BMKCloud Log in
条形banneri-03

Tuotteet

Sienigenomi

Biomarker Technologies tarjoaa sienen genomitutkimuksen, hienon genomin ja penen täydellisen genomin tietystä tutkimustavoitteesta riippuen.Genomin sekvensointi, kokoonpano ja toiminnallinen annotaatio voidaan saavuttaa yhdistämällä seuraavan sukupolven sekvensointi + kolmannen sukupolven sekvensointi korkean tason genomin kokoamiseen.Hi-C-teknologiaa voidaan myös käyttää helpottamaan genomin kokoamista kromosomitasolla.

Alusta:PacBio jatko-osa II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq -alusta


Palvelun tiedot

Demon tulokset

Palvelun edut

● Saatavilla useita sekvensointistrategioita eri tutkimustavoitteita varten

● Erittäin kokenut sienten genomin kokoamisesta, yli 10 000 peneä sisältävää genomia koottu.

● Ammattimainen myynnin jälkeinen tekninen tukiryhmä, joka täyttää tarkemmat tutkimustarpeet.

Palvelun tiedot

Palvelu

Sekvensointistrategia

Laatu taattu

Arvioitu läpimenoaika

Sieni hieno kartta

Illumina 50X+Nanopore 100X

Jatkuu N50≥2 Mb

35 työpäivää

PacBio HiFi 30X

Sienipenen täydellinen kartta

Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X

Kromosomien ankkurointisuhde >90 %

45 työpäivää

Bioinformatiikan analyysit

● Raakatietojen laadunvalvonta

● Genomin kokoonpano

● Genomikomponenttianalyysi

● Geenifunktion huomautus

● Vertaileva genomianalyysi

2

Näytevaatimukset ja toimitus

Esimerkkivaatimukset:

vartenDNA-uutteet:

Näytteen tyyppi

Määrä

Keskittyminen

Puhtaus

DNA-uutteet

> 1,2 μg

> 20 ng/μl

OD260/280 = 1,6-2,5

Kudosnäytteitä varten:

Näytetyyppi Suositeltu näytekäsittely Näytteiden varastointi ja lähetys
Yksisoluinen sieni Tarkkaile hiivaa mikroskoopilla ja kerää ne eksponentiaalisessa vaiheessa

Siirrä viljelmä (sisältää noin 3-4,5e9 solua) 1,5 tai 2 ml:n eppendorfiin.(Pysy jäällä)

Sentrifugoi putkea 1 minuutin ajan 14 000 g:ssä bakteerien keräämiseksi ja supernatantin poistamiseksi varovasti

Sulje putki ja pakasta bakteerit nestetypessä vähintään 1-3 tuntia.Säilytä putki -80 ℃ jääkaapissa.

Pakasta näytteet nestetypessä 3-4 tuntia ja säilytä nestetypessä tai -80 asteessa pitkäaikaiseen varaukseen.Näytetoimitus kuivajäällä vaaditaan.
Makrosieni Suositellaan aktiivisesti kasvavassa vaiheessa olevaa kudosta.

Huuhtele kudos endotoksiinivapaalla vedellä, sitten 70 % etonaalilla.

Säilytä näyte kryoputkissa.

Palvelun työnkulku

näytetoimitus

Näytteen toimitus

Kirjaston valmistelu

Kirjaston rakentaminen

Jaksotus

Jaksotus

Tietojen analysointi

Tietojen analysointi

Myynnin jälkeiset palvelut

Myynnin jälkeiset palvelut


  • Edellinen:
  • Seuraava:

  • 1.Circos-kaavio sienen genomikomponenteista

    3

    2. Vertaileva genomiikkaanalyysi: Fylogeneettinen puu

    4

     

    saada tarjous

    Kirjoita viestisi tähän ja lähetä se meille

    Lähetä viestisi meille: