BMKCloud Log in
条形meirge-03

Táirgí

Seicheamhú DNA/RNA -Seicheamhóir PacBio

Is ardán seicheamhaithe fad-léite é ardán seicheamhaithe PacBio, ar a dtugtar freisin mar cheann de na teicneolaíochtaí Seicheamhú Tríú Glúin (TGS).Cumasaíonn an croítheicneolaíocht, fíor-ama aonmhóilín (SMRT), giniúint léamha a bhfuil na mílte cile-bonn acu.Ar bhonn “Seicheamh-ar-Sintéise”, baintear taifeach aonair núicléitíde amach trí thonnthreoir nialasmhóid (ZMW), áit nach bhfuil ach méid teoranta ag an mbun (suíomh shintéise móilíní) soilsithe.Ina theannta sin, seachnaíonn seicheamhú SMRT den chuid is mó claonadh seicheamh-shonrach i gcóras NGS, sa mhéid nach bhfuil an chuid is mó de na céimeanna aimplithe PCR ag teastáil i bpróiseas tógála na leabharlainne.

 

Ardán: Sequel II, Revio


Sonraí Seirbhíse

Torthaí Taispeána

Gnéithe

Dhá mhodh seicheamhaithe ar an seicheamhóir PacBio: Léamh Fada Leantach (CLR) agus Léamh Comhthola Ciorclach (CCS)

Mód Seicheamhaithe Méid na Leabharlainne Sonraí TeoiriciúlaToradh (In aghaidh na Cille) Aonair-bonnCruinneas Feidhmchláir
CLR 20Kb, 30Kb, etc. 80 Gb go 130 Gb Thart.85% De nua, SV ag glaoch, etc.
CCS 15-20 Kb

14 go 40 Gb/Cill (Sequel II)

70 go 110 Gb/Cill (Revio)

Ag brath ar na samplaí

Thart.99% De nua, glaoch SNP/Indel/SV, Iso-Seq,

Comparáid idir feidhmíocht agus gnéithe Revio agus Sequel II

Téarmaí

Córas sequel II

Córas Revio

Méadú

Dlús níos airde

8 milliún ZMW

25 milliún ZMW

3x

Céimeanna neamhspleácha

1

4

4x

Amanna rite níos giorra

30 uair

24 uair an chloig

1.25x

Géanóim daonna 30X HiFi / bliain

88

1,300

15x san iomlán

Buntáistí Seirbhíse

● Níos mó ná 8 mbliana taithí ar ardán seicheamhaithe PacBio leis na mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.

● Feistithe go hiomlán leis na hardáin Seicheamhú PacBio is déanaí, Revio chun tréchur seicheamhaithe leordhóthanach a ráthú.

● Aga slánúcháin níos tapúla, toradh sonraí níos airde agus sonraí níos cruinne.

● Chuir sé leis na céadta foilseachán ardtionchair bunaithe ar PacBio.

Riachtanais Shamplacha


Cineál Samplach Méid Tiúchan (Qubit®) Toirt Íonachta Daoine eile
DNA genomic Ag brath ar Riachtanas Sonraí ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5;
Buaic glan ag 260 nm,aon éillithe
Ní mór an tiúchan a thomhas le Qubit agus Qubit/Nanopore = 0.8-2.5
RNA iomlán ≥1.2μg ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5;aon éillithe

Luach RIN ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

Sreabhadh Oibre Seirbhíse

ullmhú samplach

Ullmhúchán samplach

Ullmhúchán Leabharlainne

Tógáil leabharlainne

Seicheamhú

Seicheamhú

Anailís sonraí

Anailís sonraí

QC Samplach

Seachadadh tionscadail


  • Roimhe Seo:
  • Ar Aghaidh:

  • 1.In-tí Táirgeacht Sonraí

    Sonraí ginte ó 63 cealla CCS (ó 26 speiceas)

    SONRAÍ-PacBio-CCS-15 Kb Meán uas Min Airmheánach
    Toradh - foléamh (Gb) 421.12 544.27 221.38 426.58
    Tarlaithe - CCS(Gb) 25.93 38.59 10.86 25.43
    Polaiméaráis N50 145,651 175,430 118,118 144,689
    Fo-léamh N50 17,509 23,924 12,485 17,584
    CCS N50 14,490 19,034 9,876 14,747
    Meánfhad-Polymerase 67,995 89,379 49,664 66,433
    Meánfhad-Subreads 15,866 21,036 11,657 16,012
    Meánfhad-CCS 14,489 19,074 8,575 14,655

    Sonraí ginte ó 16 cill CLR (ó 76 speiceas)

    SONRAÍ-PacBio-CLR-30Kb Meán uas Min Airmheánach
    Toradh - foléamh (Gb) 142.20 291.40 50.55 142.49
    Polaiméaráis N50 39,456 121,191 15,389 35,231
    Fo-léamh N50 28,490 41,012 14,430 29,063
    Meánfhad-Polymerase 22,063 48,886 8,747 21,555
    Meánfhad-Subreads 17,720 27,225 8,293 17,779

    2.Data QC – TaispeántasStaitisticí ar thorthaí sonraí

    Sampla

    ccs Léann Uimh

    Bunanna Iomlán ccs (bp)

    ccs Léann N50 (bp)

    ccs Meánfhad (bp)

    ccs léamh is faide (bp)

    fo-léamh Bunanna (bp)

    ráta ccs(%)

    PB_BMKxxx

    3,444,159

    54,164,122,586

    15,728

    15,726

    36,110

    863,326,330,465

    6.27

     

    fháil ceanglófar

    Scríobh do theachtaireacht anseo agus seol chugainn é

    Seol do theachtaireacht chugainn: