Baktearjes folslein genoom
Service Foardielen
● Meardere sequencing strategyen beskikber foar ferskate ûndersyk doelen
● Baktearjes folslein genome mei 0 Gap garandearre.
● Heech belibbe yn baktearje genome gearstalling mei mear as 10.000 folsleine genome gearstald.
● Profesjonele nei-ferkeap technyske stipe team ferfoljen mear spesifike ûndersyk behoeften.
Service Spesifikaasjes
| SequencingStrategy | Biblioteek | Kwaliteit garandearre | Geschatte turn-around tiid |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 gap | 30 dagen |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformatika analyzes
● Raw gegevens kwaliteit kontrôle
● Genome gearkomste
● Genome komponint analyze
● Gene funksje annotaasje
● Fergelykjende genomyske analyze
Sample easken en levering
Sample easken:
FoarDNA-ekstrakten:
| Sample Type | Tal | Konsintraasje | Purity |
| DNA-ekstrakten | ＞ 2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Foar weefselmonsters:
| Sample type | Oanrikkemandearre sample behanneling | Sample opslach en shipment |
| Baktearjes | Observearje baktearjes ûnder de mikroskoop en sammelje baktearjes yn har eksponinsjele faze Oermeitsje de baktearje kultuer (befettet likernôch. 3-4.5e9 sellen) yn in 1,5 of 2 ml eppendorf.(Hâld op iis) Centrifugerje de buis foar 1 min op 14000 g om baktearjes te sammeljen en de supernatant foarsichtich te ferwiderjen Slút de buis en befrieze de baktearjes yn floeibere stikstof foar op syn minst 30 min.Bewarje de buis yn -80 ℃ koelkast. | Freeze de samples yn floeibere stikstof foar 3-4 oeren en bewarje yn floeibere stikstof of -80 graden oant reservearring op lange termyn.Sample ferstjoering mei droech iis is fereaske. |
Service Work Flow
Sample levering
Biblioteekbou
Sequencing
Data analyze
Nei-ferkeap tsjinsten
1.Circos fan baktearjes genome
2.Coding gene foarsizzing
3.Comparative genomics analyze: fylogenetic beam
