条形banneri-03

Tuotteet

Ihmisen koko eksomin sekvensointi

Ihmisen koko eksomisekvensointi (hWES) on laajalti tunnustettu kustannustehokkaaksi ja tehokkaaksi sekvensointimenetelmäksi sairauksia aiheuttavien mutaatioiden paikantamiseksi. Vaikka eksonit muodostavat vain noin 1,7 % koko genomista, niillä on ratkaiseva rooli, koska ne heijastavat suoraan proteiinien kokonaistoimintojen profiilia. Merkillepantavaa on, että ihmisen genomissa yli 85 % sairauksiin liittyvistä mutaatioista ilmenee proteiinia koodaavilla alueilla. BMKGENE tarjoaa kattavan ja joustavan ihmisen koko eksomisekvensointipalvelun, jossa on kaksi erilaista eksonin sieppausstrategiaa erilaisten tutkimustavoitteiden saavuttamiseksi.


Palvelun tiedot

Demotulokset

Palvelun ominaisuudet

● Saatavilla on kaksi eksomipaneelia, jotka perustuvat koettimilla rikastettuun kohteeseen: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) ja xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sekvensointi Illumina NovaSeq -laitteella.

● Bioinformatiikan prosessi, joka on suunnattu tautien tai kasvainten analysointiin.

Palvelun edut

Kohteet proteiinia koodaava alueTallentamalla ja sekvensoimalla proteiinia koodaavia alueita hWES:iä käytetään paljastamaan proteiinirakenteeseen liittyviä variantteja.

Kustannustehokas:hWES tuottaa noin 85 % ihmisen sairauksiin liittyvistä mutaatioista 1 %:sta ihmisen genomista.

Korkea tarkkuusKorkean sekvensointisyvyyden ansiosta hWES helpottaa sekä yleisten varianttien että harvinaisten, alle 1 %:n frekvensseillä varustettujen varianttien havaitsemista.

Tiukka laadunvalvontaKäytämme viittä keskeistä valvontapistettä kaikissa vaiheissa näytteen ja kirjaston valmistelusta sekvensointiin ja bioinformatiikkaan. Tämä huolellinen valvonta varmistaa jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen.

Kattava bioinformatiikan analyysiTutkimusputkemme ulottuu referenssigenomin variaatioiden tunnistamista pidemmälle, sillä se sisältää edistyneitä analyysejä, jotka on suunniteltu erityisesti vastaamaan sairauksien geneettisiin näkökohtiin tai kasvainten analyysiin liittyviin tutkimuskysymyksiin.

Myynnin jälkeinen tuki:Sitoumuksemme ulottuu projektin valmistumisen jälkeen kolmen kuukauden myynninjälkeiseen palvelujaksoon. Tänä aikana tarjoamme projektin seurantaa, vianetsintäapua ja kysymys- ja vastaustunteja tuloksiin liittyvien kysymysten käsittelemiseksi.

Näytetiedot

Eksonin sieppausstrategia

Sekvensointistrategia

Suositeltu datalähtö

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

tai xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 Gt

Mendelin sairauksien/harvinaisten sairauksien hoidossa: > 50x

Kasvainnäytteille: ≥ 100x

Näytteen vaatimukset

Näytetyyppi

 

 Määrä(Qubit®)

 

Keskittyminen 

Äänenvoimakkuus

 

 

 Puhtaus (NanoDrop™)

 

Genominen DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280 = 1,8–2,0
 
ei hajoamista, ei saastumista

 

Bioinformatiikka

WES_BI-työnkulku_Tauti-01

hWES-tautinäytteiden bioinformatiivinen analyysi sisältää:

● Sekvensointidatan laadunvalvonta

● Viite genomin linjaus

● SNP:ien ja InDelien tunnistaminen

● SNP:ien ja InDelien toiminnallinen annotointi

WES_BI-työnkulku_Tumor-01

Kasvainnäytteiden bioinformaattinen analyysi sisältää:

● Sekvensointidatan laadunvalvonta

● Viite genomin linjaus

● SNP:ien, InDelien ja somaattisten variaatioiden tunnistaminen

● Sukusolulinjan varianttien tunnistaminen

● Mutaatiosignatuurien analyysi

● Ajurigeenien tunnistaminen toiminnanlisääntymismutaatioiden perusteella

● Mutaatiomerkintä lääkeherkkyyden tasolla

● Heterogeenisyysanalyysi – puhtauden ja ploidisuuden laskeminen

Palvelun työnkulku

näytteen toimitus

Näytteen toimitus

Pilottikokeilu

DNA:n eristäminen

Kirjaston valmistelu

Kirjaston rakentaminen

Sekvensointi

Sekvensointi

Data-analyysi

Data-analyysi

数据上传-01

Tiedon toimitus

Myynnin jälkeiset palvelut

Myynnin jälkeiset palvelut


  • Edellinen:
  • Seuraavaksi:

  • Data QC – Exome-kaappauksen tilastot

     

    wps_doc_22

     

    Varianttien tunnistus – InDels

    图片36

    Edistynyt analyysi: haitallisten SNP:ien/InDelien tunnistaminen ja jakautuminen – Circos-kuvaaja

     

    图片37

    Kasvainanalyysi: somaattisten mutaatioiden tunnistaminen ja jakautuminen – Circos-kuvaaja

     

    图片38

     

    Kasvaimen analyysi: klonaaliset linjat

     

    图片39

     

    pyydä tarjous

    Kirjoita viestisi tähän ja lähetä se meille

    Lähetä viestisi meille: