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PacBio-Transcriptome complet (non-référence)
La plate-forme Amplicon (16S/18S/ITS) est développée avec des années d'expérience dans l'analyse de projets de diversité microbienne, qui contient une analyse de base standardisée et une analyse personnalisée : l'analyse de base couvre le contenu d'analyse principal de la recherche microbienne actuelle, le contenu d'analyse est riche et complet, et les résultats d'analyse sont présentés sous forme de rapports de projet ;Le contenu de l'analyse personnalisée est varié.Les échantillons peuvent être sélectionnés et les paramètres peuvent être définis de manière flexible en fonction du rapport d'analyse de base et du but de la recherche, pour réaliser des exigences personnalisées.Système d'exploitation Windows, simple et rapide.
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PacBio-Transcriptome complet (non-référence)
Prenant en entrée les données de séquençage des isoformes de Pacific Biosciences (PacBio), cette application est capable d'identifier des séquences de transcription complètes (sans assemblage).En cartographiant des séquences complètes par rapport au génome de référence, les transcrits peuvent être optimisés par des gènes connus, des transcrits, des régions codantes, etc. Dans ce cas, une identification plus précise des structures d'ARNm, telles que l'épissage alternatif, etc., peut être obtenue.L'analyse conjointe avec les données de séquençage du transcriptome NGS permet une annotation plus complète et une quantification plus précise de l'expression au niveau de la transcription, ce qui profite largement à l'expression différentielle en aval et à l'analyse fonctionnelle.
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Boîtes à outils
BMKCloud est une plate-forme bioinformatique de premier plan fournissant une solution unique pour les programmes génomiques, largement approuvée par les chercheurs dans divers domaines, notamment médical, agricole, environnemental, etc. BMKCloud s'engage à fournir des services intégrés, fiables et efficaces, notamment des plates-formes et des outils d'analyse bioinformatique. , ressources informatiques, base de données publique, cours bioinformatiques en ligne, etc. BMKCloud dispose de divers outils bioinformatiques fréquemment utilisés, notamment l'annotation de gènes, les outils génétiques évolutifs, le ncRNA, le contrôle de la qualité des données, l'assemblage, l'alignement, l'extraction de données, les mutations, les statistiques, le générateur de figures, la séquence analyse, etc...
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petit ARN
Les petits ARN sont des types d'ARN non codants courts d'une longueur moyenne de 18 à 30 nt, y compris les miARN, les siARN et les piARN.Ces petits ARN ont été massivement signalés comme étant impliqués dans divers processus biologiques tels que la dégradation de l'ARNm, l'inhibition de la traduction, la formation d'hétérochromatine, etc. La plate-forme d'analyse de séquençage se compose d'une analyse standard et d'une exploration de données avancée.Sur la base des données d'ARN-seq, l'analyse standard peut réaliser l'identification et la prédiction des miARN, la prédiction du gène cible des miARN, l'annotation et l'analyse de l'expression.L'analyse avancée permet la recherche et l'extraction personnalisées de miARN, la génération de diagrammes de Venn, la création de réseaux de miARN et de gènes cibles.
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NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS est une plate-forme d'analyse de reséquençage du génome entier, qui est développée sur la base d'une riche expérience dans les technologies de biomarqueurs.Cette plate-forme facile à utiliser permet la soumission rapide d'un flux de travail d'analyse intégré en définissant simplement quelques paramètres de base, qui conviennent aux données de séquençage d'ADN générées à la fois par la plate-forme Illumina et la plate-forme de séquençage BGI.Cette plate-forme est déployée sur un serveur de calcul haute performance, ce qui permet une analyse de données très efficace en un temps très limité.L'exploration de données personnalisée est disponible sur la base d'une analyse standard, y compris la requête de gènes mutés, la conception d'amorces PCR, etc.
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ARNm (référence)
Le transcriptome est le lien entre l'information génétique génomique et le protéome de la fonction biologique.La régulation au niveau transcriptionnel est le mode de régulation des organismes le plus important et le plus largement étudié.Le séquençage du transcriptome peut séquencer le transcriptome à tout moment ou dans n'importe quelle condition, avec une résolution précise à un seul nucléotide. Il peut refléter dynamiquement le niveau de transcription génique, identifier et quantifier simultanément les transcrits rares et normaux, et fournir les informations structurelles de exemples de transcriptions spécifiques.
À l'heure actuelle, la technologie de séquençage du transcriptome est largement utilisée en agronomie, en médecine et dans d'autres domaines de recherche, notamment la régulation du développement animal et végétal, l'adaptation environnementale, l'interaction immunitaire, la localisation des gènes, l'évolution génétique des espèces et la détection des tumeurs et des maladies génétiques.
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Métagénomique (NGS)
Cette plate-forme d'analyse est conçue pour l'analyse de données métagénomiques shotgun sur la base d'années d'expérience.Il s'agit d'un flux de travail intégré contenant diverses analyses métagénomiques couramment nécessaires, notamment le traitement des données, les études au niveau de l'espèce, les études au niveau de la fonction génique, le regroupement du métagénome, etc. , paramétrage, génération de chiffre personnalisé, etc.
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LncARN
Les ARN longs non codants (lncRNA) sont un type de transcrits d'une longueur supérieure à 200 nt, qui sont incapables de coder les protéines.Les preuves accumulées suggèrent que la plupart des lncARN sont très probablement fonctionnels.Les technologies de séquençage à haut débit et les outils d'analyse bioinformatique nous permettent de révéler plus efficacement les séquences d'ARNlnc et les informations de positionnement et nous conduisent à découvrir des ARNlnc dotés de fonctions de régulation cruciales.BMKCloud est fier de fournir à ses clients une plate-forme d'analyse de séquençage d'ARNlnc pour réaliser une analyse d'ARNlnc rapide, fiable et flexible.
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GWAS
L'étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) vise à identifier les variantes génétiques (génotype) associées à des traits spécifiques (phénotype).Les études GWA étudient les marqueurs génétiques traversant le génome entier d'un grand nombre d'individus et prédisent les associations génotype-phénotype par une analyse statistique au niveau de la population.Le reséquençage du génome entier peut potentiellement découvrir toutes les variantes génétiques.En couplant avec des données phénotypiques, GWAS peut être traité pour identifier les SNP, les QTL et les gènes candidats liés au phénotype, ce qui soutient fortement la sélection animale / végétale moderne.SLAF est une stratégie simplifiée de séquençage du génome auto-développée, qui découvre des marqueurs distribués à l'échelle du génome, SNP.Ces SNP, en tant que marqueurs génétiques moléculaires, peuvent être traités pour des études d'association avec des traits ciblés.Il s'agit d'une stratégie rentable pour identifier des traits complexes associés à des variations génétiques.
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Transcriptomique pleine longueur Nanopore
Les isoformes alternatives complexes et variables dans les organismes sont des mécanismes génétiques importants pour la régulation de l'expression des gènes et la diversité des protéines.L'identification précise des structures de transcription est la base d'une étude approfondie des modèles de régulation de l'expression génique.La plateforme de séquençage Nanopore a réussi à amener l'étude transcriptomique au niveau des isoformes.Cette plateforme d'analyse est conçue pour analyser les données RNA-Seq générées sur la plateforme Nanopore sur la base du génome de référence, qui réalise des analyses qualitatives et quantitatives à la fois au niveau du gène et au niveau des transcrits.
