Tionól Genome bunaithe ar Hi-C
Is modh é HI-C atá deartha chun cumraíocht crómasóim a ghabháil trí idirghníomhaíochtaí atá bunaithe ar ghaireacht agus seicheamhú ard-tréchuir a chomhcheangal. Creidtear go bhfuil déine na n -idirghníomhaíochtaí seo comhghaolaithe go diúltach le fad fisiciúil ar chrómasóim. Dá bhrí sin, baintear úsáid as sonraí Hi-C chun treorú, ordú, agus treoshuíomh seichimh chóimeáilte a threorú i ndréacht-ghéanóm agus iad siúd a dhaingniú ar líon áirithe crómasóim. Tugann an teicneolaíocht seo cumhacht do thionól géanóm ar leibhéal crómasóim in éagmais léarscáil ghéiniteach bunaithe ar dhaonra. Teastaíonn Hi-C ó gach géanóm amháin.
Gnéithe seirbhíse
● Seicheamhú ar Illumina Novaseq le PE150.
● Éilíonn an tseirbhís samplaí fíochán, in ionad aigéid núicléasacha eastósctha, chun tras-nascadh le formaildéad agus na hidirghníomhaíochtaí DNA-próitéin a chaomhnú.
● Is éard atá i gceist leis an turgnamh Hi-C ná srianadh agus deisiú deireadh na gcríoch ghreamaitheach le biotin, agus ina dhiaidh sin ciorclánú na gcríoch mhaol a leanann agus na hidirghníomhaíochtaí a chaomhnú. Tarraingítear an DNA ansin le coirníní streptavidin agus íonaítear é le haghaidh ullmhú na leabharlainne ina dhiaidh sin.
Buntáistí Seirbhíse
Forbhreathnú ar Hi-C
(Lieberman-Aiden E et al.,Eolaíocht, 2009)
●Deireadh a chur leis an ngá atá le sonraí daonra géinití:Cuireann Hi-C an t-eolas riachtanach a theastaíonn chun conradh a chur in ionad.
●Dlús ard marcóra:as a dtiocfaidh cóimheas ard ancaire os cionn 90%.
●Saineolas fairsing agus taifid foilsithe:Tá taithí ollmhór ag BMKGene le níos mó ná 2000 cás de thionól géanóm Hi-C ó 1000 speiceas éagsúil agus paitinní éagsúla. Tá fachtóir tionchair carnach os cionn 2000 ag breis agus 200 cás foilsithe.
●Foireann Bithfhaisnéisíochta ardoilte:Le paitinní intí agus cóipchearta bogearraí le haghaidh turgnaimh Hi-C agus anailís sonraí, cuireann na bogearraí sonraí léirshamhlaithe féinfhorbartha ar chumas an bhloc láimhe gluaiseacht, aisiompú, cúlghairm agus athdhéanamh.
●Tacaíocht Iar-Dhíolacháin:Síneann ár dtiomantas thar chríochnú an Tionscadail le tréimhse seirbhíse iar-dhíol 3 mhí. Le linn an ama seo, tairgimid obair leantach tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin Q & A chun aghaidh a thabhairt ar aon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí.
●Nóta cuimsitheach.
Sonraíochtaí seirbhíse
| Ullmhúchán leabharlainne | Straitéis seicheamhaithe | Aschur sonraí molta | Rialú cáilíochta |
| Leabharlann Hi-C | Illumina novaseq PE150 | 100x | C30 ≥ 85% |
Riachtanais samplacha
| Fíochán | An méid riachtanach |
| Ainmhithe VISCERA | ≥ 2 g |
| Matán ainmhithe | |
| Fuil mhamaigh | ≥ 2 ml |
| Fuil Éanlaith/Éisc | |
| Planda- duilleog úr | ≥ 3 g |
| Cealla saothraithe | ≥ 1x107 |
| Míolachán | ≥ 2 g |
Sreabhadh oibre seirbhíse
Dearadh turgnamh
Seachadadh samplach
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís ar shonraí
Seirbhísí tar éis díol
1) Sonraí amh QC
2) Leabharlann Hi-C QC: Idirghníomhaíochtaí bailí Hi-C a mheas
3) Tionól Hi-C: Cnuasú contigs i ngrúpaí, agus contig ag ordú laistigh de gach grúpa agus ag sannadh treoshuíomh contig
4) Meastóireacht Hi-C
Leabharlann Hi-C QC-Meastachán ar Phéirí Idirghníomhaíochta Bailí Hi-C
Tionól Hi-C-Staitisticí
Meastóireacht Iar-Tionóil-Teasacht déine na gcomharthaí idir boscaí bruscair
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn a éascaíonn seirbhísí cóimeála HI-C BMKGENE trí bhailiúchán foilseachán coimeádaithe.
Tian, T. et al. . doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
Wang, Zl et al. (2020) 'Tionól ar scála crómasóim de ghéanóm Apis Cerana na hÁise na hÁise', teorainneacha i ngéineolaíocht, 11, lch. 524140. Doi: 10.3389/fgene.2020.00279/bibtex.
Zhang, F. et al. . doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
Zhang, X. et al. . doi: 10.1016/j.cell.2020.09.043
