条形banneri-03

Tuotteet

DNBSEQ-valmiit kirjastot

MGI:n kehittämä DNBSEQ on innovatiivinen NGS-teknologia, jolla on onnistuttu alentamaan sekvensointikustannuksia entisestään ja lisäämään suorituskykyä. DNBSEQ-kirjastojen valmisteluun kuuluu DNA:n fragmentointi, yksisäikeisen DNA:n valmistelu ja pyörivän ympyrän monistus DNA-nanopallojen (DNB) saamiseksi. Nämä ladataan sitten kiinteälle alustalle ja sekvensoidaan kombinatorisella koetin-ankkurisynteesillä (cPAS). DNBSEQ-teknologia yhdistää alhaisen monistusvirhesuhteen edut nanopallojen korkeatiheyksisten virhekuvioiden käyttöön, mikä johtaa sekvensointiin suuremmalla suorituskyvyllä ja tarkkuudella.

Valmiiksi tehtyjen kirjastojen sekvensointipalvelumme avulla asiakkaat voivat valmistaa Illumina-sekvensointikirjastoja erilaisista lähteistä (muun muassa mRNA, koko genomi, amplikoni, 10x-kirjastot). Nämä muunnetaan laboratorioissamme MGI-kirjastoiksi DNBSEQ-T7-sekvensointia varten. Tämä mahdollistaa suurten tietomäärien saamisen alhaisemmilla kustannuksilla.


Palvelun tiedot

Demotulos

Ominaisuudet

Alusta:MGI-DNBSEQ-T7

Sekvensointitilat:PE150

Illumina-kirjastojen siirtoMGI:mahdollistaa suurten tietomäärien sekvensoinnin alhaisin kustannuksin.

Kirjastojen laadunvalvonta ennen sekvensointia.

Sekvensointidatan laadunvalvonta ja toimitus:Laadunvalvontaraportin ja raakadatan toimitus fastq-muodossa Q30-lukemien demultipleksoinnin ja suodatuksen jälkeen.

 

Edut

Sekvensointipalveluiden monipuolisuus:Asiakas voi valita järjestyksen kaistan tai datamäärän mukaan.

Suuri datalähtö:1500 Gb/kaista

Sekvensoinnin laadunvalvontaraportin toimitus:laatumittareiden, datan tarkkuuden ja sekvensointiprojektin kokonaissuorituskyvyn kanssa.

Kypsä sekvensointiprosessi:lyhyellä läpimenoajalla.

Tiukka laadunvalvontaNoudatamme tiukkoja laadunvalvontavaatimuksia taataksemme jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen.

 

Näytteen vaatimukset

 

Tietomäärä (X)

Pitoisuus (qPCR/nM)

Äänenvoimakkuus

Osittainen kaista

   

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gt < X ≤ 50 Gt

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gt < X ≤ 100 Gt

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gt

≥ 4 nM

 

Yksi kaista

Kaistaa kohden

≥ 1,5 nM / kirjastopooli

≥ 25 μl / kirjastopooli

Pitoisuuden ja kokonaismäärän lisäksi tarvitaan myös sopiva piikkikuvio.

Huomautus: Alhaisen monimuotoisuuden kirjastojen kaistasekvensointi vaatii PhiX-täydennyksen luotettavan emästunnistuksen varmistamiseksi.

Suosittelemme lähettämään esiyhdistetyt kirjastot näytteinä. Jos BMKGENE:n on suoritettava kirjastojen yhdistäminen, katso kirjaston vaatimukset osittaisesta kaistojen sekvensoinnista.

Kirjaston koko (huippukartta)

Pääpiikin tulisi olla 300–450 bp:n välillä.

Kirjastoissa tulisi olla yksi pääpiikki, ei adapterikontaminaatiota eikä alukedimeerejä.

Palvelun työnkulku

näytteen-valmistus-
Sekvensointi
Data-analyysi
Näyte-laadunvalvonta

  • Edellinen:
  • Seuraavaksi:

  • Kirjaston laadunvalvontaraportti

    Kirjaston laatua koskeva raportti toimitetaan ennen sekvensointia, kirjaston määrän arviointia ja fragmentoitumista.

     

    Sekvensoinnin laadunvalvontaraportti

     

    Taulukko 1. Sekvensointidatan tilastotiedot.

    Näytetunnus

    BMKID

    Raa'at lukemat

    Raakadata (bp)

    Puhtaat lukemat (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    Yleinen viljely (%)

    C_01

    BMK_01

    22 870 120

    6 861 036 000

    96.48

    99.14

    94,85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14 717 867

    4 415 360 100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Kuva 1. Laadun jakautuminen lukemien mukaan kussakin otoksessa

    A9

    Kuva 2. Perussisällön jakauma

    A10

    Kuva 3. Luetun sisällön jakautuminen sekvensointidatassa

    A11

    pyydä tarjous

    Kirjoita viestisi tähän ja lähetä se meille

    Lähetä viestisi meille: