BMKCloud Log in
条形banneri-03

Tuotteet

DNA/RNA-sekvensointi – Nanopore-sekvensointilaite

ONT-sekvensointi on yhden molekyylin reaaliaikainen sähkösignaalin sekvensointitekniikka, joka perustuu nanohuokosiin, jokaisen alustan sekvensointiperiaate on sama.Kaksijuosteinen DNA/RNA sitoutuu biofilmiin upotettuun nanohuokoiseen proteiiniin, joka purkautuu moottoriproteiinin johdolla, biofilmin molemmilta puolilta tulevan jännite-eron vaikutuksesta DNA/RNA-säikeet kulkevat nanohuokoskanavaproteiinin läpi tietyssä pisteessä. korko.DNA/RNA-juosteen eri emästen kemiallisten ominaisuuksien eroista johtuen, kun yksittäinen emäs tai DNA-molekyyli kulkee nanohuokoskanavan läpi, se aiheuttaa erilaisten sähköisten signaalien muutoksen.Näitä signaaleja havaitsemalla ja vastaamalla voidaan laskea vastaavat kantatyypit ja suorittaa sekvenssin reaaliaikainen ilmaisu.


Palvelun tiedot

Demo tulos

Palvelun tiedot Ominaisuudet

Alusta

Kirjaston koko

Teoreettinen datan tuotto (solua kohti)

Yhden pohjan tarkkuus

Sovellukset

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/solu

85-92 %

SV-kutsu, De novo, Täyspitkä sekvensointi, Iso-Seq, Geenimerkintä, DNA-metylaation havaitseminen

Palvelun edut

● Yli 5 vuoden kokemus PacBio-sekvensointialustasta, jossa on tuhansia suljettuja projekteja eri lajeilla.
● BMKGENE on Oxford Nanoporen virallinen kumppani, jolla on kaksialustainen RNA/DNA-sertifiointi.
● On olemassa yleisiä sekvenssereitä, joissa on täydellinen varustus ja riittävä sekvensointikapasiteetti.
● Nanopore-alustaan ​​perustuen yli 10 Denovon eläin- ja kasvitutkimusta on julkaistu kansainvälisesti tunnetuissa aikakauslehdissä.

Esimerkkivaatimukset


Näytteen tyyppi

Määrä

Keskittyminen (Qubit ®)

Äänenvoimakkuus

Puhtaus

muut

Genominen DNA

Riippuu tietovaatimuksista

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Kirkas piikki 260 nm:ssä, ei kontaminaatioita

Pitoisuus on mitattava arvoilla Qubit ja Qubit/Nanopore ≤ 2

Kokonais-RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;ei kontaminaatioita

RIN-arvo ≥7,5

 

Palvelun työnkulku

näytteen valmistus

näytteen valmistus

Kirjaston valmistelu

Kirjaston rakentaminen

Jaksotus

Jaksotus

Tietojen analysointi

Tietojen analysointi

Näyte QC

Projektin toimitus


  • Edellinen:
  • Seuraava:

  • DNA-näytteen tietojen laadun arviointi

    Taulukko 1. Puhtaiden tietojen tilastot.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    puhdasN50Len

    puhdasN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    RNA-näytteen tietojen laadun arviointi

    Taulukko 1. Puhtaiden tietojen tilastot.

    Tiedoston nimi

    Asiakastunnus

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    MeanLength

    Maksimi pituus

    Keskimääräinen Qscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Kuva 1. Lue pituusjakauma

    A3

    Kuva 2. Puhtaiden tietojen laatupisteiden jakauma

    A4

    Kuva 3. Puhtaiden tietojen pituus- ja laatupistejakauma

    A5

    saada tarjous

    Kirjoita viestisi tähän ja lähetä se meille

    Lähetä viestisi meille: