توالی RNA کوچک-Illumina
امکانات
● انتخاب اندازه RNA قبل از آماده سازی کتابخانه
● تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک حول محور پیش‌بینی miRNA و اهداف آنها
مزایای خدمات
●تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیک:امکان شناسایی miRNA های شناخته شده و جدید، شناسایی اهداف miRNA ها و حاشیه نویسی عملکردی مربوطه و غنی سازی با پایگاه داده های متعدد (KEGG، GO)
●کنترل کیفیت دقیق: ما نقاط کنترل اصلی را در تمام مراحل، از آماده سازی نمونه و کتابخانه گرفته تا توالی یابی و بیوانفورماتیک پیاده سازی می کنیم.این نظارت دقیق، ارائه نتایج با کیفیت بالا را تضمین می کند.
●پشتیبانی پس از فروش: تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش 3 ماهه است.در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک عیب‌یابی، و جلسات پرسش و پاسخ را برای پاسخگویی به هرگونه سؤال مرتبط با نتایج ارائه می‌دهیم.
●تخصص گسترده: با سابقه موفقیت آمیز بستن پروژه های متعدد sRNA که بیش از 100 گونه در حوزه های تحقیقاتی مختلف را پوشش می دهد، تیم ما تجربه زیادی را برای هر پروژه به ارمغان می آورد.
نمونه مورد نیاز و تحویل
| کتابخانه | سکو | داده های توصیه شده | QC داده ها |
| اندازه انتخاب شده است | ایلومینا SE50 | 10M-20M خوانده شده | Q30≥85% |
نمونه مورد نیاز:
نوکلئوتیدها:
| Conc.(ng/μl) | مقدار (μg) | خلوص | تمامیت |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع |
● گیاهان:
ریشه، ساقه یا گلبرگ: 450 میلی گرم
برگ یا دانه: 300 میلی گرم
میوه: 1.2 گرم
● حیوان:
قلب یا روده: 450 میلی گرم
احشاء یا مغز: 240 میلی گرم
عضله: 600 میلی گرم
استخوان، مو یا پوست: 1.5 گرم
● بندپایان:
حشرات: 9 گرم
سخت پوستان: 450 میلی گرم
● خون کامل: 2 لوله
● سلول ها: 106 سلول ها
● سرم و پلاسما:6 میلی لیتر
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف:
لوله سانتریفیوژ 2 میلی لیتری (فیل قلع توصیه نمی شود)
برچسب زدن نمونه: گروه + تکرار به عنوان مثال A1، A2، A3.B1، B2، B3...
حمل و نقل:
1. یخ خشک: نمونه ها باید در کیسه های بسته بندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
لوله های پایدار RNA: نمونه های RNA را می توان در لوله تثبیت کننده RNA (به عنوان مثال RNAstable®) خشک کرد و در دمای اتاق حمل کرد.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
ترتیب دهی
تحلیل داده ها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
شناسایی miRNA: ساختار و عمق
بیان دیفرانسیل miRNA - خوشه بندی سلسله مراتبی
حاشیه نویسی عملکردی هدف miRNA های بیان شده متفاوت
پیشرفت‌های تحقیقاتی تسهیل‌شده توسط سرویس‌های توالی‌یابی sRNA BMKGene را از طریق مجموعه‌ای از انتشارات بررسی کنید.
چن، اچ و همکاران.(2023) "عفونت های ویروسی بیوسنتز و فتوسنتز ساپونین را در Panax notoginseng مهار می کنند"، فیزیولوژی گیاهی و بیوشیمی، 203، ص.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
لی، اچ و همکاران(2023) "پروتئین FREE1 حاوی دامنه FYVE گیاهی با اجزای ریزپردازنده برای سرکوب بیوژنز miRNA مرتبط است"، گزارش EMBO، 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
یو، جی و همکاران(2023) "MicroRNA Ame-Bantam-3p رشد شفیرگی لارو را با هدف قرار دادن ژن 8 فاکتور رشد چندگانه اپیدرمی (megf8) در زنبور عسل، Apis mellifera، کنترل می کند، مجله بین المللی علوم مولکولی، 24(6)، ص .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
ژانگ، ام. و همکاران.(2018) "تحلیل یکپارچه MiRNA و ژن های مرتبط با کیفیت گوشت نشان می دهد که Gga-MiR-140-5p بر رسوب چربی داخل عضلانی در جوجه ها تأثیر می گذارد"، فیزیولوژی سلولی و بیوشیمی، 46(6)، صفحات 2421-2433.doi: 10.1159/000489649.
