-
تعیین توالی mRNA تمام طول-Nanopore
توالی یابی RNA یک ابزار ارزشمند برای تجزیه و تحلیل جامع رونوشت بوده است.بدون شک، توالی خوانی کوتاه سنتی در اینجا به پیشرفت های مهم متعددی دست یافت.با این وجود، اغلب با محدودیت هایی در شناسایی ایزوفرم های تمام قد، کمی سازی، بایاس PCR مواجه می شود.
توالی‌یابی نانوحفره‌ها خود را از سایر پلت‌فرم‌های توالی‌یابی متمایز می‌کند، زیرا نوکلئوتیدها مستقیماً بدون سنتز DNA خوانده می‌شوند و خواندن طولانی در ده‌ها کیلو باز ایجاد می‌کنند.این امر به خواندن مستقیم رونوشت های تمام طول و مقابله با چالش ها در مطالعات سطح ایزوفرم قدرت می دهد.
سکو：پرومتیون نانوپور
کتابخانه:cDNA-PCR
-
توالی نویسی تمام طول رونوشت جدید - PacBio
نوتوالی رونویسی تمام قد که به آن نیز می گویندنوIso-Seq از مزایای توالی‌سنجی PacBio در طول خواندن استفاده می‌کند، که توالی‌یابی مولکول‌های cDNA تمام طول را بدون هیچ گونه شکستی امکان‌پذیر می‌سازد.این به طور کامل از هرگونه خطای ایجاد شده در مراحل مونتاژ رونوشت جلوگیری می کند و مجموعه های unigene را با وضوح در سطح ایزوفرم می سازد.این مجموعه یونیژن اطلاعات ژنتیکی قدرتمندی را به عنوان "ژنوم مرجع" در سطح رونوشت ارائه می کند.علاوه بر این، ترکیب با داده های توالی یابی نسل بعدی، این سرویس یک کمی سازی دقیق بیان سطح ایزوفرم را امکان پذیر می کند.
پلتفرم: PacBio Sequel IIکتابخانه: کتابخانه زنگ SMRT -
توالی mRNA یوکاریوتی - ایلومینا
توالی یابی mRNA، پروفایل تمام mRNA های رونویسی شده از سلول ها را در شرایط خاص امکان پذیر می کند.این یک فناوری قدرتمند برای آشکار کردن مشخصات بیان ژن، ساختارهای ژنی و مکانیسم‌های مولکولی فرآیندهای بیولوژیکی خاص است.تا به امروز، تعیین توالی mRNA به طور گسترده در تحقیقات بنیادی، تشخیص بالینی، توسعه دارو و غیره استفاده شده است.
پلتفرم: Illumina NovaSeq 6000
-
توالی mRNA مبتنی بر غیر مرجع-Illumina
توالی یابی mRNA از تکنیک توالی یابی نسل بعدی (NGS) برای گرفتن RNA پیام رسان (mRNA) از یوکاریوت در دوره خاصی که برخی از عملکردهای خاص فعال می شوند، استفاده می کند.طولانی‌ترین رونوشت متصل شده "Unigene" نام داشت و به عنوان دنباله مرجع برای تجزیه و تحلیل بعدی استفاده شد، که ابزاری موثر برای مطالعه مکانیسم مولکولی و شبکه تنظیمی گونه‌ها بدون مرجع است.
پس از مونتاژ داده رونوشت و حاشیه نویسی عملکردی یونیژن
(1) تجزیه و تحلیل SNP، تجزیه و تحلیل SSR، پیش بینی CDS و ساختار ژن از قبل ساخته خواهد شد.
(2) کمی سازی بیان یونیژن در هر نمونه انجام خواهد شد.
(3) یونی ژن های بیان شده متفاوت بین نمونه ها (یا گروه ها) بر اساس بیان یونی ژن کشف می شود
(4) خوشه بندی، حاشیه نویسی عملکردی و تجزیه و تحلیل غنی سازی ژن های متفاوت بیان شده انجام خواهد شد
-
توالی بدون کدگذاری طولانی-Illumina
RNA های طولانی غیر کد کننده (lncRNAs) نوعی مولکول RNA با طول بیش از 200 nt هستند که با پتانسیل کدگذاری بسیار کم مشخص می شوند.LncRNA، به عنوان یک عضو کلیدی در RNA های غیر کدکننده، عمدتاً در هسته و پلاسما یافت می شود.توسعه فناوری توالی یابی و بیوانفورمتیک شناسایی تعداد زیادی lncRNA جدید و مرتبط کردن آنها با عملکردهای بیولوژیکی را امکان پذیر می کند.شواهد انباشته نشان می دهد که lncRNA به طور گسترده در تنظیم اپی ژنتیک، تنظیم رونویسی و تنظیم پس از رونویسی نقش دارد.
-
توالی RNA کوچک-Illumina
RNA کوچک به دسته‌ای از مولکول‌های RNA غیرکدکننده اطلاق می‌شود که معمولاً طولی کمتر از 200nt دارند، از جمله micro RNA (miRNA)، RNA تداخلی کوچک (siRNA)، و RNA برهمکنش piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) یک کلاس از RNA های کوچک درون زا با طول حدود 20-24nt است که نقش های تنظیمی مهمی را در سلول ها ایفا می کند.miRNA در بسیاری از فرآیندهای زندگی نقش دارد که بیانگر بافت - خاص و مرحله ای - خاص است و در گونه های مختلف بسیار حفظ شده است.
-
توالی یابی circRNA-Illumina
توالی یابی کل رونویسی برای نمایه کردن انواع مولکول های RNA، از جمله RNA های کد کننده (mRNA) و غیر کد کننده (شامل lncRNA، circRNA و miRNA) طراحی شده است که توسط سلول های خاص در زمان معینی رونویسی می شوند.توالی یابی کل رونوشت، همچنین به عنوان "توالی RNA کل" شناخته می شود، با هدف آشکار کردن شبکه های نظارتی جامع در سطح رونوشت است.با بهره گیری از فناوری NGS، توالی هایی از کل محصولات رونوشت برای آنالیز ceRNA و آنالیز RNA مفصلی در دسترس هستند که اولین گام را به سمت خصوصیات عملکردی فراهم می کند.آشکارسازی شبکه تنظیمی ceRNA مبتنی بر circRNA-miRNA-mRNA.
-
توالی رونوشت کامل - ایلومینا
توالی یابی کل رونویسی برای نمایه کردن انواع مولکول های RNA، از جمله RNA های کد کننده (mRNA) و غیر کد کننده (شامل lncRNA، circRNA و miRNA) طراحی شده است که توسط سلول های خاص در زمان معینی رونویسی می شوند.توالی یابی کل رونوشت، همچنین به عنوان "توالی RNA کل" شناخته می شود، با هدف آشکار کردن شبکه های نظارتی جامع در سطح رونوشت است.با بهره گیری از فناوری NGS، توالی هایی از کل محصولات رونوشت برای آنالیز ceRNA و آنالیز RNA مفصلی در دسترس هستند که اولین گام را به سمت خصوصیات عملکردی فراهم می کند.آشکارسازی شبکه تنظیمی ceRNA مبتنی بر circRNA-miRNA-mRNA.
-
تعیین توالی RNA پروکاریوتی
توالی یابی RNA پروکاریوتی از توالی یابی نسل بعدی (NGS) برای نشان دادن حضور و کمیت RNA در یک لحظه معین، با تجزیه و تحلیل رونوشت سلولی در حال تغییر استفاده می کند.توالی یابی RNA پروکاریوتی شرکت ما، به طور خاص پروکاریوت هایی با ژنوم مرجع را هدف قرار می دهد، که پروفایل رونویسی، تجزیه و تحلیل ساختار ژن، و غیره را در اختیار شما قرار می دهد. این به طور گسترده در تحقیقات علوم پایه، تحقیق و توسعه دارو، و موارد دیگر استفاده شده است.
پلتفرم: Illumina NovaSeq 6000
-
توالی یابی متاترانسکیپتوم
توالی‌یابی متاترانسکریپتوم بیان ژن میکروب‌ها (هم یوکاریوت‌ها و هم پروکاریوت‌ها) را در محیط‌های طبیعی (مانند خاک، آب، دریا، مدفوع و روده) شناسایی می‌کند. به طور خاص، این خدمات به شما امکان می‌دهد تا پروفایل بیان ژن کل جوامع پیچیده میکروبی، تجزیه و تحلیل طبقه‌بندی را به دست آورید. از گونه‌ها، تجزیه و تحلیل غنی‌سازی عملکردی ژن‌های با بیان متفاوت، و موارد دیگر.
پلتفرم: Illumina NovaSeq 6000
