Koko transkriptomekvensointi - Illumina
Piirteet
● Kaksikirja
● MRNA: n, lncRNA: n, CirCRNA: n ja miRNA: n täydellinen bioinformatiikkaanalyysi erillisissä bioinformatiikassa
● Kaiken RNA -ekspression yhteinen analyysi yhdistetyssä raportissa, mukaan lukien CERNA -verkkojen analyysi.
Palvelun edut
●Sääntelyverkkojen perusteellinen analyysi: CERNA -verkkoanalyysi mahdollistaa mRNA: n, lncRNA: n, cirCRNA: n ja miRNA: n ja tyhjentävän bioinformaattisen työnkulun yhteisen sekvensoinnin avulla.
●Kattava merkintä: Käytämme useita tietokantoja merkitsemään toiminnallisesti erilaisesti ekspressoidut geenit (DEG) ja suorittaa vastaava rikastusanalyysi, joka tarjoaa käsityksen transkriptomasteen taustalla oleviin solu- ja molekyyliprosesseihin.
●Laaja asiantuntemus: Kun menestyksekkäästi yli 2100 kokonaisen transkriptoprojektin onnistuneen sulkemisen eri tutkimusalueella, tiimimme tuo runsaasti kokemusta jokaiselle projektille.
●Tiukka laadunvalvonta: Otamme käyttöön ydinohjauspisteitä kaikissa vaiheissa näytteen ja kirjaston valmistelusta sekvensointiin ja bioinformatiikkaan. Tämä huolellinen seuranta varmistaa jatkuvasti korkealaatuisten tulosten toimittamisen.
●Myynnin jälkeinen tuki: Sitoumuksemme ulottuu projektin valmistumisen jälkeen 3 kuukauden myynnin jälkeisellä palvelujaksolla. Tänä aikana tarjoamme projektin seurantaa, vianetsintäapua sekä Q & A-istuntoja tuloksiin liittyvien kyselyjen ratkaisemiseksi
Näytteen vaatimukset ja toimitus
| Kirjasto | Sekvensointistrategia | Suositeltu tieto | Laadunvalvonta |
| rRNA ehtynyt | Illumina PE150 | 16 Gt | Q30 ≥85% |
| Koko valittu | Illumina SE50 | 10-20m lukee |
Näytteen vaatimukset:
Nukleotidit:
| Conc. (Ng/μl) | Määrä (μg) | Puhtaus | Eheys |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Rajoitettu tai ei lainkaan proteiini- tai DNA -kontaminaatiota, joka on esitetty geelissä. | Rin≥6,0 5,0 ≥28s/18S≥1,0; rajoitettu tai ei lainkaan lähtötason korkeus |
Suositeltu näytteen toimitus
Kontti: 2 ml sentrifugiputkea (tinakalvoa ei suositella)
Näytteen merkinnät: ryhmä+replikoitu esim. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lähetys:
1. Kuiva-jää: Näytteet on pakattava pusseihin ja haudata kuivajää.
2.
Huoltotyövirta
Kokeen suunnittelu
Näytteenotto
RNA: n uutto
Kirjaston rakennus
Sekvensointi
Tietojen analysointi
Myynnin jälkeiset palvelut
Bioinformatiikka
RNA -ekspression yleiskatsaus
Erilaisesti ekspressoituja geenejä
CERNA -analyysi
Erilaisesti ekspressoivat miRNA: t ja niihin liittyvät RNA: t
Tutustu Bmkgenen koko transkripto -sekvensointipalvelujen helpottamiin tutkimuksen edistyksiin kuratoidun julkaisujen avulla.
Dai, Y. et ai. (2022) 'MRNA: n, LNCRNA: n ja miRNA: n kattavat ekspressioprofiilit Kashin-Beckin taudissa, joka on tunnistettu RNA-sekvensointiin', Molecular Omics, 18 (2), s. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et ai. (2022) 'Apis Ceranan kylmän resistenssin täyspitkän transkriptoomian analyysi Changbai-vuorella talvehtimisen ajanjakson aikana.', Gene, 830, s. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et ai. (2022) 'Multi-Omics Integration -pohjainen kilpailevien endogeenisten RNA-säätelyverkkojen priorisointi pienisoluisissa keuhkosyövässä: molekyyliominaisuudet ja lääkeehdokkaat', onkologian rajat, 12, s. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et ai. (2022) 'LncRNA/circRNA-miRNA-mRNA-ekspressioprofiilien integroitu analyysi paljastaa uusia näkemyksiä potentiaalisista mekanismeista vasteena juuren solmujen nematodeille maapähkinässä', BMC Genomics, 23 (1), s. 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/luvut/7.
Yan, Z. et ai. (2022) 'Koko transcriptoomin RNA-sekvensointi korostaa molekyylimekanismeja, jotka liittyvät parsakaalin jälkeisen laadun ylläpitämiseen punaisella LED-säteilytyksellä', Postharvest Biology and Technology, 188, s. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
