Eukaryoottinen mRNA-sekvensointi-NGS
Piirteet
● Poly -mRNA: n kaappaus ennen kirjaston valmistelua
● Valinnainen suuntainen mRNA-kirjaston valmistelu juosekohtaisen sekvensointitiedon saamiseksi
● Geeniekspression ja transkriptiorakenteen bioinformaattinen analyysi
Edut
●Laaja asiantuntemus: Tiimimme on jalostanut yli 600 000 näytettä BMKGENE: ssä, ja se kattaa erilaisia näytetyyppejä, kuten soluviljelmiä, kudoksia ja kehon nesteitä. Tuomme runsaasti kokemusta jokaiselle projektille ja olemme onnistuneesti suorittaneet yli 100 000 mRNA-seq-hanketta eri tutkimusalueilla.
●Tiukka laadunvalvonta: Otamme käyttöön ydinohjauspisteitä kaikissa vaiheissa näytteen ja kirjaston valmistelusta sekvensointiin ja bioinformatiikkaan. Tämä huolellinen seuranta varmistaa jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen varmistaen, että projekti on luotettavissa käsissä.
●Kattava merkintä: Käytämme useita tietokantoja merkitsemään toiminnallisesti eri tavalla ekspressoituja geenit (DEG) ja suorittaa vastaavat rikastusanalyysit. Tämä kattava lähestymistapa tarjoaa käsityksen transkriptomahdollisuuden vastauksen taustalla olevista solu- ja molekyyliprosesseista, varmistaen, että olet täysin tietoinen projektin tuloksista.
●Myynnin jälkeinen tuki: Sitoumuksemme ulottuu projektin valmistumisen jälkeen 3 kuukauden myynnin jälkeisellä palvelujaksolla. Tänä aikana tarjoamme projektin seurantaa, vianetsintäapua sekä Q & A-istuntoja tuloksiin liittyvien kyselyjen ratkaisemiseksi.
Näytteen vaatimukset ja toimitus
| Kirjasto | Sekvensointistrategia | Suositeltu tieto | Laadunvalvonta |
| Poly rikastettu | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Gt | Q30 ≥85% |
Näytteen vaatimukset:
Nukleotidit:
| Conc. (Ng/μl) | Määrä (μg) | Puhtaus | Eheys | |
| Vakiokirjasto | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Rajoitettu tai ei lainkaan proteiini- tai DNA -kontaminaatiota, joka on esitetty geelissä. | Kasveille: Rin≥4,0; Eläimille: Rin≥4,5; 5,0 ≥28s/18S≥1,0; rajoitettu tai ei lainkaan lähtötason korkeus |
| Suuntakirjasto | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Rajoitettu tai ei lainkaan proteiini- tai DNA -kontaminaatiota, joka on esitetty geelissä. | Kasveille: Rin≥4,0; Eläimille: Rin≥4,5; 5,0 ≥28s/18S≥1,0; rajoitettu tai ei lainkaan lähtötason korkeus |
● Kasvit:
Juuri, varsi tai terälehti: 450 mg
Lehti tai siemen: 300 mg
Hedelmät: 1,2 g
●Eläin:
Sydän tai suolisto: 300 mg
Viskera tai aivot: 240 mg
Lihas: 450 mg
Luut, hiukset tai iho: 1 g
● Niveljalkaiset:
Hyönteiset: 6G
Crustacea: 300 mg
● Kokoveri: 1 putki
● Solut: 106 solut
Suositeltu näytteen toimitus
Kontti: 2 ml sentrifugiputkea (tinakalvoa ei suositella)
Näytteen merkinnät: ryhmä+replikoitu esim. A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Lähetys:
1. Kuiva-jää: Näytteet on pakattava pusseihin ja haudata kuivajää.
2. RNA -taulukkoputket: RNA -näytteet voidaan kuivata RNA -stabilointiputkessa (esim. RNASTable®) ja lähettää huoneenlämpötilassa.
Huoltotyövirta
Kokeen suunnittelu
Näytteenotto
RNA: n uutto
Kirjaston rakennus
Sekvensointi
Tietojen analysointi
Myynnin jälkeiset palvelut
Bioinformatiikka
Eukaryoottinen mRNA -sekvensointianalyysin työnkulku
Bioinformatiikka
ØRaakadatan laadunvalvonta
ØViiterenomin kohdistus
ØTranskriptirakenteen analyysi
ØIlmaisun kvantifiointi
ØDifferentiaalianalyysi
ØToimintojen merkintö ja rikastuminen
Viiterenomin kohdistus
Tietojen kylläisyys
Näytteen korrelaatio ja biologisten kopioiden arviointi
Erilaisesti ekspressoituja geenejä (DEG)
DEGS: n toiminnallinen merkintä
DEGS: n funktionaalinen rikastuminen
Tutustu Bmkgenen eukaryoottisten NGS -mRNA -sekvensointipalvelujen helpottamiin edistyksiin kuratoidun julkaisukokoelman kautta.
Huang, L. et ai. (2023) 'Triklosaani ja triklokarban heikentävät kultakalan hajukapasiteettia rajoittamalla hajustin tunnistamista, hajun signaalin siirtymisen häiritsemällä ja häiritsemällä hajujen tietojenkäsittelyä', vesitutkimus, 233, s. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et ai. (2023) 'Aspergillus fumigatus kaappaa ihmisen P11: n ohjaamaan sieniä sisältäviä fagosomeja ei-demontoivaan reittiin', Cell Host & Microbe, 31 (3), s. 373-388.e10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et ai. (2022) 'TCP -transkriptiotekijät, jotka liittyvät MA BAMBOO: n (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, s. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et ai. (2022) 'Chrysanthemum Lavandulifolium -genomi ja molekyylimekanismi, joka taustalla on erilaisia kapteenityyppejä', Horticulture Research, 9. DOI: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et ai. (2023) 'Kaskadin nanoreaktori kolorektaalisyövän sonodynaamisen hoidon parantamiseksi synergistisen ROS -lisäyksen ja autofagian tukkeutumisen kautta', Nano tänään, 49, s. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
