seicheamhú circRNA-Illumina
Gnéithe
● ídiú rRNA agus ullmhúchán treo-leabharlainne ina dhiaidh sin, rud a chumasaíonn seicheamhú sonraí a bhaineann go sonrach le snáitheanna.
● Cumasaíonn sreabhadh oibre bithfhaisnéiseach tuar circRNA agus cainníochtú slonn
Buntáistí Seirbhíse
●Leabharlanna RNA níos cuimsithí:úsáidimid ídiú rRNA in ionad ídiú líneach RNA inár n-ullmhú réamhleabharlainne, ag cinntiú go n-áirítear ní hamháin circRNA ach freisin mRNA agus lncRNA sna sonraí seicheamhaithe, rud a chumasaíonn anailís chomhpháirteach ar na tacair sonraí seo
●Anailís roghnach ar líonraí iomaíocha RNA endogenous (ceRNA).: léargais níos doimhne a sholáthar ar mheicníochtaí rialála cealla
●Saineolas Fairsing: le cuntas teiste de phróiseáil níos mó ná 20,000 sampla ag BMK, a chuimsíonn cineálacha éagsúla samplaí agus tionscadail lncRNA, tugann ár bhfoireann saibhreas taithí do gach tionscadal.
●Rialú Cáilíochta dian: cuirimid croíphointí rialaithe i bhfeidhm thar gach céim, ó ullmhú samplach agus leabharlainne go seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht.Cinntíonn an mhonatóireacht mhionsonraithe seo go seachadtar torthaí ar ardchaighdeán go seasta.
● Tacaíocht Iar-Dhíolacháin: Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú an tionscadail le tréimhse seirbhíse 3 mhí tar éis an díola.Le linn an ama seo, cuirimid gníomhaíochtaí leantacha tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin ceisteanna agus freagraí ar fáil chun dul i ngleic le haon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.
Riachtanais Samplacha agus Seachadadh
| Leabharlann | Ardán | Sonraí molta | Sonraí QC |
| Polai A saibhrithe | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Riachtanais Shamplacha:
Núicléatídí:
| Conc.(ng/μl) | Méid (μg) | Íonachta | Ionracas |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Éilliú próitéine nó DNA teoranta nó gan aon a thaispeáint ar fhoirmiú. | Do phlandaí: RIN≥6.5; I gcás ainmhithe: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ingearchló bunlíne teoranta nó gan aon |
● Plandaí:
Fréamh, Gas nó Peitil: 450 mg
Duille nó Síl: 300 mg
Torthaí: 1,2 g
● Ainmhí:
Croí nó Stéig: 450 mg
Viscera nó Inchinn: 240 mg
Matán: 600 mg
Cnámha, Gruaig nó Craiceann: 1.5g
● Artrapóid:
Feithidí: 9g
Crústaigh: 450 mg
● Fuil iomlán:2 feadáin
● Cealla: 106 cealla
● Séiream agus Plasma: 6 ml
Seachadadh Samplach Molta
Coimeádán: feadán lártheifneoir 2 ml (Ní mholtar scragall stáin)
Lipéadú samplach: Grúpa+ a mhacasamhlú m.sh. A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Loingsiú:
1. Oighear tirim: Ní mór samplaí a phacáil i málaí agus a chur faoi oighear tirim.
2. Feadáin RNAstable: Is féidir samplaí RNA a thriomú i bhfeadán cobhsaíochta RNA (m.sh. RNAstable®) agus a sheoladh i dteocht an tseomra.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Dearadh turgnaimh
Seachadadh samplach
eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Bithfhaisnéisíocht
tuar circRNA: dáileadh crómasómach
Ciorcail a chuirtear in iúl go difreálach – plota bolcáin
circRNAs sainithe go difreálach – cnuasú ordlathach
Saibhriú feidhmiúil géinte óstach circRNA
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn taighde arna éascú ag seirbhísí seicheamhaithe circRNA BMKGene trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán.
Wang, X. et al.(2021) 'Rialaíonn CPSF4 foirmiú circRNA agus tosta géine idirghabhála microRNA i gcarcanóma hepatocellular', Oncogene 2021 40:25, 40(25), lgh. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Tá Xia, K. et al.(2023) 'Nochtann tras-scríbhinnim X oo-fhreagrach ról an chiorclaigh RNA133 i bhfriotaíocht galair trí léiriú OsARAB i rís a rialú', Phytopathology Research, 5(1), lgh. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al.(2023) 'Modhnaíonn CPSF3 cothromaíocht na dtras-scríbhinní ciorclach agus líneacha sa charcanóma hepatocellular'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Meastóireacht chuimsitheach ar circRNAs i gcáirdiomyopathy cirrhotic roimh agus tar éis trasphlandú ae', Immunopharmacology Idirnáisiúnta, 114, lch.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
