BMKCloud Log in
条形banner-03

Products

Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina

mRNA-sequencing makket profilearring mooglik fan alle mRNA's dy't transkripsje út sellen ûnder spesifike omstannichheden.It is in krêftige technology foar it iepenbierjen fan gene-ekspresjeprofyl, genstruktueren en molekulêre meganismen fan bepaalde biologyske prosessen.Oant no ta is mRNA-sekwinsje in soad brûkt yn fûneminteel ûndersyk, klinyske diagnoaze, medisynûntwikkeling, ensfh.

Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm


Service Details

Bioinformatika

Demo Results

Foardielen

● Heech belibbe: Mear dan 200.000-samples binne ferwurke yn BMK dy't ferskate sampletypen befetsje, ynklusyf selkultuer, weefsel, lichemfloeistof, ensfh.

● Strikt kwaliteitskontrôlesysteem: Kearnkwaliteitskontrôlepunten troch alle stappen ynklusyf sample tarieding, biblioteek tarieding, sequencing en bioinformatics binne ûnder nau tafersjoch om te leverjen hege-kwaliteit resultaten.

● Meardere databases beskikber foar funksje annotaasje en ferriking stúdzjes te ferfoljen ferskate ûndersyk doelen.

● Tsjinsten nei ferkeap: Tsjinsten nei ferkeap jildich foar 3 moannen nei projektfoltôging, ynklusyf projektopfolging, troubleshooting, resultaten Q&A, ensfh.

Sample easken en levering

Biblioteek Sequencing strategy Gegevens oanrikkemandearre Kwaliteitsbeweitsing
Poly A ferrike Illumina PE150

6 gb

Q30≥85%

Sample easken:

Nukleotiden:

Konk.(ng/μl)

Bedrach (μg)

Purity

Yntegriteit

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Beheinde as gjin proteïne- of DNA-fersmoarging werjûn op gel.

Foar planten: RIN≥6.5;

Foar bisten: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

beheind of gjin baseline hichte

Tissue: Gewicht (droech):≥1 g
* Foar weefsel lytser dan 5 mg, riede wy oan om flash beferzen (yn floeibere stikstof) weefselmonster te stjoeren.

Cell suspension:Seltal = 3×106- 1×107
* Wy riede oan om beferzen sel lysate te ferstjoeren.Yn gefal dat sel telt lytser as 5 × 105.

Bloedmonsters:Volume ≥1 ml

Mikroorganisme:Massa ≥ 1 g

Oanrikkemandearre Sample Delivery

Container: 2 ml centrifuge tube (Tin folie is net oan te rieden)

Sample labeling: Groep + replikearje bgl. A1, A2, A3;B1, B2, B3......

Ferstjoering:

  1. Dry-iis: Samples moatte wurde ferpakt yn sekken en begroeven yn droech-iis.
  2. RNA-stabiele buizen: RNA-monsters kinne wurde droege yn RNA-stabilisaasjebuis (bygelyks RNAstable®) en ferstjoerd yn keamertemperatuer.

Service Work Flow

Foarbyld fan QC

Eksperimint ûntwerp

sample levering

Sample levering

Pilot eksperimint

RNA-ekstraksje

Biblioteek Tarieding

Biblioteekbou

Sequencing

Sequencing

Data analyze

Data analyze

Nei ferkeap Tsjinsten

Nei-ferkeap tsjinsten


  • Foarige:
  • Folgjende:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    Eukaryotyk mRNA sequencing analyze workflow

    Bioinformatika

    ØRaw gegevens kwaliteit kontrôle

    ØReferinsje genome alignment

    ØTranskripsjestruktuer analyze

    ØEkspresje kwantifikaasje

    ØDifferinsjaal ekspresje analyze

    ØFunksje annotaasje en ferriking

    1.mRNA Data Saturation kromme

    3(1)

    2.Differinsjaal ekspresje analyze-Fulcano plot

    4(1)

    3.KEGG annotaasje op DEGs

    5(1)

    4.GO klassifikaasje op DEGs

    6(1)

    krije in offerte

    Skriuw jo berjocht hjir en stjoer it nei ús

    Stjoer jo berjocht nei ús: