ایمنی در ریزمحیط بیماری گریوز و تیروئیدیت هاشیموتو»،مرزهای ایمونولوژی، 13، ص. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
