Tuotteet

Eksosomaalisen pienen RNA:n sekvensointi - Illumina

Eksosomit ovat solujen erittämiä pieniä vesikkeleitä, joiden halkaisija vaihtelee tyypillisesti 30:stä 100 nanometriin. Nämä vesikkelit sisältävät erilaista RNA:ta. Eksosomien RNA-tyypeistä yleisin ja laajimmin tutkittu on mikroRNA (miRNA). miRNA on luokka koodaamattomia pieniä RNA:ita, joiden pituus on noin 18–25 nukleotidia. Ne välittävät transkription jälkeistä geenien hiljentämistä sitoutumalla kohde-mRNA:iden 3'-translaatiottomaan alueeseen (3' UTR) ja siten säätelemällä geenien ilmentymistä. Esimerkiksi tiettyjen kasvainsolujen erittämät eksosomit sisältävät spesifisiä miRNA:ita, kuten miR-126 ja miR-92a. Nämä miRNA:t voivat vaikuttaa geenien ilmentymiseen vastaanottajasoluissa ja edistää kasvaimen angiogeneesiä (Tomohiro Umezu ym., Oncogene, 2012).

Ota yhteyttä

Palvelun tiedot

bioinformatiikka

Demotulokset

Ominaisuudet

● Lähtömateriaalina käytetään eksosomaalista kokonais-RNA:ta. Puhdistuksen aikana miRNA-helmiä käytetään miRNA:n eristämiseen.

● Bioinformatiikan analyysi, joka keskittyy miRNA-ennusteisiin ja niiden kohteisiin.

Palvelun edut

● Kattava bioinformatiikan analyysi: Mahdollistaa sekä tunnettujen että uusien miRNA:iden tunnistamisen, miRNA-kohteiden tunnistamisen ja vastaavan toiminnallisen annotoinnin ja rikastuksen useilla tietokannoilla (KEGG, GO).

● Tiukka laadunvalvonta: Käytämme keskeisiä valvontapisteitä kaikissa vaiheissa näytteen ja kirjaston valmistelusta sekvensointiin ja bioinformatiikkaan. Tämä huolellinen valvonta varmistaa jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen.

● Myynnin jälkeinen tuki: Sitoumuksemme ulottuu projektin valmistumisen jälkeen kolmen kuukauden myynninjälkeiseen palvelujaksoon. Tänä aikana tarjoamme projektin seurantaa, vianetsintäapua ja kysymys- ja vastaustilaisuuksia tuloksiin liittyvien kysymysten käsittelemiseksi.

Näytevaatimukset ja toimitus

Kirjasto	Alusta	Suositellut tiedot	Tietojen laadunvalvonta
Eksosomaalisen miRNA:n eristäminen	Illumina SE50	10–20 miljoonaa lukukertaa	Q30≥85%

Näytteen vaatimukset

Nukleotidit:

Määrä (ng)	Tilavuus (μL)
40	20

Kudos:

Eksosomi: 100 μL; 40 μg; >10^9 hiukkasta/ml
Seerumi/plasma: 5 ml
Soluviljelyneste: 100 ml
Virtsa: 100 ml
Sylki: 15 ml
Nenävuoto: 15 ml
Aivo-selkäydinneste: 15 ml
Lapsivesi: 50 ml
Siemenneste: 5 ml
Sappi: 5 ml
Askites: 50 ml
Maito: 15 ml
Follikulaarinen neste: 15 ml
Ulosteen supernatantti: 50 ml
Mikrobiviljelysupernatantti: 100 ml
Eläinkudosta: 3 g
Kasvikudos: 1 g

Suositeltu näytteen toimitus

Pakkaus: 2 ml:n sentrifugiputki (foliota ei suositella)
Näytteen merkintä: Ryhmittely + replikaatti, esim. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lähetys:
1. Kuivajää: Näytteet on pakattava pusseihin ja haudattava kuivajäähän.
2. RNAstable-putket: RNA-näytteet voidaan kuivata RNA-stabilointiputkessa (esim. RNAstable®) ja kuljettaa huoneenlämmössä.

Palvelun työnkulku

Kokeen suunnittelu

Näytteen toimitus

RNA-uutto

Kirjaston rakentaminen

Sekvensointi

Data-analyysi

Myynnin jälkeiset palvelut

Edellinen: BMKMANU S3000_Spatiaalinen transkriptomi

Seuraavaksi: Eksosomaalisen mRNA:n/LncRNA:n/CircRNA:n sekvensointi - Illumina

Bioinformatiikka

● Raakadatan laadunvalvonta
● sRNA-luokittelu
● Rinnakkaisuus referenssigenomiin
● Tunnettujen ja uusien miRNA:iden tunnistaminen
● miRNA-ilmentymisen differentiaalinen analyysi
● miRNA-kohteiden toiminnallinen annotointi

miRNA:n tunnistaminen: rakenne ja syvyys