Tuotteet

Yksiytiminen RNA-sekvensointi

Yksitumaisen RNA-sekvensoinnin esittelykuva

Edistys yksittäisen solun sieppaamisessa ja yksittäisen kirjaston rakennustekniikassa yhdistettynä korkean suorituskyvyn sekvensointiin mahdollistaa geenien ilmentymisen tutkimukset solukohtaisesti.Se mahdollistaa syvemmän ja täydellisen järjestelmäanalyysin monimutkaisista solupopulaatioista, joissa se suurelta osin välttää niiden heterogeenisyyden peittämisen ottamalla kaikkien solujen keskiarvon.

Jotkut solut eivät kuitenkaan sovellu valmistettavaksi yksisolususpensioksi, joten tarvitaan muita näytteenvalmistusmenetelmiä – kudosten ytimen uuttaminen eli tuma uutetaan suoraan kudoksesta tai solusta ja valmistetaan yksitumainen suspensio yksitumaiseksi suspensioksi. solujen sekvensointi.

BMK tarjoaa 10× Genomics ChromiumTM -pohjaisen yksisoluisen RNA-sekvensointipalvelun.Tätä palvelua on käytetty laajasti tutkimuksissa sairauksiin liittyvistä tutkimuksista, kuten immuunisolujen erilaistumisesta, kasvaimen heterogeenisyydestä, kudosten kehityksestä jne.

Spatiaalinen transkriptomisiru: 10× Genomics

Alusta: Illumina NovaSeq Platform

Ota meihin yhteyttä

Palvelun tiedot

Bioinformatiikka

Demon tulokset

Tekninen periaate

Ydineristys saadaan aikaan 10× Genomics ChromiumTM:llä, joka koostuu kahdeksankanavaisesta mikrofluidiikkajärjestelmästä kaksoisristeyksillä.Tässä järjestelmässä geelihelmet, joissa on viivakoodeja ja alukkeita, entsyymejä ja yksi ydin kapseloituna nanolitran kokoiseen öljypisaraan, jolloin muodostuu GEM (Gel Bead-in-Emulsion) -emulsio.Kun GEM on muodostettu, solulyysi ja viivakoodien vapauttaminen suoritetaan jokaisessa GEM:ssä.mRNA käänteistranskriptoidaan cDNA-molekyyleiksi 10-kertaisilla viivakoodeilla ja UMI:lla, jotka ovat edelleen standardinmukaisen sekvensointikirjaston rakentamisen alaisia.

Kudos ei sovellu yksisolususpension valmistukseen

Solu / kudos	Syy
Tuore jäädytetty pehmopaperi	Uusia tai kauan tallennettuja organisaatioita ei voida saada
Lihassolut, Megakaryosyytit, Rasva…	Solun halkaisija on liian suuri laitteeseen pääsemiseksi
Maksa…	Liian hauras murtumaan, ei pysty erottamaan yksittäisiä soluja
Neuronisolut, aivot…	Herkempi, helppo stressata, muuttaa sekvensointituloksia
Haima, kilpirauhanen…	Sisältää runsaasti endogeenisiä entsyymejä, jotka vaikuttavat yksisolususpension tuotantoon

Yksiytiminen vs yksisoluinen

Yksiytiminen	Yksittäinen solu
Rajoittamaton solun halkaisija	Solun halkaisija: 10-40 μm
Materiaali voi olla pakastettua kudosta	Materiaalin tulee olla tuoretta pehmopaperia
Jäädytettyjen solujen alhainen stressi	Entsyymikäsittely voi aiheuttaa solustressireaktion
Punasoluja ei tarvitse poistaa	Punasolut on poistettava
Ydinvoima ilmaisee bioinformaatiota	Koko solu ilmaisee bioinformaatiota