Tras-scríbhinn Spásúil Visium Géanómaíochta 10x
Scéim Theicniúil
Gnéithe
● Rún: 100 µM
● Trastomhas Spota: 55 µM
● Líon na spotaí: 4992
● Limistéar gabhála: 6.5 x 6.5 mm
● Tá gach spota barrachódaithe luchtaithe le tosaitheoirí atá comhdhéanta de 4 chuid:
- eireaball pola(dT) le haghaidh ullmhúcháin mRNA agus sintéis cDNA
- Aitheantóir Móilíneach Uathúil (UMI) chun claonadh aimpliúcháin a cheartú
- Barra cód spásúil
- Seicheamh ceangailteach de bhunaitheoir seicheamhaithe léite páirteach 1
● Dathú H&E ar rannóga
Buntáistí
●Seirbhís aon-stadComhtháthaíonn sé gach céim atá bunaithe ar thaithí agus scileanna, lena n-áirítear crió-roinnt, ruaimniú, optamú fíocháin, códú barra spásúil, ullmhú leabharlainne, seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht.
● Foireann Theicniúil Ard-Oiltele taithí i mbreis is 250 cineál fíocháin agus breis is 100 speiceas lena n-áirítear daoine, lucha, mamaigh, iasc agus plandaí.
●Nuashonrú Fíor-ama ar an Tionscadal Iomlán: le smacht iomlán ar dhul chun cinn turgnamhach.
●Bithfhaisnéisíocht Chaighdeánach Chuimsitheach:Áirítear sa phacáiste 29 anailís agus breis is 100 figiúr ardchaighdeáin.
●Anailís agus Amharcléiriú Sonraí Saincheapthaar fáil le haghaidh iarratais taighde éagsúla.
●Anailís Chomhpháirteach Roghnach le Seicheamhú mRNA Aoncheallach
Sonraíochtaí
| Riachtanais Shamplacha | Leabharlann | Straitéis seicheamhúcháin | Sonraí molta | Rialú Cáilíochta |
| Samplaí crió leabaithe in OCT (Trastomhas is fearr: thart ar 6x6x6 mm³) 2 bhloc in aghaidh an tsampla | Leabharlann cDNA 10X Visium | Illumina PE150 | 50K léamh PE in aghaidh an phointe (60GB) | RIN > 7 |
Chun tuilleadh sonraí a fháil faoi threoir ullmhúcháin samplaí agus sreabhadh oibre seirbhíse, bíodh leisce ort labhairt leSaineolaí BMKGENE
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
I gcéim ullmhúcháin an tsampla, déantar triail eastósctha RNA mórchóir tosaigh chun a chinntiú gur féidir RNA ardchaighdeáin a fháil. I gcéim optamaithe an fhíocháin, déantar na codanna a dhaiteadh agus a léirshamhlú agus déantar na coinníollacha tréscaoilteachta le haghaidh scaoileadh mRNA ón bhfíochán a optamú. Cuirtear an prótacal optamaithe i bhfeidhm ansin le linn thógáil na leabharlainne, agus ina dhiaidh sin déantar seicheamhú agus anailís sonraí.
Baineann nuashonruithe fíor-ama agus dearbhuithe cliant leis an sreabhadh oibre seirbhíse iomlán chun lúb aiseolais freagrúil a choinneáil, rud a chinntíonn cur i gcrích réidh an tionscadail.
Áirítear an anailís seo a leanas:
Rialú Cáilíochta Sonraí:
o Aschur sonraí agus dáileadh scór cáilíochta
Brath géine in aghaidh an spota
o Clúdach fíocháin
Anailís ar an sampla istigh:
o Saibhreas géine
o Braisliú spota, lena n-áirítear anailís ar thoise laghdaithe
o Anailís ar léiriú difreálach idir braislí: sainaithint géinte marcóra
o Anótáil fheidhmiúil agus saibhriú géinte marcóra
Anailís Idirghrúpa
o Ath-chomhcheangal spotaí ó na samplaí araon (m.sh. breoite agus rialaithe) agus ath-chnuasaigh
o Aitheantas géinte marcóra do gach braisle
o Anótáil fheidhmiúil agus saibhriú géinte marcóra
o Léiriú Difreálach an chnuasaigh chéanna idir grúpaí
Anailís Inmheánach-Shampla
Braisliú spota
Aitheantas géinte marcóra agus dáileadh spásúil
Anailís Idirghrúpa
Comhcheangal sonraí ón dá ghrúpa agus ón athchnuasach
Géinte marcóirí braislí nua
Scrúdaigh na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhís trascríopómaíochta spásúla BMKGene le 10X Visium Sna foilseacháin seo a leanas:
Chen, D. et al. (2023) 'tá baint ag mthl1, homalog féideartha Drosophila de GPCRanna greamaitheachta mamaigh, le frithghníomhartha frith-meall ar chealla oncogenic insteallta i gcuileoga',Imeachtaí Acadamh Náisiúnta na nEolaíochtaí de chuid Stáit Aontaithe Mheiriceá, 120(30), lch. e2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
Chen, Y. et al. (2023) 'Cumasaíonn STEEL sonraí trascríopómacha spásama a shainiú go hardtaifeach',Achoimrí sa Bhithfhaisnéisíocht, 24(2), lgh 1–10. doi: 10.1093/BIB/BBAD068.
Liu, C. et al. (2022) 'Atlas spásama agus ama ar orgánaiginéis i bhforbairt bláthanna magairlíní',Taighde ar Aigéid Núicléacha, 50(17), lgh. 9724–9737. doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
Wang, J. et al. (2023) 'Nochtann Comhtháthú Tras-scríbhneoireachta Spásúla agus Seicheamhú RNA Núicléas Aonair na Straitéisí Teiripeacha Féideartha le haghaidh Leiomyoma Útarach',Iris Idirnáisiúnta na nEolaíochtaí Bitheolaíocha, 19(8), lgh. 2515–2530. doi: 10.7150/IJBS.83510.
