توالییابی RNA کوچک - ایلومینا
ویژگیها
● آمادهسازی کتابخانه انتخاب اندازه.
● تحلیل بیوانفورماتیکی حول محور پیشبینی و اهداف miRNA.
مزایای خدمات
●تخصص گستردهما بیش از ۳۰۰ نمونه را پردازش کردهایم که شامل انواع مختلفی از نمونهها میشود. ما گنجینهای از تخصص را برای هر پروژه به ارمغان میآوریم.
●کنترل کیفیت دقیقما نقاط کنترل اصلی را در تمام مراحل، از آمادهسازی نمونه گرفته تا تهیه کتابخانه، تعیین توالی و بیوانفورماتیک، پیادهسازی میکنیم. نظارت دقیق ما، ارائه نتایج با کیفیت بالا و مداوم را تضمین میکند.
●تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیک:این امکان شناسایی miRNA های شناخته شده و جدید، شناسایی اهداف miRNA ها و حاشیه نویسی عملکردی مربوطه و غنی سازی با پایگاه های داده چندگانه (KEGG، GO) را فراهم می کند.
●پشتیبانی پس از فروشما درک میکنیم که حضور در محل چقدر مهم است، به همین دلیل تعهد ما فراتر از تکمیل پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش ۳ ماهه است. در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک به رفع مشکلات و جلسات پرسش و پاسخ را برای رسیدگی به هرگونه سوال مربوط به نتایج ارائه میدهیم.
الزامات نمونه و تحویل
| کتابخانه | پلتفرم | دادههای توصیهشده | کنترل کیفیت دادهها |
| اندازه انتخاب شده | ایلومینا SE50 | ۱۰ تا ۲۰ میلیون بار خوانده شده | Q30≥85٪ |
الزامات نمونه:
نوکلئوتیدها:
| غلظت (نانوگرم در میکرولیتر) | مقدار (میکروگرم) | خلوص | صداقت |
| ۸۰ پوند یا بیشتر | ≥ ۰.۸ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئینی یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | RIN≥6.0؛ ۵.۰≥۲۸S/۱۸S≥۱.۰؛ ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع پایه |
● گیاهان:
ریشه، ساقه یا گلبرگ: ۴۵۰ میلیگرم
برگ یا دانه: ۳۰۰ میلیگرم
میوه: ۱.۲ گرم
● حیوان:
قلب یا روده: ۴۵۰ میلیگرم
احشاء یا مغز: ۲۴۰ میلیگرم
عضله: ۶۰۰ میلیگرم
استخوان، مو یا پوست: ۱.۵ گرم
● بندپایان:
حشرات: ۹ گرم
سختپوستان: ۴۵۰ میلیگرم
● خون کامل: ۲ لوله
● سلولها: 106 سلولها
● سرم و پلاسما:۶ میلیلیتر
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف: لوله سانتریفیوژ ۲ میلیلیتری (استفاده از فویل آلومینیومی توصیه نمیشود)
برچسبگذاری نمونه: گروه + تکرار مثلاً A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
حمل و نقل:
۱. یخ خشک: نمونهها باید در کیسه بستهبندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
۲. لولههای RNA-پایدار: نمونههای RNA را میتوان در لوله تثبیت RNA (مثلاً RNA-پایدار®) خشک کرد و در دمای اتاق ارسال نمود.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
توالییابی
تحلیل دادهها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
● کنترل کیفیت دادههای خام
● طبقهبندی RNA کوچک
● بیان miRNA و آنالیز بیان افتراقی
● حاشیهنویسی ژن هدف miRNA و ژن هدف miRNA با بیان افتراقی
● حاشیهنویسی ژن هدف و غنیسازی عملکرد ژن miRNA با بیان افتراقی
شناسایی miRNA: ساختار و عمق
بیان افتراقی miRNA - خوشهبندی سلسله مراتبی
حاشیهنویسی عملکردی هدف miRNAهای با بیان متفاوت
پیشرفتهای تحقیقاتی حاصل از خدمات توالییابی sRNA شرکت BMKGene را از طریق مجموعهای منتخب از نشریات، بررسی کنید.
چن، اچ. و همکاران (2023) «عفونتهای ویروسی مانع از بیوسنتز ساپونین و فتوسنتز در Panax notoginseng میشوند»،فیزیولوژی و بیوشیمی گیاهی، ۲۰۳، ص. ۱۰۸۰۳۸. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
لی، اچ. و همکاران (2023) «پروتئین FREE1 حاوی دامنه FYVE گیاهی با اجزای ریزپردازنده برای سرکوب بیوژنز miRNA مرتبط میشود»،گزارشهای EMBO، 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
یو، جی. و همکاران (2023) «ریز RNA Ame-Bantam-3p با هدف قرار دادن ژن دامنههای 8 شبه فاکتور رشد اپیدرمی چندگانه (megf8) در زنبور عسل، Apis mellifera، رشد شفیره لارو را کنترل میکند.»مجله بینالمللی علوم مولکولی، 24(6)، صفحه 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
ژانگ، م. و همکاران (۲۰۱۸) «تجزیه و تحلیل یکپارچهی miRNA و ژنهای مرتبط با کیفیت گوشت نشان میدهد که Gga-MiR-140-5p بر رسوب چربی درون عضلانی در مرغها تأثیر میگذارد»،فیزیولوژی سلولی و بیوشیمی، 46 (6)، ص 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
