-
Chromatine Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq leveret genome-brede profilearring fan DNA-doelen foar histonmodifikaasje, transkripsjefaktoaren, en oare DNA-assosjearre aaiwiten.It kombineart de selektiviteit fan chromatine-immuno-precipitaasje (ChIP) om spesifike protein-DNA-kompleksen te herstellen, mei de krêft fan folgjende-generaasje sequencing (NGS) foar hege-throughput sequencing fan it herstelde DNA.Derneist, om't de proteïne-DNA-kompleksen wurde weromfûn út libbene sellen, kinne binende siden wurde fergelike yn ferskate seltypen en weefsels, of ûnder ferskate omstannichheden.Applikaasjes fariearje fan transkripsjeregulaasje oant ûntwikkelingswegen oant syktemeganismen en fierder.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Folsleine genome bisulfite sequencing
DNA-methylaasje op 'e fyfde posysje yn cytosine (5-mC) hat in fûnemintele ynfloed op geneekspresje en sellulêre aktiviteit.Abnormale methylaasjepatroanen binne ferbûn mei ferskate betingsten en sykten, lykas kanker.WGBS is de gouden standert wurden foar it bestudearjen fan genome-brede methylaasje by resolúsje fan ien basis.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Assay foar transposase-tagonklik chromatine mei hege trochfier-sekwinsje (ATAC-seq)
ATAC-seq is in hege-trochput sequencing metoade foar analyze fan genome-wide chromatine tagonklikens, dat is wichtich foar globale epigenetyske kontrôle fan gene ekspresje.Sequencing adapters wurde ynfoege yn iepen chromatine regio's troch hyperaktive Tn5 transposase.Nei PCR-amplifikaasje wurdt in sequencing-bibleteek konstruearre.Alle iepen chromatine-regio's kinne wurde krigen ûnder in spesifike romte-tiid-betingst, net allinich beheind ta de binende siden fan in transkripsjefaktor, of in bepaalde histon-modifisearre regio.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
DNA-methylaasjeûndersyk hat altyd in hyt ûnderwerp west yn sykteûndersyk, en is nau besibbe oan geneekspresje en fenotypyske eigenskippen.RRBS is in krekte, effisjinte en ekonomyske metoade foar DNA-methylaasjeûndersyk.Ferriking fan promotor- en CpG-eilânregio's troch enzymatyske splitsing (Msp I), kombinearre mei Bisulfite-sekwinsje, leveret DNA-methylaasjedeteksje mei hege resolúsje.
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
