BMKCloud Log in
条形banneri-03

Tuotteet

Illumina ja BGI

Illumina-sekvensointitekniikka, joka perustuu Sequencing by Synthesis (SBS) -tekniikkaan, on maailmanlaajuisesti hyväksytty NGS-innovaatio, joka tuottaa yli 90 % maailman sekvensointitiedoista.SBS:n periaatteessa kuvataan fluoresoivasti leimattuja palautuvia terminaattoreita, kun kutakin dNTP:tä lisätään, ja sen jälkeen pilkkotaan seuraavan emäksen sisällyttämisen mahdollistamiseksi.Kun kaikki neljä palautuvaa terminaattoriin sitoutunutta dNTP:tä ovat läsnä kussakin sekvensointisyklissä, luonnollinen kilpailu minimoi inkorporaatiovirheen.Tämä monipuolinen tekniikka tukee sekä yksilukuisia että parillisia kirjastoja, jotka palvelevat erilaisia ​​genomisovelluksia.Illumina-sekvensoinnin korkean suorituskyvyn ja tarkkuuden ansiosta se on genomiikan tutkimuksen kulmakive, mikä antaa tutkijoille mahdollisuuden selvittää genomien monimutkaisuutta vertaansa vailla yksityiskohtaisesti ja tehokkaasti.

BGI:n kehittämä DNBSEQ on toinen innovatiivinen NGS-tekniikka, joka on onnistunut vähentämään sekvensointikustannuksia entisestään ja lisäämään suorituskykyä.DNBSEQ-kirjastojen valmistaminen sisältää DNA-fragmentoinnin, ssDNA:n valmistuksen ja pyörivän ympyrän monistamisen DNA-nanopallojen (DNB) saamiseksi.Nämä ladataan sitten kiinteälle pinnalle ja sekvensoidaan sen jälkeen kombinatorisella koetin-ankkurisynteesillä (cPAS).

Valmiiksi tehty kirjaston sekvensointipalvelumme auttaa asiakkaita valmistamaan sekvensointikirjastojaan eri lähteistä (mm. mRNA, koko genomi, amplikoni).Myöhemmin nämä kirjastot voidaan toimittaa sekvensointikeskuksillemme laadunvalvontaa ja sekvensointia varten Illumina- tai BGI-alustoilla.


Palvelun tiedot

Demo tulos

ominaisuudet

Alustat:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten ja BGI-DNB-T7

Sekvensointitilat:PE50, PE100, PE150, PE250

Kirjastojen laadunvalvonta ennen sekvensointia

Sekvensointitietojen toimitus ja laadunvalvonta:QC-raportin ja raakadatan toimitus fastq-muodossa demultipleksoinnin ja Q30-lukujen suodatuksen jälkeen.

 

Palvelun edut

Sekvensointipalveluiden monipuolisuus:asiakas voi valita järjestyksen kaistan, virtaussolun tai datamäärän mukaan.

Alustaen monipuolisuus:DNB-kirjastot voidaan siirtää Illumina-alustoille

Laaja kokemus Illumina-sekvensointialustasta:tuhansia suljettuja projekteja eri lajien kanssa. 

Sekvensoinnin laadunvalvontaraportin toimitus:laatumittareiden, tietojen tarkkuuden ja sekvensointiprojektin yleisen suorituskyvyn kanssa.

Aikuinen sekvensointiprosessi:lyhyellä läpimenoajalla.

Tiukka laadunvalvonta: Noudatamme tiukkoja laadunvalvontavaatimuksia varmistaaksemme jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimituksen.

Esimerkkivaatimukset*

Osittainen kaistajärjestys

Tietojen määrä (X)

Pitoisuus (qPCR/nM)

Äänenvoimakkuus

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Yksikaistainen (Illumina)

Alusta

Pitoisuus (qPCR/nM)

Äänenvoimakkuus

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Konsentraation ja kokonaismäärän lisäksi tarvitaan myös sopiva huippukuvio.

 

Ota meihin yhteyttä, jos näytteesi eivät täytä lähtöainevaatimuksia.

Palvelun työnkulku

näytteen valmistus

Kirjaston laadunvalvonta

Jaksotus

Jaksotus

Tietojen analysointi

Tietojen laadunvalvonta

Näyte QC

Projektin toimitus


  • Edellinen:
  • Seuraava:

  • Kirjaston laadunvalvontaraportti

    Raportti kirjaston laadusta tarjotaan ennen sekvensointia, kirjaston määrän ja pirstoutumisen arviointia.

     

    Sekvensointi QC-raportti

     

    Taulukko 1. Sekvensointitietojen tilastot.

    Esimerkki ID

    BMKID

    Raakoja lukemia

    Raakadata (bp)

    Puhtaat lukemat (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96,48

    99.14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4,415,360,100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Kuva 1. Laatujakauma kunkin näytteen lukemien mukaan

    A9

    Kuva 2. Perussisällön jakelu

    A10

    Kuva 3. Lukujen sisällön jakautuminen sekvensointitiedoissa

    A11

     

    saada tarjous

    Kirjoita viestisi tähän ja lähetä se meille

    Lähetä viestisi meille: