● Le dhá rogha féideartha le roghnú astu ag brath ar an méid iomláine géanóim atá ag teastáil.
● Rogha Dréachta Géanóim: Seicheamhú gearrléite le Illumina NovaSeq PE150.
● Géanóm iomlán 0 bearna.
● Seicheamhú fadléithe ar Nanopore PromethION 48 nó PacBio Revio le haghaidh tionól an ghéanóim.
● Seicheamhú gearrléite ar Illumina NovaSeq le haghaidh bailíochtú géanóim agus ceartú earráide (Nanopore) nó chun dréacht-géanóim a ghiniúint.
●Ráthaíocht ar Ghéanóm Gan BhearnaTá sé seo mar gheall ar chomhtháthú seicheamhú Illumina le seicheamhú léitheoireachta fada (Nanopore nó PacBio).
●Sreabhadh Oibre Bithfhaisnéise Iomlán:Áirítear leis seo tionól géanóim agus tuar il-eilimintí géanómacha, anótáil géine feidhmiúla, agus léirshamhlú géanóim amhail plota Circos.
●Saineolas fairsingLe breis is 20,000 géanóm miocróbach bailithe le chéile, tugann BMKGENE breis is deich mbliana de thaithí, foireann anailíse ard-oilte, ábhar cuimsitheach, agus tacaíocht iar-díolacháin den scoth.
●Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú tionscadail le tréimhse seirbhíse iar-díola 3 mhí. Le linn an ama seo, cuirimid obair leantach tionscadail, cúnamh le fabhtcheartú, agus seisiúin C&F ar fáil chun aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí a fhreagairt.
●Straitéisí Il-Sheicheamhúcháin atá ar Fáil:Le haghaidh spriocanna taighde agus riachtanais éagsúla maidir le hiomláine an ghéanóim.
| Seirbhís | Straitéis Seicheamhúcháin |
| Dréacht-Ghéanóm | Illumina PE150 100x |
| 0 Géanóm Bearna | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (roghnach) |
| Tiúchan (ng/µL) | Méid iomlán (µg) | Toirt (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Baictéir: ≥3.5x1010 cealla
Áirítear an anailís seo a leanas:
● Rialú Cáilíochta Sonraí Seicheamhúcháin
● Tionól Géanóim
● Anailís ar Chomhpháirteanna Géanóim: Réamhaisnéis ar CDS agus ar ilghnéithe géanómacha
● Anótáil fheidhmiúil le bunachair shonraí ginearálta iolracha (GO, KEGG, srl.) agus bunachair shonraí ardleibhéil (CARD, VFDB, srl.)
● Amharcléiriú Géanóim
Cuirimid an géanóm ar fáil i bhformáid fasta atá inrochtana go héasca agus an comhad anótála an géanóim (gff).
Anótáil géine – GO
Anótáil géine – carbaihiodráití CAZY
Amharcléiriú géanóim – plota Circos
Scrúdaigh na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí tionóil géanóm baictéarach BMKGene trí bhailiúchán coimeádta foilseachán.
Dai, W. et al. (2023) 'Fionnachtain Bacteroides uniformis F18-22 mar Bhaictéar Próibhitheach Sábháilte agus Nua le haghaidh Cóireáil Colitis Ulcerative ó Dhroichead Daonna Sláintiúil',Iris Idirnáisiúnta na nEolaíochtaí Móilíneacha, 24(19), lch. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Earrthóga Proteus mirabilis atá frithsheasmhach in aghaidh ildhrugaí a iompraíonn blaOXA-1 agus blaNDM-1 ó fhiadhúlra sa tSín: riosca sláinte poiblí méadaitheach',Zó-eolaíocht Chomhtháite, 16(6), lgh. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Nochtann seicheamh iomlán géanóim an endofíte Bacillus flexus KLBMP 4941 a mheicníocht chun fás plandaí a chur chun cinn agus a bhunús géiniteach le haghaidh lamháltais salainn',Iris na Biteicneolaíochta, 260, lgh 38–41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Plasmidí Klebsiella atá Frithsheasmhach in aghaidh Il-Phróipicíní a Idirghabhálann Scaipeadh Fairsing Géinte Frithmhiocróbach',Teorainneacha sa Mhicribhitheolaíocht, 12, lch. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.