Géineolaíocht Éabhlóideach
Buntáistí Seirbhíse
Takagi et al.,An iris plandaí, 2013
●Anailís bhithfhaisnéiseach chuimsitheach:rud a chuireann ar chumas meastachán a dhéanamh ar éagsúlacht ghéiniteach, rud a léiríonn acmhainneacht éabhlóideach speiceas, agus a nochtann caidreamh fíliginéiteach iontaofa idir speicis le tionchar íoslaghdaithe éabhlóide comhtháite agus éabhlóide comhthreomhar
●Anailís saincheaptha roghnachamhail meastachán ar am agus luas na héagsúlachta bunaithe ar athruithe ag leibhéal núicléatíde agus aimínaigéid.
●Saineolas fairsing agus taifid fhoilsitheoireachtaTá taithí ollmhór bailithe ag BMKGene i dtionscadail ghéineolaíochta daonra agus éabhlóideacha le breis agus 15 bliana, ag clúdach na mílte speiceas, etc. agus ag cur le breis agus 1000 tionscadal ardleibhéil a foilsíodh in Nature Communications, Molecular Plants, Plant Biotechnology Journal, etc.
● Foireann bithfhaisnéisíochta ardcháilithe agus timthriall anailíse gearrLe taithí mhór in anailís gheanómach ardleibhéil, seachadann foireann BMKGene anailísí cuimsitheacha le ham tiontaithe tapa.
● Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú tionscadail le tréimhse seirbhíse iar-díola 3 mhí. Le linn an ama seo, cuirimid obair leantach tionscadail, cúnamh le fabhtcheartú, agus seisiúin C&F ar fáil chun aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí a fhreagairt.
Sonraíochtaí agus ceanglais seirbhíse
| Cineál seicheamhúcháin | Scála daonra molta | Straitéis seicheamhúcháin | Riachtanais núicléatíde |
| Seicheamhú Géanóim Iomlán | ≥ 30 duine aonair, agus ≥ 10 duine aonair ó gach foghrúpa
| 10x | Tiúchan: ≥ 1 ng/µL Méid iomlán ≥ 30ng Díghrádú nó éilliú teoranta nó gan aon dhíghrádú nó éilliú |
| Blúir Aimplithe Lócas Sonrach (SLAF) | Doimhneacht an chlib: 10x Líon na gclibeanna: <400 Mb: Moltar WGS <1Gb: 100K clibeanna 1Gb >2Gb: 300K clibeanna Uasmhéid 500k clibeanna | Tiúchan ≥ 5 ng/µL Méid iomlán ≥ 80 ng Nana-bhraon OD260/280=1.6-2.5 Glóthach agaróise: gan aon dhíghrádú nó éilliú nó éilliú teoranta
|
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Dearadh turgnaimh
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Áirítear leis an tseirbhís anailís ar struchtúr an daonra (crann fileaginéiteach, PCA, cairt strátúcháin daonra), éagsúlacht daonra, agus roghnú daonra (neamhchothromaíocht nasctha, rogha roghnach scuabtha suíomhanna buntáisteacha). Is féidir anailís shaincheaptha a áireamh leis an tseirbhís freisin (m.sh. am diallais, sreabhadh géine).
*Is ó ghéanóim a foilsíodh le BMKGENE a thagann na torthaí taispeána a thaispeántar anseo.
1. Tá tógáil crann fíligéiniteach, struchtúr daonra agus PCA bunaithe ar athruithe géiniteacha san anailís éabhlóide.
Léiríonn crann fíligéiniteach caidrimh tacsanomaíocha agus éabhlóideacha i measc speiceas a bhfuil sinsear coiteann acu.
Tá sé mar aidhm ag PCA dlúthchaidreamh idir fo-dhaonraí a léirshamhlú.
Léiríonn struchtúr daonra láithreacht fo-dhaonra atá géiniteach difriúil i dtéarmaí minicíochtaí ailléile.
Chen, et al.,PNAS, 2020
2. Scuabadh roghnach
Tagraíonn scuab roghnach do phróiseas trína roghnaítear suíomh buntáisteach agus trína méadaítear minicíochtaí suíomhanna neodracha nasctha agus trína laghdaítear minicíochtaí suíomhanna neamhnasctha, rud a fhágann laghdú ar réigiúnach.
Déantar braiteadh ar fud an ghéanóim ar réigiúin scuabtha roghnacha a phróiseáil trí innéacs géiniteach daonra (π, Fst, D Tajima) a ríomh de na SNPanna uile laistigh de fhuinneog sleamhnáin (100 Kb) ag céim áirithe (10 Kb).
Éagsúlacht núicléatíde (π)
D Tajima
Innéacs socraithe (Fst)
Wu, et al.,Gléasra Móilíneach, 2018
3. Sreabhadh Géine
Wu, et al.,Gléasra Móilíneach, 2018
4. Stair dhéimeagrafach
Zhang, et al.,Éiceolaíocht agus Éabhlóid an Dúlra, 2021
5. Am difreála
Zhang, et al.,Éiceolaíocht agus Éabhlóid an Dúlra, 2021
Scrúdaigh na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhísí géineolaíochta éabhlóideacha BMKGene trí bhailiúchán coimeádta foilseachán:
Hassanyar, AK et al. (2023) 'Fionnachtain Marcóirí Móilíneacha SNP agus Géinte Iarrthóra a Bhaineann le Frithsheasmhacht in aghaidh Víreas Sacbrood i Larbhaí Apis cerana cerana trí Athsheicheamhú Géanóim Iomláin',Iris idirnáisiúnta na n-eolaíochtaí móilíneacha, 24(7). do: 10.3390/IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) 'Cruthaíonn fionnachtain salamandar ollmhór Síneach fiáin, atá íon ó thaobh géineolaíochta de, deiseanna nua caomhnaithe',Taighde Zó-eolaíochta, 2022, Imleabhar 43, Eagrán 3, Leathanaigh: 469-480, 43(3), lgh 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) 'Patrún Fíligheografach agus Stair Éabhlóid Daonra an Elymus sibiricus L. Dúchasach ar Ardchlár Qinghai-Tibéidis',Teorainneacha san Eolaíocht Plandaí, 13, lch. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
Wang, J. et al. (2022) 'Léargais ghéanómacha ar éabhlóid longan ó thionól ghéanóm ar leibhéal crómasóim agus géanómaíocht dhaonra gabháltais longan',Taighde Gairneoireachta, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
