توالی‌یابی mRNA (NGS) - از نو

توالی‌یابی mRNA امکان پروفایل‌بندی تمام رونوشت‌های mRNA در سلول‌ها را تحت شرایط خاص فراهم می‌کند و یک فناوری پرکاربرد در زمینه‌های تحقیقاتی مختلف است. خط لوله BMKCloud De novo mRNA-seq برای تجزیه و تحلیل کتابخانه‌های توالی‌یابی غنی‌شده با poly-A در زمانی که هیچ ژنوم مرجعی در دسترس نیست، طراحی شده است. این خط لوله با کنترل کیفیت شروع می‌شود و پس از آناز نومونتاژ رونوشت و انتخاب مجموعه تک‌ژنی. تجزیه و تحلیل ساختار تک‌ژنی، توالی کدکننده (CDS) و تکرارهای توالی ساده (SSR) را پیش‌بینی می‌کند. متعاقباً، تجزیه و تحلیل بیان افتراقی، ژن‌های با بیان افتراقی (DEGs) را در بین شرایط آزمایش‌شده پیدا می‌کند و به دنبال آن حاشیه‌نویسی عملکردی و غنی‌سازی DEGs برای استخراج بینش‌های بیولوژیکی انجام می‌شود.