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Séquençage de l'ARNm eucaryote-Illumina

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Le séquençage de l’ARNm permet le profilage de tous les ARNm transcrits à partir de cellules dans des conditions spécifiques.Il s'agit d'une technologie puissante permettant de révéler le profil d'expression des gènes, les structures des gènes et les mécanismes moléculaires de certains processus biologiques.À ce jour, le séquençage de l’ARNm a été largement utilisé dans la recherche fondamentale, les diagnostics cliniques, le développement de médicaments, etc.

Plateforme : Plateforme Illumina NovaSeq

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Détails des services

Bioinformatique

Résultats de la démonstration

Avantages

● Très expérimenté : plus de 200 000 échantillons ont été traités dans BMK couvrant divers types d'échantillons, notamment la culture cellulaire, les tissus, les fluides corporels, etc. et plus de 7 000 projets de séquençage d'ARNm clôturés couvrant divers domaines de recherche.

● Système de contrôle qualité strict : les principaux points de contrôle qualité à toutes les étapes, y compris la préparation des échantillons, la préparation de la bibliothèque, le séquençage et la bioinformatique, sont étroitement surveillés afin de fournir des résultats de haute qualité.

● Plusieurs bases de données disponibles pour les études d'annotation et d'enrichissement des fonctions afin de répondre à divers objectifs de recherche.

● Services après-vente : Services après-vente valables 3 mois après la fin du projet, comprenant le suivi des projets, le dépannage, les questions-réponses sur les résultats, etc.

Exigences et livraison des échantillons

Bibliothèque	Stratégie de séquençage	Données recommandées	Contrôle de qualité
Poly A enrichi	Illumina PE150	6 Go	Q30≥85 %

Exigences de l'échantillon :

Nucléotides :

Conc. (ng/μl)

Quantité (μg)

Pureté

Intégrité

≥20

≥ 0,5

DO260/280=1,7-2,5

DO260/230=0,5-2,5

Contamination limitée ou inexistante en protéines ou en ADN indiquée sur le gel.

Pour les plantes : RIN≥6,5 ;

Pour les animaux : RIN≥7,0 ;

5,0≥28S/18S≥1,0 ;

élévation de la ligne de base limitée ou inexistante

Tissu : Poids (sec) :≥1 g
*Pour les tissus inférieurs à 5 mg, nous recommandons d’envoyer un échantillon de tissu surgelé (dans l’azote liquide).

Suspension cellulaire :Nombre de cellules = 3×10⁶- 1×10⁷
*Nous recommandons d’expédier du lysat cellulaire congelé.Dans le cas où cette cellule compte moins de 5×105.

Échantillons de sang:Volume≥1 ml

Micro-organisme:Masse ≥ 1 g

Livraison d’échantillon recommandée

Récipient : tube à centrifuger de 2 ml (le papier d'aluminium n'est pas recommandé)

Étiquetage des échantillons : Groupe + répétition, par exemple A1, A2, A3 ;B1, B2, B3... ...

Expédition:

Glace carbonique : les échantillons doivent être emballés dans des sacs et enterrés dans de la neige carbonique.
Tubes RNAstable : les échantillons d'ARN peuvent être séchés dans un tube de stabilisation d'ARN (par exemple RNAstable®) et expédiés à température ambiante.