Bakteerien täydellinen genomi
Palvelun edut
● Saatavilla useita sekvensointistrategioita eri tutkimustavoitteita varten
● Bakteerien täydellinen genomi, jossa 0 Gap taattu.
● Kokemus bakteerien genomin kokoamisesta ja koottu yli 10 000 täydellistä genomia.
● Ammattimainen myynnin jälkeinen tekninen tukiryhmä, joka täyttää tarkemmat tutkimustarpeet.
Palvelun tiedot
| Jaksotusstrategia | Kirjasto | Laatu taattu | Arvioitu läpimenoaika |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 väli | 30 päivää |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformatiikan analyysit
● Raakatietojen laadunvalvonta
● Genomin kokoonpano
● Genomikomponenttianalyysi
● Geenifunktion huomautus
● Vertaileva genomianalyysi
Näytevaatimukset ja toimitus
Esimerkkivaatimukset:
vartenDNA-uutteet:
| Näytteen tyyppi | Määrä | Keskittyminen | Puhtaus |
| DNA-uutteet | ＞ 2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280 = 1,6-2,5 |
Kudosnäytteitä varten:
| Näytetyyppi | Suositeltu näytekäsittely | Näytteiden varastointi ja lähetys |
| Bakteerit | Tarkkaile bakteereja mikroskoopilla ja kerää bakteereja niiden eksponentiaalisessa vaiheessa Siirrä bakteeriviljelmä (sisältää noin 3-4,5e9 solua) 1,5 tai 2 ml:n eppendorfiin.(Pysy jäällä) Sentrifugoi putkea 1 minuutin ajan 14 000 g:ssä bakteerien keräämiseksi ja supernatantin poistamiseksi varovasti Sulje putki ja pakasta bakteerit nestetypessä vähintään 30 minuuttia.Säilytä putki -80 ℃ jääkaapissa. | Pakasta näytteet nestetypessä 3-4 tuntia ja säilytä nestetypessä tai -80 asteessa pitkäaikaiseen varaukseen.Näytetoimitus kuivajäällä vaaditaan. |
Palvelun työnkulku
Näytteen toimitus
Kirjaston rakentaminen
Jaksotus
Tietojen analysointi
Myynnin jälkeiset palvelut
1.Circos of Bakteerien genomi
2. Koodaavan geenin ennuste
3. Vertaileva genomiikkaanalyysi: fylogeneettinen puu
