Leabharlanna réamhdhéanta Illumina
Gnéithe
●Ardáin:Illumina NovaSeq 6000 agus NovaSeq X Plus
●Modhanna seicheamhúcháin:PE150 agus PE250
●Rialú cáilíochta leabharlanna roimh sheicheamhú
●Sonraí seicheamhaithe QC agus seachadadh:seachadadh tuarascáil QC agus sonraí amha i bhformáid fastq tar éis léamha Q30 a dhí-ilphléacsáil agus a scagadh
Buntáistí Seirbhíse
●Ilúsáideacht seirbhísí Seicheamhaithe:féadfaidh an custaiméir a roghnú seicheamhú de réir lána, cille sreafa, nó de réir mhéid sonraí a theastaíonn (seicheamhú páirteach lána).
●Taithí fhairsing ar ardán seicheamhúcháin Illumina:le mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.
●Seachadadh tuarascáil QC seicheamhaithe:le méadrachtaí cáilíochta, cruinneas sonraí agus feidhmíocht fhoriomlán an tionscadail seicheamhaithe.
●Próiseas seicheamhaithe aibí:le ham gearr-iompaithe.
●Rialú Cáilíochta DianCuirimid ceanglais dhian maidir le cáilíocht cáilíochta i bhfeidhm chun a ráthú go seachadfar torthaí ardchaighdeáin i gcónaí.
Ardáin Shamplacha
| Ardán | Ceall Sreafa | Mód seicheamhúcháin | Aonad | Aschur measta |
| NovaSeq X | 10B (8 lána) | PE150 | Lána Aonair Lána Páirteach | 375Gb / Lána |
| 25B (8 lána) | PE150 | Lána Aonair Lána Páirteach | 1000 Gb/Lána | |
| NovaSeq 6000 | Ceall Sreafa SP (2 lána) | PE250 | Ceall Sreafa Lána Aonair Lána Páirteach | 325-400 M léamh / Lána |
| Ceall sreabhadh S4 (4 lána) | PE150 | Ceall Sreafa Lána Aonair Lána Páirteach | ~800 Gb / Lána |
Riachtanais Shamplacha
| Méid Sonraí (X) | Tiúchan (qPCR/nM) | Imleabhar | |
| Seicheamhú Lána Páirteach
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Seicheamhú Lána | In aghaidh an Lána | ≥ 1.5 nM / Linn Leabharlainne | ≥ 25 μl / Linn Leabharlainne |
Chomh maith le tiúchan agus méid iomlán, tá patrún buaic oiriúnach ag teastáil freisin.
Nóta: Éilíonn seicheamhú lána leabharlanna íseal-éagsúlachta spící isteach PhiX chun glao bonn láidir a chinntiú.
Molaimid leabharlanna réamh-chomhthiomsaithe a chur isteach mar shamplaí. Más gá duit go ndéanfaidh BMKGENE comhthiomsú leabharlainne, féach le do thoil ar
na ceanglais leabharlainne maidir le seicheamhú lána páirteach.
Méid na Leabharlainne (Léarscáil Buaic)
Ba chóir go mbeadh an príomhbhuaic idir 300-450 bp.
Ba chóir go mbeadh buaic amháin ag leabharlanna, gan aon éilliú oiriúnaitheora agus gan aon déméirí tosaitheora.
Téigh i dteagmháil linn mura gcomhlíonann do shamplaí na ceanglais maidir le hábhair tosaigh.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Rialú cáilíochta leabharlainne
Seicheamhú
Rialú cáilíochta sonraí
Seachadadh tionscadail
Tuarascáil QC na Leabharlainne
Cuirtear tuarascáil ar cháilíocht na leabharlainne ar fáil sula ndéantar seicheamhú, measúnú ar mhéid na leabharlainne, agus ilroinnt.
Tuarascáil QC Seicheamhaithe
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí seicheamhaithe.
| Aitheantas samplach | BMKID | Léamha amh | Sonraí Amha (bp) | Léamha glana (%) | C20(%) | C30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Fíor 1. Dáileadh cáilíochta feadh léamha i ngach sampla
Fíor 2. Dáileadh ábhair bhunúsaigh
Fíor 3. Dáileadh ábhar léite i sonraí seicheamhaithe
