●Alusta:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvensointitilat:PE150
●Illumina-kirjastojen siirtoMGI:mahdollistaa suurten tietomäärien sekvensoinnin alhaisin kustannuksin.
●Kirjastojen laadunvalvonta ennen sekvensointia.
●Sekvensointidatan laadunvalvonta ja toimitus:Laadunvalvontaraportin ja raakadatan toimitus fastq-muodossa Q30-lukemien demultipleksoinnin ja suodatuksen jälkeen.
●Sekvensointipalveluiden monipuolisuus:Asiakas voi valita järjestyksen kaistan tai datamäärän mukaan.
●Suuri datalähtö:1500 Gb/kaista
●Sekvensoinnin laadunvalvontaraportin toimitus:laatumittareiden, datan tarkkuuden ja sekvensointiprojektin kokonaissuorituskyvyn kanssa.
●Kypsä sekvensointiprosessi:lyhyellä läpimenoajalla.
●Tiukka laadunvalvontaNoudatamme tiukkoja laadunvalvontavaatimuksia taataksemme jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen.
| Tietomäärä (X) | Pitoisuus (qPCR/nM) | Äänenvoimakkuus | |
| Osittainen kaista
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gt < X ≤ 50 Gt | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gt < X ≤ 100 Gt | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gt | ≥ 4 nM | ||
| Yksi kaista | Kaistaa kohden | ≥ 1,5 nM / kirjastopooli | ≥ 25 μl / kirjastopooli |
Pitoisuuden ja kokonaismäärän lisäksi tarvitaan myös sopiva piikkikuvio.
Huomautus: Alhaisen monimuotoisuuden kirjastojen kaistasekvensointi vaatii PhiX-täydennyksen luotettavan emästunnistuksen varmistamiseksi.
Suosittelemme lähettämään esiyhdistetyt kirjastot näytteinä. Jos BMKGENE:n on suoritettava kirjastojen yhdistäminen, katso kirjaston vaatimukset osittaisesta kaistojen sekvensoinnista.
Pääpiikin tulisi olla 300–450 bp:n välillä.
Kirjastoissa tulisi olla yksi pääpiikki, ei adapterikontaminaatiota eikä alukedimeerejä.
Kirjaston laatua koskeva raportti toimitetaan ennen sekvensointia, kirjaston määrän arviointia ja fragmentoitumista.
Taulukko 1. Sekvensointidatan tilastotiedot.
| Näytetunnus | BMKID | Raa'at lukemat | Raakadata (bp) | Puhtaat lukemat (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | Yleinen viljely (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Kuva 1. Laadun jakautuminen lukemien mukaan kussakin otoksessa
Kuva 2. Perussisällön jakauma
Kuva 3. Luetun sisällön jakautuminen sekvensointidatassa