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Des produits

Séquençage d'ARNm eucaryote-Illumina

Le séquençage d'ARNm permet le profilage de tous les ARNm transcrits à partir de cellules dans des conditions spécifiques.Il s'agit d'une technologie puissante pour révéler le profil d'expression des gènes, les structures des gènes et les mécanismes moléculaires de certains processus biologiques.À ce jour, le séquençage de l'ARNm a été largement utilisé dans la recherche fondamentale, les diagnostics cliniques, le développement de médicaments, etc.

Plate-forme : Illumina NovaSeq 6000


Détails des services

Bioinformatique

Résultats de la démo

Avantages

ØTrès expérimenté : plus de 200 000 échantillons ont été traités dans BMK couvrant divers types d'échantillons, y compris la culture cellulaire, les tissus, les fluides corporels, etc. et plus de 7 000 projets d'ARNm-Seq ont été clôturés couvrant divers domaines de recherche.

ØSystème de contrôle de qualité strict : les points de contrôle de qualité de base à toutes les étapes, y compris la préparation des échantillons, la préparation de la bibliothèque, le séquençage et la bioinformatique, sont étroitement surveillés afin de fournir des résultats de haute qualité.

ØPlusieurs bases de données disponibles pour l'annotation des fonctions et les études d'enrichissement afin de répondre à divers objectifs de recherche.

ØServices après-vente : services après-vente valables 3 mois après l'achèvement du projet, comprenant le suivi des projets, le dépannage, les questions-réponses sur les résultats, etc.

Exigences et livraison des échantillons

Bibliothèque Stratégie de séquençage Données recommandées Contrôle de qualité
Poly A enrichi Illumina PE150

6 Go

Q30≥85%

Exemples d'exigences :

Nucléotides :

Pureté Intégrité Montant
OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Contamination limitée ou nulle des protéines ou de l'ADN indiquée sur le gel. Pour les plantes : RIN≥6,5 ; Pour les animaux : RIN≥7 ;28S/18S≥1,0 ;élévation limitée ou inexistante de la ligne de base conc.≥30 ng/µl ;Volume ≥ 10 μl ;Totale ≥ 1,5 μg

Tissu : Poids (sec) :≥1g
*Pour les tissus inférieurs à 5 mg, nous vous recommandons d'envoyer un échantillon de tissu congelé (dans de l'azote liquide).

Suspension cellulaire :Nombre de cellules = 3×106- 1×107
*Nous recommandons d'expédier le lysat cellulaire congelé.Dans le cas où le nombre de cellules est inférieur à 5 × 105, une congélation instantanée dans de l'azote liquide est recommandée, ce qui est préférable pour la micro-extraction.

Échantillons de sang:Volume≥1 ml

Micro-organisme:Masse ≥ 1 g

Livraison d'échantillon recommandée

Contenant : tube à centrifuger de 2 ml (le papier d'aluminium n'est pas recommandé)

Marquage de l'échantillon : grouper + répliquer, par exemple A1, A2, A3 ;B1, B2, B3... ...

Expédition:

  1. Glace carbonique : les échantillons doivent être emballés dans des sacs et enterrés dans de la neige carbonique.
  2. Tubes RNAstable : les échantillons d'ARN peuvent être séchés dans un tube de stabilisation d'ARN (par exemple, RNAstable®) et expédiés à température ambiante.

Flux de travail des services

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Conception de l'expérience

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Livraison d'échantillon

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Extraction d'ARN

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Construction de la bibliothèque

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Séquençage

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L'analyse des données

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Services après-vente


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  • Bioinformatique

    2(1)

    Eucaryote Flux de travail d'analyse de séquençage d'ARNm

    Bioinformatique

    ØContrôle qualité des données brutes

    ØAlignement du génome de référence

    ØAnalyse de la structure des transcriptions

    ØQuantification des expressions

    ØAnalyse d'expression différentielle

    ØAnnotation et enrichissement de fonctions

    1.Courbe de saturation des données d'ARNm

    3(1)

    2.Analyse d'expression différentielle-Volcano plot

    4(1)

    3.Annotation KEGG sur les DEG

    5(1)

    4.Classement GO sur les DEG

    6(1)

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