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Des produits

Transcriptome spatial BMKMANU S1000

L'organisation spatiale des cellules joue un rôle essentiel dans divers processus biologiques, tels que l'infiltration immunitaire, le développement de l'embryon, etc. Le séquençage spatial du transcriptome, qui indique le profilage de l'expression génique tout en conservant les informations sur la position spatiale, a fourni d'excellentes informations sur l'architecture tissulaire au niveau du transcriptome.Avec le développement de la technologie, la morphologie tissulaire ultra-claire et la différence structurelle réelle de l’expression moléculaire spatiale doivent être étudiées avec une résolution plus élevée.BMKGENE fournit un service complet et unique de séquençage spatial du transcriptome, des échantillons aux informations biologiques.

Les technologies de transcriptomique spatiale ont donné naissance à de nouvelles perspectives dans divers domaines de recherche en résolvant le profil d'expression génique avec un contenu spatial dans des échantillons hétérogènes.

Puce de transcriptome spatial : BMKMANU S1000

Plateforme : Plateforme Illumina NovaSeq


Détails des services

Bioinformatique

Résultats de la démonstration

Schéma technique du transcriptome spatial BMKMANU S1000

S1000.

Avantages du BMKMANU S1000

1) Résolution sous-cellulaire : chaque zone de capture contenait plus de 2 millions de points spatiaux à code-barres d'un diamètre de 2,5 µm et d'un espacement de 5 µm entre les centres des points, permettant une analyse spatiale du transcriptome avec une résolution sous-cellulaire (5 µm).

s1000 (1)

2) Analyse à résolution multi-niveaux : analyse multi-niveaux flexible allant de 100 μm à 5 μm pour résoudre diverses caractéristiques des tissus à une résolution optimale.

s1000 (2)

3) Profilage complet du transcriptome : les transcriptions capturées à partir de la lame de tissu entière peuvent être analysées, sans restriction sur le nombre de gènes cibles et la zone cible.

s1000 (3)

Spécifications des services

Bibliothèque

Stratégie de séquençage

Sortie de données recommandée

Bibliothèque d'ADNc S1000

BMKMANU S1000-Illumina PE150

60 Go/échantillon

Exigences des échantillons

Échantillon

Nombre

Taille

Qualité de l'ARN

Bloc de tissu intégré OCT

2-3 blocs/échantillon

Environ.6,8x6,8x6,8mm3

RIN≥7

Pour plus de détails sur les conseils de préparation des échantillons et le flux de travail du service, n'hésitez pas à parler à un

Flux de travail des services

Échantillon de CQ

Conception d'expériences

livraison d'échantillon

Livraison d'échantillon

Expérience pilote

Pré-expérience

Code-barres spatial

Code-barres spatial

Préparation de la bibliothèque

Construction d'une bibliothèque

Séquençage

Séquençage

L'analyse des données

L'analyse des données

Services après-vente

Services après-vente


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  • 10x (9)

    Les données générées par BMKMANU S1000 sont analysées à l'aide du logiciel « BSTMatrix », conçu indépendamment par BMKGENE, comprenant :

    1) Génération de matrice d’expression génique
    2) Traitement d'images HE
    3) Compatible avec les logiciels tiers en aval pour l'analyse
    4) « BSTViewer » en ligne permet d'obtenir des résultats de visualisation à différentes résolutions.

    1. Regroupement ponctuel

    s1000 (4)

    2.Répartition spatiale

    s1000 (5)s1000 (6)

    Note: Résolutionniveau=13 (100 µm, gauche); 7 (50 µm, droite)

    3.Carte thermique de clustering d'abondance d'expression de marqueur

    s1000 (7)

    4. Analyse des données inter-échantillons

    s1000 (8)

     

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