Bakteerien ja sienten koko genomin uudelleensekvensointi
Bakteerien ja sienten koko genomin uudelleensekvensointiprojektit ovat keskeisiä mikrobigenomiikan edistämisessä mahdollistamalla mikrobigenomien täydentämisen ja vertailun. Tämä helpottaa fermentointitekniikkaa, teollisten prosessien optimointia ja sekundääristen aineenvaihduntareittien tutkimista. Lisäksi sienten ja bakteerien uudelleensekvensointi on ratkaisevan tärkeää ympäristöön sopeutumisen ymmärtämisessä, kantojen optimoinnissa ja geneettisen evoluutiodynamiikan paljastamisessa, millä on laajat vaikutukset lääketieteeseen, maatalouteen ja ympäristötieteeseen.
Palvelun edut
●Bioinformaattinen analyysi sisältää vaihtoehtokutsun:Tarjoaa toiminnallisia näkemyksiä uudelleen sekvensoiduista genomeista.
● Laaja asiantuntemus: Vuosittain toteutettavilla tuhansilla mikrobien uudelleensekvensointiprojekteilla tuomme mukanamme yli vuosikymmenen kokemuksen, erittäin ammattitaitoisen analyysitiimin, kattavan sisällön ja erinomaisen myynnin jälkeisen tuen.
●Myynnin jälkeinen tuki:Sitoumuksemme ulottuu projektin valmistumisen lisäksi 3 kuukauden myynninjälkeiseen palvelujaksoon. Tänä aikana tarjoamme projektin seurantaa, vianetsintäapua ja Q&A-istuntoja vastataksemme kaikkiin tuloksiin liittyviin kyselyihin.
Palvelun tiedot
| Sekvensointialusta | Sekvensointistrategia | Tietoja suositellaan | Laadunvalvonta |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Syvyys 100x | Q30≥85 % |
Esimerkkivaatimukset
| Pitoisuus (ng/µL) | Kokonaismäärä (ng) | Tilavuus (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakteerit: ≥1x107 soluja
Yksisoluiset sienet: ≥5x106-1x107 soluja
Makrosienet: ≥4g
Palvelun työnkulku
Näytteen toimitus
Kirjaston rakentaminen
Sekvensointi
Tietojen analysointi
Myynnin jälkeiset palvelut
Sisältää seuraavan analyysin:
- Sekvensointitietojen laadunvalvonta
- Kohdistus vertailugenomiin
- Vaihtoehtokutsu: SNP ja InDel
- Variant Annotation
Varianttien kutsuminen: SNP-tyypit
Variantin kutsu: InDel-pituusjakauma
Tutustu BMKGenen mikrobigenomin uudelleensekvensointipalvelujen tuomiin edistyksiin kuratoidun julkaisukokoelman avulla.
Jia, Y. et ai. (2023) "Transkriptomin ja koko genomin uudelleensekvensoinnin yhdistäminen tautiresistenssigeenien seulomiseksi vehnäkääpiöpuvulle",Kansainvälinen molekyylitieteiden lehti, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et ai. (2023) "Ampisilliinin ohjaama glukoosiaineenvaihdunta manipuloi siirtymistä toleranssista resistenssiin bakteerissa",Tiede edistyy, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et ai. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., haloalkalofiilinen bakteeri, joka on eristetty soodajärvestä Sisä-Mongolian autonomisella alueella, Kiinassa', Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, s. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. ja Wang, G.-H. (2024) "Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a:n genomisekvenssi, eristetty Nasonia vitripennisistä",Mikrobiologian resurssiilmoitukset. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
