Tuotteet

Hi-C on menetelmä, joka on suunniteltu genomisen konfiguraation tallentamiseen yhdistämällä läheisyyspohjaisia ​​vuorovaikutuksia ja suuren läpimenon sekvensointia. Menetelmä perustuu kromatiinin silloittamiseen formaldehydillä, jota seuraa pilkkominen ja uudelleenligaatio siten, että vain kovalenttisesti sitoutuneet fragmentit muodostavat ligaatiotuotteita. Sekvensoimalla näitä ligaatiotuotteita on mahdollista tutkia genomin 3D-organisaatiota. Hi-C:n avulla voidaan tutkia genomin kevyesti pakattujen osien (A-osastot, eukromatiini) ja todennäköisemmin transkriptionaalisesti aktiivisten osien sekä tiiviimmin pakattujen alueiden (B-osastot, heterokromatiini) jakautumista. Hi-C:tä voidaan käyttää myös topologisesti assosioituneiden domeenien (TAD) paikantamiseen. TAD-alueet ovat genomin alueita, joilla on laskostuneita rakenteita ja joilla todennäköisesti on samanlaisia ​​ilmentymismalleja. Lisäksi voidaan tunnistaa kromatiinisilmukoita, jotka ovat proteiinien yhteen ankkuroimia DNA-alueita, jotka ovat usein rikastettuja säätelyelementeillä. BMKGenen Hi-C-sekvensointipalvelu antaa tutkijoille mahdollisuuden tutkia genomiikan spatiaalisia ulottuvuuksia, mikä avaa uusia mahdollisuuksia genomin säätelyn ja sen terveys- ja sairausvaikutusten ymmärtämiseen.