Evoluutiogenetiikka

Evoluutiogenetiikan tutkimusten tavoitteena on ymmärtää populaatioiden evolutiivista kehityskulkua käyttämällä genomisten sekvenssien polymorfismi-informaatiota. BMKCloud Evolutionary Genetics -tutkimusprosessi on suunniteltu analysoimaan WGS- tai Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) -dataa suurista populaatioista. Raakadatan laadunvalvonnan jälkeen lukemat kohdistetaan referenssigenomiin ja variantteja kutsutaan. Tutkimusprosessi sisältää fylogeneettisen puun rakentamisen, pääkomponenttianalyysin (PCA), populaatiorakenneanalyysin, kytkentäepätasapainon (LD), selektiivisen pyyhkäisyanalyysin ja kandidaattigeenianalyysin.