Illumina et BGI
Caractéristiques
●Plateformes :Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten et BGI-DNB-T7
●Modes de séquençage :PE50, PE100, PE150, PE250
●Contrôle qualité des librairies avant séquençage
●Livraison des données de séquençage et contrôle qualité :livraison du rapport QC et des données brutes au format fastq après démultiplexage et filtrage des lectures Q30.
Avantages des services
●Polyvalence des services de séquençage :le client peut choisir de séquencer par voie, Flow Cell ou quantité de données.
●Polyvalence des plateformes :Les bibliothèques DNB peuvent être transférées vers les plateformes Illumina
●Vaste expérience sur la plateforme de séquençage Illumina :avec des milliers de projets clôturés avec diverses espèces.
●Remise du rapport de contrôle qualité de séquençage :avec des mesures de qualité, l’exactitude des données et la performance globale du projet de séquençage.
●Processus de séquençage mature :avec un délai d'exécution court.
●Contrôle qualité rigoureux: nous mettons en œuvre des exigences strictes en matière de contrôle qualité pour garantir la fourniture de résultats de haute qualité constante.
Exigences relatives aux échantillons*
Séquençage partiel des voies
| Quantité de données (X) | Concentration (qPCR/nM) | Volume |
| X ≤ 50 Go | ≥ 2 nM | ≥ 20 µl |
| 50 Go ≤ X < 100 Go | ≥ 3 nM | ≥ 20 µl |
| X ≥ 100 Go | ≥ 4 nM | ≥ 20 µl |
Voie unique (Illumina)
| Plate-forme | Concentration (qPCR/nM) | Volume |
| HiSeq X Dix | ≥ 2 nM | ≥ 20 µl |
| NovaSeq 6000SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 µl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 µl |
| NovaSeqX | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 µl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 µl |
En plus de la concentration et de la quantité totale, une configuration de pic appropriée est également requise.
Veuillez nous contacter si vos échantillons ne répondent pas aux exigences en matière de matière première.
Flux de travail des services
Contrôle qualité de la bibliothèque
Séquençage
Contrôle de la qualité des données
Livraison du projet
Rapport de contrôle qualité de la bibliothèque
Un rapport sur la qualité de la bibliothèque est fourni avant le séquençage, l'évaluation de la quantité de la bibliothèque et la fragmentation.
Rapport de contrôle qualité de séquençage
Tableau 1. Statistiques sur les données de séquençage.
| ID de l'échantillon | BMKID | Lectures brutes | Données brutes (pb) | Lectures propres (%) | Q20(%) | Q30(%) | CG(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figure 1. Répartition de la qualité selon les lectures dans chaque échantillon
Figure 2. Distribution du contenu de base
Figure 3. Répartition des contenus lus dans les données de séquençage
