Seicheamhú CircRNA-Illumina
Gnéithe
● ídiú rRNA agus ullmhú leabharlainne threorach ina dhiaidh sin, rud a chuireann ar chumas sonraí seicheamhaithe snáithe-shonracha.
● Cumasaíonn sreabhadh oibre bithfhaisnéise réamhaisnéis circRNA agus cainníochtú léirithe.
Buntáistí Seirbhíse
●Saineolas fairsingTá breis is 20,000 sampla próiseáilte againn, a chlúdaíonn cineálacha éagsúla samplaí, agus tugann muid an saineolas fairsing seo do gach tionscadal.
●Rialú Cáilíochta DianCuirimid pointí rialaithe lárnacha i bhfeidhm i ngach céim, ó ullmhú samplaí go hullmhú leabharlainne, seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht. Cinntíonn ár monatóireacht mhionsonraithe go seachadtar torthaí ardchaighdeáin i gcónaí.
●Leabharlanna RNA níos cuimsithí:Úsáidimid ídiú rRNA in ionad ídiú líneach RNA inár n-ullmhúchán réamhleabharlainne, rud a chinntíonn go n-áirítear sna sonraí seicheamhaithe ní hamháin circRNA ach mRNA agus lncRNA freisin, rud a chuireann ar chumas anailís chomhpháirteach a dhéanamh ar na tacair sonraí seo.
●Anailís Roghnach ar Líonraí RNA Intíreach Iomaíoch (ceRNA)Léargas níos doimhne a thabhairt ar mheicníochtaí rialála ceallacha.
● Tacaíocht Iar-DhíolacháinTuigimid cé chomh tábhachtach is atá sé a bheith i láthair, agus sin an fáth a síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú tionscadail le tréimhse seirbhíse iar-díola 3 mhí. Le linn an ama seo, cuirimid obair leantach tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin C&F ar fáil chun aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí a fhreagairt.
Riachtanais Shamplacha agus Seachadadh
| Leabharlann | Ardán | Sonraí molta | QC Sonraí |
| Leabharlann threorach ídithe rRNA | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Riachtanais Shamplacha:
Núicléatídí:
| Tiúchan (ng/μl) | Méid (μg) | Íonacht | Ionracas |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Éilliú próitéine nó DNA teoranta nó gan aon éilliú ar bith le feiceáil ar an glóthach. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; airde bonnlíne teoranta nó gan aon airde bunlíne |
● Plandaí:
Fréamh, Gas nó Peitil: 450 mg
Duilleog nó Síol: 300 mg
Torthaí: 1.2 g
● Ainmhí:
Croí nó Stéig: 450 mg
Intinn nó Inchinn: 240 mg
Matán: 600 mg
Cnámha, Gruaig nó Craiceann: 1.5g
● Artrapóid:
Feithidí: 9g
Crústaigh: 450 mg
● Fuil iomlán:2 fheadán
● Cealla: 106 cealla
● Séiream agus Plasma: 6 ml
Seachadadh Samplach Molta
Coimeádán: feadán lártheifneoir 2 ml (Ní mholtar scragall stáin)
Lipéadú samplach: Grúpáil+macasamhail m.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Loingsiú:
1. Oighear tirim: Ní mór samplaí a phacáil i málaí agus a adhlacadh in oighear tirim.
2. Feadáin RNAstable: Is féidir samplaí RNA a thriomú i bhfeadán cobhsaíochta RNA (m.sh., RNAstable®) agus a sheoladh ag teocht an tseomra.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Dearadh turgnaimh
Seachadadh samplach
Eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Bithfhaisnéisíocht
- QC Sonraí
- Ailíniú an ghéanóim
- Aitheantas CircRNA
- Léiriú CircRNA
- Anailís léirithe difreálach
réamhaisnéis circRNA: dáileadh crómasómach
circRNAs atá Léirithe go Difreálach – Plota Bolcáin
circRNAanna atá léirithe go difriúil – braisliú ordlathach
Saibhriú feidhmiúil géinte óstacha circRNA
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn taighde atá éascaithe ag seirbhísí seicheamhúcháin circRNA BMKGene trí bhailiúchán coimeádta foilseachán.
Wang, X. et al. (2021) 'Rialaíonn CPSF4 foirmiú circRNA agus tostú géine trí mhicriRNA i gcarcanóma heipiteacheallach',Oncogene2021 40:25, 40(25), lgh 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'Nochtann transcriptóm atá freagrúil do X oo ról an RNA133 chiorclaigh i bhfriotaíocht galair trí léiriú OsARAB i ríse a rialáil',Taighde Fíteapaiteolaíochta, 5(1), lgh 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al. (2023) 'Modhnaíonn CPSF3 cothromaíocht na dtrascríbhinní ciorclacha agus líneacha i gcarcanóma heipiteacheallach'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Meastóireacht chuimsitheach ar circRNAs i gcairdimiapaite cioróiseach roimh agus tar éis trasphlandú ae',Imdhíon-chógaseolaíocht Idirnáisiúnta, 114, lch. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
