Seicheamhú Aimplicon 16S/18S/ITS-PacBio
Gnéithe Seirbhíse
● Ardán seicheamhúcháin: PacBio Revio
● Mód seicheamhaithe: CCS (léamha HiFi)
● Aimpliú an réigiúin sprice agus ansin nascadh tandem na n-aimplicón roimh ullmhú leabharlann cloigíní HiFi SMRT
Buntáistí Seirbhíse
●Rún tacsanomaíoch níos airde: Tseicheamhú gearr-aimplicon han,rud a chuireann rátaí aicmithe OTU níos airde ar chumas ag leibhéal an speicis.
●Glaonna bonn an-chruinnSeicheamhú mód CCS PacBio (léamha HiFi).
●Saor ó aonrúAitheantas tapa ar chomhdhéanamh miocróbach i samplaí comhshaoil.
●Infheidhme go forleathanStaidéir éagsúla ar phobail mhiocróbacha.
●Anailís bhithfhaisnéiseach chuimsitheachAn pacáiste QIIME2 is déanaí (léargas cainníochtúil ar éiceolaíocht mhiocróbach) le hanailísí éagsúla i dtéarmaí bunachar sonraí, anótála, OTU/ASV.
●Saineolas fairsingLe mílte tionscadal seicheamhúcháin aimplicon á reáchtáil gach bliain, tugann BMKGENE breis agus deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ard-oilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
Sonraíochtaí Seirbhíse
| Leabharlann | Straitéis Seicheamhúcháin | Sonraí molta |
| Amplicon | PacBio Revio | 10/30/50K clibeanna (CCS) |
Riachtanais Shamplacha
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) | Toirt (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Seachadadh Samplach Molta
Reoigh na samplaí i nítrigin leachtach ar feadh 3-4 uair an chloig agus stóráil i nítrigin leachtach nó ag -80 céim le haghaidh coimeád fadtéarmach. Tá gá le hoighear tirim a sheoladh leis na samplaí.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear an anailís seo a leanas:
● Rialú cáilíochta sonraí amh
● Braisliú/Dí-thorann OTU (ASV)
●Anótáil OTU
●Anailís éagsúlachta alfa: ilinnéacsanna, lena n-áirítear Shannon, Simpson agus ACE.
●Anailís éagsúlachta béite
● Anailís idirghrúpa
●Anailís chomhghaolmhaireachta: idir fachtóirí comhshaoil agus comhdhéanamh agus éagsúlacht OUT
● Réamhaisnéis géine feidhmiúil 16S
Histogram den dáileadh tacsanomaíoch
Crann fileagineach dáilte pobail
Anailís éagsúlachta alfa: ACE
innéacs
Anailís éagsúlachta béite: PCoA
Anailís idirghrúpa: ANOVA
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí seicheamhú aimplicon BMKGene le PacBio trí bhailiúchán coimeádta foilseachán.
Gao, X. agus Wang, H. (2023) 'Anailís Chomparáideach ar Phróifílí agus Feidhmeanna Baictéaracha an Rúmain le linn Oiriúnú do Fhéineolaíocht Dhifriúil (Athghlas vs. Féarach) i gCaoirigh Merino Alpach le Dhá Chéim Fáis ar Mhóinéar Alpach', Coipeadh, 9(1), lch. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) 'Ag gabháil an ábhair dhorcha mhiocróbaigh in ithreacha fásaigh ag baint úsáide as meitigéineamaíocht bunaithe ar chultúrómaíocht agus anailís ardtaifigh', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), lgh 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'Éifeachtaí salainn aigéid shailleacha ar shaintréithe coipeadh, éagsúlacht baictéarach agus cobhsaíocht aeróbach siláis mheasctha ullmhaithe le halfalfa, tuí ríse agus bran cruithneachta', Journal of the Science of Food and Agriculture, 102(4), lgh 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) 'An tIdirghníomhaíocht idir Bithmharcóirí Struis Ocsaídiúcháin agus Micribhithe Guta in Éifeachtaí Frithocsaídeacha Sleachta ó Sonchus brachyotus DC. i Struis Ocsaídiúcháin Intestinal Spreagtha ag Oxazolone in Éisc Séabra Fásta', Frithocsaídeoirí 2023, Imleabhar 12, Leathanach 192, 12(1), lch. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
